More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH1_0050 on replicon NC_009632
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_0050  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
449 aa  925  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2498  cassette chromosome recombinase A  95.32 
 
 
449 aa  882  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0049  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
449 aa  925  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1684  resolvase-like protein  25.94 
 
 
665 aa  134  3e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.560816 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3989  recombinase  25.39 
 
 
613 aa  125  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2827  Resolvase domain protein  27.84 
 
 
509 aa  124  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.952038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2668  resolvase domain-containing protein  27.27 
 
 
445 aa  119  1e-25  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0338  Recombinase  25.82 
 
 
498 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2857  resolvase domain-containing protein  26.24 
 
 
445 aa  115  2e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564499  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0048  resolvase domain-containing protein  26.86 
 
 
542 aa  114  2e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0049  resolvase domain-containing protein  26.86 
 
 
542 aa  114  2e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2617  resolvase domain-containing protein  27.27 
 
 
445 aa  115  2e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0540166  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2499  cassette chromosome recombinase B  26.86 
 
 
542 aa  114  4e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0288  prophage LambdaW1, site-specific recombinase resolvase family protein  24.32 
 
 
500 aa  112  1e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0634  prophage LambdaW5, site-specific recombinase resolvase family protein  26.01 
 
 
489 aa  111  2e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2797  Resolvase domain protein  23.56 
 
 
525 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.501781  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2866  Resolvase domain protein  23.56 
 
 
525 aa  108  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.376058  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0896  site-specific recombinase  25.23 
 
 
527 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0216  resolvase domain-containing protein  26.06 
 
 
517 aa  107  4e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1795  resolvase domain protein  23.87 
 
 
558 aa  107  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1983  resolvase domain-containing protein  24.52 
 
 
546 aa  105  2e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0800721  normal  0.49542 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1227  resolvase domain-containing protein  23.93 
 
 
441 aa  103  7e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.254859 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0859  Resolvase domain  25.19 
 
 
544 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.367879  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2087  recombinase  24.84 
 
 
447 aa  101  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0591459 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3998  resolvase domain-containing protein  25.33 
 
 
521 aa  99.8  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1935  site-specific recombinase  23.26 
 
 
528 aa  98.2  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0592  Resolvase domain protein  25.66 
 
 
462 aa  98.6  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3776  recombinase  23.63 
 
 
528 aa  97.8  3e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.902088  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0886  resolvase domain-containing protein  23.28 
 
 
511 aa  97.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0796  recombinase  25.22 
 
 
421 aa  96.3  9e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0698  recombinase  23.19 
 
 
506 aa  95.9  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  9.98497e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0817  Resolvase domain protein  23.54 
 
 
534 aa  95.5  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1951  resolvase  22.85 
 
 
445 aa  95.5  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.666917  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0958  Resolvase domain protein  24.57 
 
 
537 aa  93.2  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.560129  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0463  Resolvase domain protein  21.35 
 
 
475 aa  93.2  9e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0983248  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0628  Resolvase domain protein  22.79 
 
 
534 aa  91.7  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2926  resolvase domain-containing protein  22.39 
 
 
441 aa  92  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.855729  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1216  Resolvase domain protein  22.59 
 
 
534 aa  92  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.766992  hitchhiker  0.00144818 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3111  Resolvase domain protein  27.76 
 
 
511 aa  92.4  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.229482  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1034  Resolvase domain protein  22.79 
 
 
534 aa  91.7  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0894  Resolvase domain protein  22.79 
 
 
534 aa  91.3  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0706  Resolvase domain protein  22.79 
 
 
534 aa  91.3  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.995743 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2777  recombinase  22.7 
 
 
441 aa  90.9  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0770  Resolvase domain protein  22.59 
 
 
537 aa  91.3  4e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.872914  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0155  resolvase domain-containing protein  23.93 
 
 
510 aa  90.1  7e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0891  putative site-specific integrase/recombinase protein  19.94 
 
 
460 aa  89.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3963  recombinase  25.79 
 
 
493 aa  88.6  2e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.636106  normal  0.385317 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3171  putative site-specific integrase/resolvase protein  22.83 
 
 
462 aa  87.8  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3247  putative site-specific integrase protein  21.86 
 
 
462 aa  87.8  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.964648 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1155  recombinase  23.47 
 
 
343 aa  87.4  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2997  resolvase domain-containing protein  23.67 
 
 
444 aa  87.8  4e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1294  recombinase  23.05 
 
 
475 aa  87.4  5e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0898  resolvase domain-containing protein  24.27 
 
 
586 aa  87  5e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2081  recombinase  21.86 
 
