More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4186 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  100 
 
 
611 aa  1227    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  50.58 
 
 
626 aa  589  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  49.33 
 
 
619 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  49.17 
 
 
616 aa  536  1e-151  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  43.07 
 
 
633 aa  443  1e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  43.05 
 
 
595 aa  435  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  45.58 
 
 
500 aa  333  4e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  32.8 
 
 
613 aa  302  1e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  33.61 
 
 
623 aa  300  5e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1719  ABC transporter related  32.14 
 
 
631 aa  297  4e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.737168  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  37.55 
 
 
625 aa  295  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  36.38 
 
 
625 aa  291  3e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  31.67 
 
 
619 aa  288  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  32.78 
 
 
616 aa  287  2.9999999999999996e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  32.14 
 
 
615 aa  284  3.0000000000000004e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  33.39 
 
 
621 aa  283  6.000000000000001e-75  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  31.74 
 
 
614 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  29.9 
 
 
592 aa  276  6e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  30.65 
 
 
611 aa  276  7e-73  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  31.84 
 
 
621 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  32.86 
 
 
618 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  32.59 
 
 
618 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  31.96 
 
 
621 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  31.84 
 
 
621 aa  267  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  32.7 
 
 
618 aa  266  7e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  31.31 
 
 
609 aa  260  4e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  31.13 
 
 
615 aa  259  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  32.3 
 
 
626 aa  256  9e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.59 
 
 
600 aa  256  1.0000000000000001e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  32.07 
 
 
608 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  29.82 
 
 
604 aa  253  7e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  28.9 
 
 
611 aa  250  4e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  32.42 
 
 
606 aa  250  4e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  29.05 
 
 
618 aa  247  4.9999999999999997e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  34.15 
 
 
616 aa  246  9e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  31.25 
 
 
603 aa  244  3e-63  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  28.74 
 
 
605 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  32.3 
 
 
623 aa  243  7e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  34.67 
 
 
599 aa  243  9e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  32.37 
 
 
638 aa  242  2e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.82 
 
 
633 aa  240  5e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  31.01 
 
 
603 aa  239  1e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  33.2 
 
 
626 aa  236  7e-61  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  31.67 
 
 
625 aa  235  2.0000000000000002e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  30.08 
 
 
605 aa  228  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  27.11 
 
 
594 aa  226  7e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  31.12 
 
 
613 aa  226  1e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.41 
 
 
587 aa  225  2e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  32.96 
 
 
662 aa  224  4e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  33.78 
 
 
578 aa  219  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  27.17 
 
 
597 aa  219  1e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  29.87 
 
 
619 aa  218  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  25.91 
 
 
603 aa  217  4e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0028  ABC transporter ATP-binding protein  25.57 
 
 
624 aa  216  9e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.716088  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  28.38 
 
 
619 aa  216  9e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  24.87 
 
 
608 aa  216  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  25.45 
 
 
603 aa  216  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2447  ABC transporter related  35.6 
 
 
647 aa  213  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.12281  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  26.88 
 
 
596 aa  213  1e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0234  ABC transporter ATP-binding protein  27.17 
 
 
603 aa  210  5e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  35.24 
 
 
623 aa  207  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0479  ABC transporter related protein  27.54 
 
 
596 aa  207  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  27.69 
 
 
596 aa  206  8e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3555  ABC transporter related  31.43 
 
 
584 aa  205  2e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.530108  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1091  ABC transporter related  33.17 
 
 
870 aa  205  2e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4440  ABC transporter related  33.27 
 
 
665 aa  204  4e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.25933  normal  0.204471 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  25.14 
 
 
566 aa  201  3e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1247  ABC transporter related  25.4 
 
 
611 aa  201  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1285  ABC transporter related protein  38.79 
 
 
585 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.652863  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0768  ABC transporter related  30.94 
 
 
610 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0617  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  30.94 
 
 
609 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4410  ABC transporter related  39.12 
 
 
631 aa  197  6e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  30.11 
 
 
608 aa  197  6e-49  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  28.87 
 
 
611 aa  196  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3877  ABC transporter related  32.21 
 
 
673 aa  196  8.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0212257 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  29.36 
 
 
617 aa  196  1e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2180  ABC transporter related  29.56 
 
 
582 aa  193  6e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0353  ABC transporter related  35.34 
 
 
639 aa  193  6e-48  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3076  Type I secretion system ATPase, HlyB  32.13 
 
 
720 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0382  ABC transporter related  33.82 
 
 
641 aa  192  2e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.588151  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0217  Type I secretion system ATPase, HlyB  36.28 
 
 
971 aa  192  2e-47  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.349074  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3590  ABC transporter related protein  42.07 
 
 
604 aa  191  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.657817  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1188  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  31.35 
 
 
1003 aa  190  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.229753  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1248  ABC transporter related  26.49 
 
 
604 aa  190  5.999999999999999e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0261442  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1719  ABC transporter ATP-binding protein  32.99 
 
 
616 aa  189  1e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  27.68 
 
 
573 aa  189  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  39.31 
 
 
597 aa  188  2e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  26.55 
 
 
606 aa  188  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1586  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  30.23 
 
 
579 aa  189  2e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0765157  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0272  ABC transporter related  30.78 
 
 
634 aa  189  2e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  33.79 
 
 
584 aa  188  2e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  28.18 
 
 
618 aa  188  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1482  ATPase  28.89 
 
 
632 aa  188  3e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.412364  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  39.31 
 
 
597 aa  188  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1803  ATPase  32.57 
 
 
649 aa  187  4e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00610246 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0191  ABC transporter related  37.3 
 
 
579 aa  187  4e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.059505  normal  0.523004 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2787  ABC transporter related  32.62 
 
 
653 aa  187  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0984  type I secretion system ATPase  31.41 
 
 
700 aa  187  6e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0815075  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4885  ABC transporter related  32.14 
 
 
626 aa  187  6e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1517  ABC transporter related  27.81 
 
 
622 aa  187  6e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>