More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0875 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0933  UDP-glucose 6-dehydrogenase  96.42 
 
 
475 aa  926    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.321058 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5678  nucleotide sugar dehydrogenase  65.6 
 
 
474 aa  636    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0875  UDP-glucose 6-dehydrogenase  100 
 
 
475 aa  959    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.180829  normal  0.0645369 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2901  nucleotide sugar dehydrogenase  60.13 
 
 
443 aa  532  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00203008  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0713  nucleotide sugar dehydrogenase  59.47 
 
 
437 aa  512  1e-144  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.227984 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28520  nucleotide sugar dehydrogenase  56.67 
 
 
494 aa  504  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.55315  normal  0.0721644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1344  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.35 
 
 
439 aa  503  1e-141  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.73347 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0408  UDP-glucose 6-dehydrogenase  58.22 
 
 
439 aa  504  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.782404  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5905  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.18 
 
 
495 aa  486  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.717039 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0966  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.23 
 
 
442 aa  481  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0598  UDP-glucose 6-dehydrogenase  57.11 
 
 
446 aa  476  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.602937  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6546  UDP-glucose 6-dehydrogenase  59.06 
 
 
490 aa  478  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.255924 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0931  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.79 
 
 
442 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0948  UDP-glucose 6-dehydrogenase  54.79 
 
 
442 aa  472  1e-132  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2544  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.05 
 
 
462 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3549  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.71 
 
 
547 aa  470  1.0000000000000001e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26860  nucleotide sugar dehydrogenase  53.9 
 
 
437 aa  471  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4461  nucleotide sugar dehydrogenase  55.26 
 
 
438 aa  465  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0289  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.56 
 
 
444 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143156  normal  0.166513 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0709  UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.7 
 
 
444 aa  465  9.999999999999999e-131  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.76 
 
 
440 aa  465  9.999999999999999e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.473294  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0421  nucleotide sugar dehydrogenase  54.65 
 
 
439 aa  459  9.999999999999999e-129  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3173  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.23 
 
 
440 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10327  UDP-glucose 6-dehydrogenase udgA  54.63 
 
 
443 aa  460  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3113  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.23 
 
 
440 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08720  predicted UDP-glucose 6-dehydrogenase  55.7 
 
 
488 aa  455  1e-127  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0436357  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2984  nucleotide sugar dehydrogenase  54.73 
 
 
434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7670  nucleotide sugar dehydrogenase  54.19 
 
 
439 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.888609  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3900  UDP-glucose 6-dehydrogenase  52.76 
 
 
456 aa  454  1.0000000000000001e-126  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0133556 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3879  nucleotide sugar dehydrogenase  55.53 
 
 
443 aa  449  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1163  nucleotide sugar dehydrogenase  52.69 
 
 
477 aa  445  1.0000000000000001e-124  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4346  nucleotide sugar dehydrogenase  52.77 
 
 
465 aa  442  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282957  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7280  UDP-glucose 6-dehydrogenase  56.45 
 
 
465 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0910689 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0912  nucleotide sugar dehydrogenase  55.09 
 
 
439 aa  441  9.999999999999999e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.680002  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3207  UDP-glucose 6-dehydrogenase  53.45 
 
 
437 aa  436  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3192  nucleotide sugar dehydrogenase  52.98 
 
 
452 aa  434  1e-120  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.972746  normal  0.0135987 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0034  nucleotide sugar dehydrogenase  52.22 
 
 
440 aa  432  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.250011 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02040  nucleotide sugar dehydrogenase  51.97 
 
 
494 aa  419  1e-116  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1006  nucleotide sugar dehydrogenase  55.21 
 
 
435 aa  418  9.999999999999999e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0179197 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1069  UDP-glucose 6-dehydrogenase  48.46 
 
 
454 aa  387  1e-106  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1504  UDP-glucose 6-dehydrogenase  47.87 
 
 
438 aa  382  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.262172  normal  0.0661871 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0076  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.21 
 
 
434 aa  358  1.9999999999999998e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3255  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.98 
 
 
434 aa  348  1e-94  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.564317  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2368  UDP-glucose 6-dehydrogenase  46.46 
 
 
441 aa  345  8.999999999999999e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.32995  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4534  UDP-glucose 6-dehydrogenase  43.08 
 
 
451 aa  345  8.999999999999999e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0608813  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1110  nucleotide sugar dehydrogenase  42.06 
 
 
446 aa  343  4e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.6072  unclonable  0.0000000437012 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2987  nucleotide sugar dehydrogenase  41.96 
 
 
441 aa  336  7e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0273296  normal 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3775  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.87 
 
 
434 aa  335  9e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3235  nucleotide sugar dehydrogenase  41.29 
 
