106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3482 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_3482  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  343  5e-94  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.214908 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0126  hypothetical protein  57.99 
 
 
169 aa  197  6e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3790  hypothetical protein  62.66 
 
 
170 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3990  hypothetical protein  62.66 
 
 
170 aa  196  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0259  hypothetical protein  58.93 
 
 
168 aa  194  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.934238  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0155  hypothetical protein  62.25 
 
 
170 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4179  hypothetical protein  62.25 
 
 
170 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3998  hypothetical protein  63.64 
 
 
182 aa  192  2e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4310  hypothetical protein  62.25 
 
 
170 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4111  hypothetical protein  62.25 
 
 
170 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4604  hypothetical protein  66.2 
 
 
170 aa  191  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3863  hypothetical protein  65.52 
 
 
170 aa  191  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0179  hypothetical protein  63.09 
 
 
170 aa  189  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0199  hypothetical protein  61.94 
 
 
170 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3781  hypothetical protein  62 
 
 
170 aa  184  5e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3516  hypothetical protein  59.73 
 
 
168 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1095  hypothetical protein  45.24 
 
 
290 aa  95.5  3e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0221181  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1742  hypothetical protein  39.2 
 
 
278 aa  85.1  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1544  hypothetical protein  34.42 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0034241 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1869  cell division inhibitor, putative  34.42 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2378  cell division inhibitor SulA, putative  32.59 
 
 
204 aa  74.7  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.296843  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2793  hypothetical protein  33.85 
 
 
206 aa  71.2  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.274129  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3151  hypothetical protein  35.9 
 
 
205 aa  70.9  0.000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3117  hypothetical protein  37.61 
 
 
206 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.579435 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1936  hypothetical protein  31.69 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.743676  normal  0.501634 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2600  hypothetical protein  37.61 
 
 
206 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.79466 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2426  hypothetical protein  36.75 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55590  hypothetical protein  34.19 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.317659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2521  hypothetical protein  33.61 
 
 
207 aa  67.4  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.286499  normal  0.330128 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4839  hypothetical protein  34.19 
 
 
223 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0227  hypothetical protein  36 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0975  hypothetical protein  31.71 
 
 
230 aa  65.9  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2740  hypothetical protein  35.9 
 
 
206 aa  65.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.527612  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0830  SOS cell division inhibitor SulA  30.93 
 
 
228 aa  64.7  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.464648  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2102  hypothetical protein  30.09 
 
 
276 aa  63.9  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6829  hypothetical protein  33.08 
 
 
238 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2298  hypothetical protein  32.99 
 
 
272 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.403173  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6271  hypothetical protein  37.93 
 
 
238 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.632881 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6869  hypothetical protein  32.31 
 
 
238 aa  57.8  0.00000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.850278  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02089  hypothetical protein  31.15 
 
 
216 aa  57.8  0.00000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6158  hypothetical protein  32.06 
 
 
235 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.78326  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2166  hypothetical protein  31.61 
 
 
207 aa  57  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.318676  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2746  hypothetical protein  32.82 
 
 
235 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0204  hypothetical protein  28.46 
 
 
260 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.333866 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1210  SOS cell division inhibitor  37.65 
 
 
164 aa  57  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000104842  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2215  hypothetical protein  32.06 
 
 
235 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.16372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2828  hypothetical protein  32.06 
 
 
235 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0176458  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2540  SOS cell division inhibitor  35.16 
 
 
168 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  5.19438e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0475  hypothetical protein  32.06 
 
 
236 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.901705  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3200  SOS cell division inhibitor  35.16 
 
 
168 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  hitchhiker  0.00343609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2629  SOS cell division inhibitor  35.16 
 
 
168 aa  55.8  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000371858  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2839  hypothetical protein  32.06 
 
 
235 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.382081  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1972  hypothetical protein  28.89 
 
 
235 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.690344  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2888  hypothetical protein  36.19 
 
