56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0054 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0054  disulphide bond formation protein DsbB  100 
 
 		 160 aa  315  1e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0573  disulfide bond formation protein  55.32 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.677166 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2548  disulfide bond formation protein DsbB-like protein  54.55 
 
 		 217 aa  122  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.290105 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1167  disulphide bond formation protein DsbB  43.14 
 
 		 157 aa  108  4.0000000000000004e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.022846 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2929  putative disulfide bond formation protein DsbB  38.46 
 
 		 154 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238011  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1478  disulphide bond formation protein DsbB  43.22 
 
 		 155 aa  82.8  0.000000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.235403  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3844  disulphide bond formation protein DsbB  39.38 
 
 		 162 aa  82  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2347  disulphide bond formation protein DsbB  39.72 
 
 		 175 aa  80.9  0.000000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1095  putative disulfide bond formation protein B (disulfide oxidoreductase) (dsbB)  40.8 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.432529  normal  0.729962 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0758  hypothetical protein  37.41 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1575  disulphide bond formation protein DsbB  40.17 
 
 		 154 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0166322  normal  0.568437 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0326  hypothetical protein  40.29 
 
 		 181 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.574438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0047  disulphide bond formation protein DsbB  41.79 
 
 		 162 aa  75.5  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.902523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1635  disulphide bond formation protein DsbB  38.1 
 
 		 176 aa  75.1  0.0000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0909  disulphide bond formation protein DsbB  38.3 
 
 		 154 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0312891 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0627  hypothetical protein  42.86 
 
 		 188 aa  74.7  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.157929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3023  hypothetical protein  38.36 
 
 		 179 aa  73.9  0.0000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.786001  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3497  disulphide bond formation protein DsbB  37.5 
 
 		 177 aa  72  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00411983  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0738  hypothetical protein  37.21 
 
 		 174 aa  71.6  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0181404  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0340  DsbB family disulfide bond formation protein  31.33 
 
 		 165 aa  69.7  0.00000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00348153  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3497  disulphide bond formation protein DsbB  36.89 
 
 		 190 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0542  disulphide bond formation protein DsbB  38.46 
 
 		 182 aa  68.6  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3866  disulphide bond formation protein DsbB  36.91 
 
 		 164 aa  67.8  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.529294 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3935  disulphide bond formation protein DsbB  32.41 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3597  disulphide bond formation protein DsbB  32.41 
 
 		 170 aa  64.7  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0122638  normal  0.112725 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2493  disulphide bond formation protein DsbB  32.5 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00516878  normal  0.105082 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0874  disulfide bond formation family protein  25.64 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4000  hypothetical protein  33.57 
 
 		 170 aa  62.8  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0739  Disulphide bond formation protein DsbB  38.52 
 
 		 174 aa  61.2  0.000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0700  disulphide bond formation protein DsbB  37.9 
 
 		 171 aa  60.8  0.000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2965  hypothetical protein  35.8 
 
 		 171 aa  60.1  0.00000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3552  hypothetical protein  36.69 
 
 		 171 aa  58.5  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.239069  normal  0.48657 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0726  disulphide bond formation protein DsbB  38.52 
 
 		 170 aa  58.5  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.767254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0499  hypothetical protein  31.76 
 
 		 181 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5956  Disulphide bond formation protein DsbB  37.7 
 
 		 167 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.745885  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0224  disulfide bond formation protein DsbB  24.39 
 
 		 159 aa  53.9  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5213  disulphide bond formation protein DsbB  38.66 
 
 		 178 aa  52  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.361204  normal  0.0308402 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2523  hypothetical protein  31.01 
 
 		 174 aa  50.8  0.000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.580501 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3845  hypothetical protein  36.69 
 
 		 171 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3197  hypothetical protein  31.94 
 
 		 201 aa  48.9  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.700851  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1273  disulfide bond formation protein B, putative  31.85 
 
 		 174 aa  47.4  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2385  disulphide bond formation protein DsbB  31.74 
 
 		 168 aa  46.2  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1590  putative disulfide bond formation protein B  28.68 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.523994  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1642  disulfide bond formation protein B, putative  28.68 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4650  disulfide bond formation protein B  32.61 
 
 		 169 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_002978  WD1099  DsbB family disulfide bond formation protein  27.69 
 
 		 173 aa  45.1  0.0004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0182  DsbB domain-containing protein  28.57 
 
 		 190 aa  44.3  0.0007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1105  hypothetical protein  29.66 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.165888  normal  0.399905 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4377  disulfide bond formation protein B  29.82 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0870  disulphide bond formation protein DsbB  33.33 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2104  disulphide bond formation protein DsbB  30.77 
 
 		 174 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.170796  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1523  Disulphide bond formation protein DsbB  31.06 
 
 		 175 aa  42  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.292193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1140  disulfide bond formation protein B  30.18 
 
 		 169 aa  41.6  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.390731 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0152  disulphide bond formation protein DsbB  27.78 
 
 		 158 aa  41.2  0.007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2556  disulfide bond formation protein B  48 
 
 		 175 aa  40.8  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.885142  normal  0.87532 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1324  disulfide oxidoreductase  28.4 
 
 		 169 aa  40.4  0.009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>