66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2176 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2176  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  594  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00706566  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1844  hypothetical protein  64.11 
 
 		 295 aa  377  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1529  hypothetical protein  64.26 
 
 		 295 aa  369  1e-101  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0455905 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3737  hypothetical protein  62.46 
 
 		 290 aa  365  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2085  hypothetical protein  63.33 
 
 		 302 aa  355  5e-97  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.069658 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3103  hypothetical protein  56.57 
 
 		 282 aa  325  8.000000000000001e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.716933  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2716  hypothetical protein  53.05 
 
 		 298 aa  316  2e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00189563 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1284  hypothetical protein  53.41 
 
 		 301 aa  315  8e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218684 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1356  hypothetical protein  52.88 
 
 		 298 aa  315  8e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1239  hypothetical protein  47.06 
 
 		 285 aa  265  5e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2987  hypothetical protein  45.96 
 
 		 294 aa  259  4e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.387576  normal  0.124084 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0195  hypothetical protein  46.1 
 
 		 287 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.342058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0679  hypothetical protein  44.13 
 
 		 287 aa  250  2e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.11701  normal  0.340076 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0988  hypothetical protein  43.37 
 
 		 301 aa  243  3e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3042  hypothetical protein  43.91 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.384395 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2604  hypothetical protein  43.91 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2742  hypothetical protein  43.91 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.5589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2091  hypothetical protein  42.59 
 
 		 276 aa  226  3e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0159  hypothetical protein  41.76 
 
 		 283 aa  223  3e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.233345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4605  hypothetical protein  38.01 
 
 		 294 aa  210  3e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4196  transcriptional regulator  40.22 
 
 		 298 aa  209  5e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0282  hypothetical protein  38.15 
 
 		 283 aa  204  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4284  hypothetical protein  38.6 
 
 		 289 aa  199  3e-50  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6538  hypothetical protein  37.45 
 
 		 268 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0111  hypothetical protein  36.68 
 
 		 326 aa  172  5.999999999999999e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003231  hypothetical protein  36.23 
 
 		 284 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01687  hypothetical protein  34.07 
 
 		 284 aa  162  5.0000000000000005e-39  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2196  hypothetical protein  37.72 
 
 		 296 aa  159  6e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00000000497244  hitchhiker  0.00000469474 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1370  hypothetical protein  34.83 
 
 		 286 aa  155  8e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2063  transcriptional regulator  33.21 
 
 		 290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.754064  normal  0.900722 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2478  hypothetical protein  33.72 
 
 		 285 aa  152  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.452915  normal  0.259065 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2465  hypothetical protein  32.13 
 
 		 298 aa  152  8e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.107107  normal  0.276307 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1262  hypothetical protein  32.96 
 
 		 287 aa  152  8e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4623  transcriptional regulator-like protein  34.31 
 
 		 291 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.2844  decreased coverage  0.00000000441914 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4760  transcriptional regulator  33.94 
 
 		 291 aa  151  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0122  hypothetical protein  32.85 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00864  predicted transcriptional regulator i A1501  32.45 
 
 		 278 aa  147  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2094  hypothetical protein  33.46 
 
 		 303 aa  145  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100358 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0550  transcriptional regulator  33.85 
 
 		 292 aa  142  5e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01226  hypothetical protein  36.7 
 
 		 295 aa  141  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.594173  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3596  hypothetical protein  36.11 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0660  hypothetical protein  34.39 
 
 		 301 aa  139  6e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.125949  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3550  hypothetical protein  30 
 
 		 275 aa  132  6.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.103965 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1781  hypothetical protein  33.33 
 
 		 293 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.294731 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2419  hypothetical protein  36.4 
 
 		 299 aa  126  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.79837  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0913  hypothetical protein  31.43 
 
 		 279 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4208  hypothetical protein  35.27 
 
 		 302 aa  125  6e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1442  hypothetical protein  33.46 
 
 		 304 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.37014  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2014  hypothetical protein  31.27 
 
 		 302 aa  122  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2028  hypothetical protein  33.46 
 
 		 290 aa  118  9e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000322678  normal  0.839611 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0419  hypothetical protein  31.11 
 
 		 294 aa  118  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2140  hypothetical protein  33.71 
 
 		 290 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000023466  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2674  hypothetical protein  31.74 
 
 		 290 aa  116  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00152058  normal  0.0371695 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0112  hypothetical protein  33.33 
 
 		 304 aa  116  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6931  hypothetical protein  31.1 
 
 		 313 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3177  hypothetical protein  31.1 
 
 		 305 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0289  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4812  hypothetical protein  32.1 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3185  transcriptional regulator-like  32.72 
 
 		 254 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6051  hypothetical protein  33.12 
 
 		 280 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04050  hypothetical protein  36.13 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.280957  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_30  hypothetical protein  36.51 
 
 		 96 aa  47.4  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2466  transcriptional regulator protein-like protein  34.78 
 
 		 331 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0245457  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0815  Helix-turn-helix type 11 domain protein  27.54 
 
 		 312 aa  43.9  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.502142  hitchhiker  0.0000272273 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1092  Helix-turn-helix type 11 domain protein  21.93 
 
 		 315 aa  42.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.206539  normal  0.830453 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6729  Helix-turn-helix type 11 domain protein  36.07 
 
 		 324 aa  42.4  0.01  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.41486 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>