 
235 aa  55.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0908766  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3143  hypothetical protein  34.11 
 
 
236 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0112  hypothetical protein  34.11 
 
 
236 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1476  hypothetical protein  34.11 
 
 
236 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0508  hypothetical protein  34.11 
 
 
236 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0525  hypothetical protein  34.11 
 
 
236 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2904  hypothetical protein  34.11 
 
 
236 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2697  SOS cell division inhibitor  33.72 
 
 
164 aa  55.1  0.0000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0000388147  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1833  SOS cell division inhibitor SulA  32.38 
 
 
207 aa  54.3  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.93264  hitchhiker  0.0000451564 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0516  hypothetical protein  30.7 
 
 
264 aa  53.5  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1755  SOS cell division inhibitor  30 
 
 
168 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000135467  hitchhiker  0.00000396208 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6767  hypothetical protein  33.04 
 
 
238 aa  53.9  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2548  SOS cell division inhibitor  33.72 
 
 
168 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00047922  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0689  hypothetical protein  34.78 
 
 
920 aa  52.8  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.615835  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2597  hypothetical protein  25.38 
 
 
240 aa  52.4  0.000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7576  hypothetical protein  28.78 
 
 
251 aa  52  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.362 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2857  SOS cell division inhibitor  31.73 
 
 
168 aa  51.6  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.000000546585  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0036  hypothetical protein  24.09 
 
 
229 aa  50.8  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00040  RecA/RadA recombinase  30.86 
 
 
234 aa  50.4  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.140421  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1940  SOS cell division inhibitor SulA  36.96 
 
 
240 aa  49.7  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.457123  normal  0.0696853 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1225  hypothetical protein  32.17 
 
 
249 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2734  hypothetical protein  25.38 
 
 
250 aa  49.3  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120849  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0443  hypothetical protein  30.99 
 
 
291 aa  48.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.571697  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1786  hypothetical protein  29.6 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4894  hypothetical protein  28.57 
 
 
273 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.314192 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14500  cell division inhibitor  31.58 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.578155  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3284  cell division inhibitor, putative  35.23 
 
 
156 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.899997  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25150  hypothetical protein  36.36 
 
 
161 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2151  hypothetical protein  34.15 
 
 
165 aa  45.8  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.92102  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4490  hypothetical protein  27.35 
 
 
318 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.287933  normal  0.379352 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3511  cell division inhibitor, putative  34.09 
 
 
156 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0617  hypothetical protein  26.32 
 
 
237 aa  45.4  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0199531 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2343  hypothetical protein  37.88 
 
 
245 aa  44.7  0.0006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0119361  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2901  hypothetical protein  33.59 
 
 
282 aa  44.7  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0819409 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1586  SOS cell division inhibitor SulA  32.53 
 
 
156 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.584866 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3807  hypothetical protein  27.55 
 
 
251 aa  43.1  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.10779  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1865  hypothetical protein  28.47 
 
 
231 aa  43.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003016  RecA/RadA recombinase  29.35 
 
 
230 aa  43.1  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604638  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02866  hypothetical protein  28.7 
 
 
230 aa  43.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5157  hypothetical protein  34.57 
 
 
253 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.647715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1682  cell division inhibitor-related protein, SulA-like protein  31.96 
 
 
158 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.292047  normal  0.171923 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2800  hypothetical protein  32.5 
 
 
254 aa  42.4  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.205437 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2142  cell division inhibitor-related protein  32.99 
 
 
158 aa  42  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0838821 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3873  SOS cell division inhibitor SulA  32.61 
 
 
157 aa  42  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.752414  normal  0.900283 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3600  SOS-response cell division inhibitor blocks FtsZ ring formation-like protein  32.99 
 
 
158 aa  42  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00249285  normal  0.513615 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1658  cell division inhibitor-related protein, SulA-like protein  32.99 
 
 
158 aa  41.6  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.271985  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4538  hypothetical protein  28.57 
 
 
280 aa  41.6  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>