More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0926 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0197  CheA signal transduction histidine kinase  58.64 
 
 		 687 aa  754    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.13068  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0926  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 652 aa  1286    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4026  CheA signal transduction histidine kinase  36.5 
 
 		 604 aa  426  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000112235 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4420  CheA signal transduction histidine kinase  37.95 
 
 		 598 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3942  CheA signal transduction histidine kinase  36.75 
 
 		 603 aa  424  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.160012  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  37.85 
 
 		 770 aa  423  1e-117  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  37.37 
 
 		 769 aa  419  1e-116  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0750  CheA signal transduction histidine kinase  37.39 
 
 		 650 aa  419  1e-116  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  37.37 
 
 		 769 aa  421  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  36.91 
 
 		 769 aa  419  1e-116  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  37.16 
 
 		 774 aa  410  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  37.44 
 
 		 770 aa  404  1e-111  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  35.47 
 
 		 803 aa  394  1e-108  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0742  CheA signal transduction histidine kinases  35.68 
 
 		 685 aa  391  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0738  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  34.96 
 
 		 639 aa  386  1e-106  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1668  CheA signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 		 660 aa  388  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0244  CheA signal transduction histidine kinase  35.04 
 
 		 681 aa  388  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2440  CheA signal transduction histidine kinase  32.89 
 
 		 696 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.267459  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0773  CheA signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 		 770 aa  376  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.198559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2149  CheA signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 666 aa  366  1e-100  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2222  chemotaxis protein CheA  35.36 
 
 		 692 aa  365  1e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2004  CheA signal transduction histidine kinase  34.95 
 
 		 796 aa  363  5.0000000000000005e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.370377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2123  CheA signal transduction histidine kinase  35.22 
 
 		 701 aa  362  9e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07600  CheA signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 655 aa  362  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000047945  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1529  CheA signal transduction histidine kinase  44.61 
 
 		 747 aa  359  8e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.407348  normal  0.654811 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1390  CheA signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 673 aa  359  9e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002835  chemotaxis protein CheA  44.42 
 
 		 744 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.758012  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3868  chemotaxis protein CheA  43.67 
 
 		 748 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.146228  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3907  CheA signal transduction histidine kinase  44.36 
 
 		 743 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.408292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2284  CheA signal transduction histidine kinases  34.83 
 
 		 702 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45590  putative two-component sensor  43.47 
 
 		 753 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267862 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4338  CheA signal transduction histidine kinase  44.19 
 
 		 747 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.505907  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1134  CheA signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 		 675 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3266  CheA signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 		 607 aa  356  5.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000540814 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2311  CheA signal transduction histidine kinase  35.05 
 
 		 690 aa  356  7.999999999999999e-97  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2802  CheA signal transduction histidine kinase  43.72 
 
 		 737 aa  355  1e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.787874  normal  0.174869 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3664  CheA signal transduction histidine kinase  43.94 
 
 		 739 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.297315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3803  CheA signal transduction histidine kinases  33.83 
 
 		 934 aa  355  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4247  CheA signal transduction histidine kinases  34.14 
 
 		 922 aa  355  2e-96  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.63903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0720  CheA signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 		 719 aa  354  2.9999999999999997e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.905691  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1566  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  43.43 
 
 		 754 aa  352  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396525  normal  0.0694076 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3146  CheA signal transduction histidine kinase  34.31 
 
 		 671 aa  352  1e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0296  chemotaxis protein CheA, putative  42.93 
 
 		 610 aa  351  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1906  ATP-binding region ATPase domain protein  33.89 
 
 		 910 aa  350  4e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0988  CheA signal transduction histidine kinases  43.96 
 
 		 734 aa  350  6e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.581275 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1982  chemotaxis sensor histidine kinase CheA  43.18 
 
 		 748 aa  349  8e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0520  CheA kinase  34.25 
 
 		 888 aa  349  8e-95  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.691832 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3434  CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Signal transducing histidine kinase, homodimeric:Hpt  42.93 
 
 		 758 aa  349  9e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.223836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3920  CheA-like signal transduction histidine kinase  34.19 
 
 		 934 aa  348  2e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.690282 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1691  CheA signal transduction histidine kinase  34.16 
 
 		 878 aa  348  2e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1202  CheA signal transduction histidine kinases  41.4 
 
 		 736 aa  348  3e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.120847  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2690  CheA signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 		 697 aa  347  4e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1341  CheA signal transduction histidine kinase  44.1 
 