 
441 aa  87  6e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0665131 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1522  resolvase domain-containing protein  26.26 
 
 
568 aa  85.1  2e-15  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.40814  normal  0.455873 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5360  resolvase domain protein  21.74 
 
 
546 aa  85.1  2e-15  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000247289  hitchhiker  1.7806e-10 
 
 
-
 
NC_002936  DET0063  resolvase domain-containing protein  24.58 
 
 
542 aa  85.1  2e-15  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1552  resolvase domain-containing protein  25.07 
 
 
554 aa  84.7  3e-15  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.914203  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2420  site-specific recombinase  21.95 
 
 
479 aa  83.6  7e-15  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.450706 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5553  resolvase domain protein  22.9 
 
 
515 aa  83.2  8e-15  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.91937e-21 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1448  recombinase  22.02 
 
 
467 aa  82  2e-14  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0303  resolvase domain-containing protein  22.95 
 
 
548 aa  82  2e-14  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.637835  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0796  resolvase-like protein  24.57 
 
 
506 aa  82.4  2e-14  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.196824  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2634  prophage LambdaMc01, site-specific recombinase resolvase family protein  24.44 
 
 
459 aa  82  2e-14  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1943  resolvase  22.69 
 
 
443 aa  82  2e-14  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2971  resolvase domain-containing protein  23.47 
 
 
474 aa  81.3  3e-14  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0952966  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1561  resolvase-like protein  26.98 
 
 
546 aa  81.3  3e-14  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.571827 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1449  resolvase-like protein  21.35 
 
 
522 aa  81.3  3e-14  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1608  putative resolvase  28.26 
 
 
502 aa  81.3  3e-14  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2336  resolvase  23 
 
 
532 aa  80.9  4e-14  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.930487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3523  resolvase domain protein  23.62 
 
 
568 aa  80.9  4e-14  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.876485  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5598  DNA recombinase, putative  22.68 
 
 
522 aa  81.3  4e-14  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.318471  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2432  resolvase domain-containing protein  27.27 
 
 
281 aa  80.1  6e-14  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0183379  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3078  Resolvase domain protein  22.44 
 
 
482 aa  80.5  6e-14  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.244166  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0051  site-specific recombinase  23.33 
 
 
513 aa  80.1  7e-14  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.169299  hitchhiker  0.000782563 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0385  recombinase  24.15 
 
 
412 aa  80.1  8e-14  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.691654 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0417  DNA recombinase, putative  27.35 
 
 
520 aa  79.7  1e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5555  integrase  25.19 
 
 
272 aa  79.7  1e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.14894e-26 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1609  recombinase  24.48 
 
 
522 aa  79.7  1e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  4.18639e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0849  cassette chromosome recombinase B  24.3 
 
 
484 aa  79  2e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.73859e-15 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4205  resolvase domain protein  22.98 
 
 
525 aa  78.6  2e-13  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2176  site-specific recombinase, putative  22.54 
 
 
612 aa  77.8  3e-13  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1491  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  23.9 
 
 
506 aa  78.2  3e-13  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0845  DNA recombinase, putative  24.3 
 
 
484 aa  77.4  4e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0428  resolvase domain-containing protein  24.78 
 
 
522 aa  77.4  5e-13  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  1.77151e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2762  cellulose binding, type IV  28.11 
 
 
449 aa  77.4  5e-13  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000724406 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2572  resolvase domain protein  23.3 
 
 
539 aa  77  6e-13  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  32.19 
 
 
184 aa  77  6e-13  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7341  Resolvase domain protein  27.38 
 
 
295 aa  77  7e-13  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2816  Resolvase domain protein  26.94 
 
 
521 aa  76.6  8e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0749793  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0440  Resolvase domain protein  22.6 
 
 
552 aa  76.6  9e-13  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  1.41398e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1738  Resolvase domain  25.59 
 
 
505 aa  75.9  1e-12  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0204025 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1145  recombinase  25.29 
 
 
549 aa  75.9  1e-12  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3232  Resolvase domain protein  23.47 
 
 
474 aa  75.9  1e-12  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4599  DNA recombinase, putative  21.99 
 
 
487 aa  74.7  3e-12  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.136502  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0172  recombinase  28.82 
 
 
545 aa  73.9  5e-12  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  32.88 
 
 
184 aa  73.9  6e-12  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  decreased coverage  5.73211e-05 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0693  resolvase domain protein  22.64 
 
 
606 aa  73.6  7e-12  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.298225  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1776  resolvase domain protein  22.64 
 
 
606 aa  73.6  7e-12  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1701  recombinase  25.78 
 
 
429 aa  73.2  8e-12  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>