 
442 aa  333  5e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3681  nucleotide sugar dehydrogenase  40.94 
 
 
433 aa  331  2e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.72238  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4824  nucleotide sugar dehydrogenase  41.96 
 
 
435 aa  329  6e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2536  nucleotide sugar dehydrogenase  38.29 
 
 
427 aa  329  7e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.171539 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0913  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.99 
 
 
457 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0783  nucleotide sugar dehydrogenase  41.65 
 
 
454 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.159514 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1839  nucleotide sugar dehydrogenase  41.61 
 
 
434 aa  327  3e-88  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.158743  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0854  nucleotide sugar dehydrogenase  41.87 
 
 
454 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.74874 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2224  nucleotide sugar dehydrogenase  41.39 
 
 
434 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.339815 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3370  UDP-glucose/GDP-mannose dehydrogenase  42.89 
 
 
438 aa  325  8.000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3551  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.07 
 
 
438 aa  324  2e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1352  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.12 
 
 
443 aa  323  3e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000465012  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1948  nucleotide sugar dehydrogenase  41.16 
 
 
434 aa  323  3e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.286781  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2323  nucleotide sugar dehydrogenase  40.44 
 
 
440 aa  323  4e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2489  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.33 
 
 
436 aa  323  4e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.656583  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5192  nucleotide sugar dehydrogenase  41.52 
 
 
440 aa  323  5e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.602765  normal  0.0285875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0953  nucleotide sugar dehydrogenase  41.81 
 
 
447 aa  323  6e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0775  nucleotide sugar dehydrogenase  42.22 
 
 
452 aa  322  9.000000000000001e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3180  nucleotide sugar dehydrogenase  40.54 
 
 
449 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000062373  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0606  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.7 
 
 
442 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.641401  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2306  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.98 
 
 
434 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.595452  normal  0.13158 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0653  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.98 
 
 
434 aa  320  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0616726  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1853  nucleotide sugar dehydrogenase  40.35 
 
 
441 aa  320  3e-86  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.85941  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0688  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.27 
 
 
437 aa  320  3e-86  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.565249  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4084  nucleotide sugar dehydrogenase  38.5 
 
 
458 aa  320  3e-86  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3027  UDP-glucose 6-dehydrogenase  38.27 
 
 
457 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1159  nucleotide sugar dehydrogenase  47.12 
 
 
434 aa  320  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000026307 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2116  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.09 
 
 
438 aa  320  5e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1947  nucleotide sugar dehydrogenase  42.35 
 
 
463 aa  319  6e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.620289  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5385  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.62 
 
 
457 aa  317  2e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.463781  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2329  nucleotide sugar dehydrogenase  40.62 
 
 
439 aa  318  2e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.129467 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3252  nucleotide sugar dehydrogenase  40.04 
 
 
438 aa  318  2e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597555 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3028  nucleotide sugar dehydrogenase  40.04 
 
 
438 aa  317  2e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.223709 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0795  nucleotide sugar dehydrogenase  40.18 
 
 
434 aa  317  2e-85  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2277  UDP-glucose 6-dehydrogenase  36.53 
 
 
451 aa  317  3e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00280919  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4414  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.44 
 
 
478 aa  317  3e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3217  nucleotide sugar dehydrogenase  40.72 
 
 
438 aa  317  4e-85  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0130  udp-glucose 6-dehydrogenase  36.67 
 
 
443 aa  316  5e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4548  nucleotide sugar dehydrogenase  41.96 
 
 
436 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0894  nucleotide sugar dehydrogenase  38.33 
 
 
449 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0698  nucleotide sugar dehydrogenase  38 
 
 
459 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0064  nucleotide sugar dehydrogenase  38.17 
 
 
442 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0265709  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4098  hypothetical protein  40.59 
 
 
464 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.197765  normal  0.22433 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2639  nucleotide sugar dehydrogenase  39.96 
 
 
434 aa  315  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.404662  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0920  nucleotide sugar dehydrogenase  38.33 
 
 
449 aa  314  1.9999999999999998e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0799029  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0333  UDP-glucose 6-dehydrogenase  40.35 
 
 
438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1585  UDP-glucose 6-dehydrogenase  42.35 
 
 
435 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1593  UDP-glucose 6-dehydrogenase  41.65 
 
 
436 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0579  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.87 
 
 
437 aa  314  2.9999999999999996e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0396175  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4079  nucleotide sugar dehydrogenase  38.27 
 
 
458 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0785  nucleotide sugar dehydrogenase  39.78 
 
 
449 aa  313  4.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180354  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0986  UDP-glucose 6-dehydrogenase  39.74 
 
 
467 aa  312  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>