 		 691 aa  345  1e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03141  hypothetical protein  43.21 
 
 		 744 aa  345  1e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  43.97 
 
 		 783 aa  345  2e-93  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2814  CheA signal transduction histidine kinase  43.08 
 
 		 606 aa  345  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2627  chemotaxis protein CheA  33.33 
 
 		 652 aa  344  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0596753  hitchhiker  0.000000000635957 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1512  chemotaxis protein CheA  32.17 
 
 		 681 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0308171  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1651  chemotaxis protein CheA  43.69 
 
 		 785 aa  344  2.9999999999999997e-93  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.770594  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1383  CheA signal transduction histidine kinase  39.73 
 
 		 1031 aa  343  4e-93  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0226  CheA signal transduction histidine kinase  44.91 
 
 		 671 aa  343  5e-93  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.985632  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3046  CheA signal transduction histidine kinase  43.04 
 
 		 733 aa  343  7e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0699777 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0249  CheA signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 649 aa  343  8e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.818648  normal  0.0240332 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  43.96 
 
 		 785 aa  342  1e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0228  CheA signal transduction histidine kinase  44.91 
 
 		 671 aa  342  1e-92  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01859  fused chemotactic sensory histidine kinase in two-component regulatory system with CheB and CheY: sensory histidine kinase/signal sensing protein  33.18 
 
 		 654 aa  342  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00492896  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1744  chemotaxis protein CheA  33.18 
 
 		 654 aa  341  2e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1178  CheA signal transduction histidine kinase  44.07 
 
 		 715 aa  341  2e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.72434  normal  0.652884 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01848  hypothetical protein  33.18 
 
 		 654 aa  342  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0113897  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2181  chemotaxis protein CheA  33.18 
 
 		 654 aa  341  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.21887  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1296  chemotaxis protein CheA  33.18 
 
 		 652 aa  341  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.182817  hitchhiker  0.0000116445 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1752  CheA signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 654 aa  341  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.025847  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2287  chemotaxis protein CheA  42.48 
 
 		 723 aa  340  2.9999999999999998e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2024  CheA signal transduction histidine kinases  32.91 
 
 		 715 aa  340  2.9999999999999998e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1984  chemotaxis protein CheA  33.03 
 
 		 654 aa  341  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00874539  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2121  chemotaxis protein CheA  33.33 
 
 		 654 aa  341  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000407704  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0877  CheA signal transduction histidine kinases  41.16 
 
 		 601 aa  341  2.9999999999999998e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00846405  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2161  putative CheA signal transduction histidine kinases  41.65 
 
 		 767 aa  340  5e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1369  CheA signal transduction histidine kinases  42.49 
 
 		 762 aa  340  5e-92  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.743418  normal  0.202802 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1362  CheA signal transduction histidine kinases  42.49 
 
 		 762 aa  340  5e-92  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0955234 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02867  chemotaxis protein cheA  43.62 
 
 		 751 aa  339  8e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1457  CheA signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 		 746 aa  339  9e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0417438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2916  CheA signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 		 747 aa  339  9e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3048  CheA signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 		 738 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.464654 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2906  CheA signal transduction histidine kinase  42.26 
 
 		 747 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0755  CheA signal transduction histidine kinase  33.43 
 
 		 688 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0128541 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1302  CheA signal transduction histidine kinases  42.24 
 
 		 760 aa  338  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.345231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1156  CheA signal transduction histidine kinases  43.6 
 
 		 1089 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.254693  normal  0.262443 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2556  CheA signal transduction histidine kinase  42.75 
 
 		 741 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0740  CheA signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 		 686 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3207  chemotaxis protein  42.49 
 
 		 758 aa  337  3.9999999999999995e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1714  CheA signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 		 921 aa  337  5.999999999999999e-91  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2137  chemotaxis protein CheA  32.4 
 
 		 669 aa  336  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.959484  hitchhiker  1.08474e-24 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2082  chemotaxis protein CheA  32.4 
 
 		 669 aa  336  7e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.5408699999999997e-20 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0474  CheA signal transduction histidine kinases  42.51 
 
 		 739 aa  336  7e-91  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1612  CheA signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 694 aa  336  7.999999999999999e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0166152  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1972  CheA signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 709 aa  336  9e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1522  chemotaxis protein CheA  42.04 
 
 		 714 aa  335  1e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3425  CheA signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 		 745 aa  335  1e-90  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.630026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1323  chemotaxis protein CheA  32.4 
 
 		 669 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.565549999999999e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>