115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1649 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1649  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  723    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2621  hypothetical protein  92.61 
 
 		 607 aa  642    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00640783 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2688  hypothetical protein  92.61 
 
 		 607 aa  673    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.20701  unclonable  0.0000515921 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2796  hypothetical protein  92.9 
 
 		 607 aa  643    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.356922 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1465  hypothetical protein  86.08 
 
 		 614 aa  614  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2882  protein of unknown function DUF885  86.08 
 
 		 617 aa  614  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.92896  hitchhiker  0.00786723 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1501  hypothetical protein  85.23 
 
 		 614 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1470  hypothetical protein  85.51 
 
 		 614 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.380517  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1367  hypothetical protein  82.95 
 
 		 614 aa  587  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3262  hypothetical protein  66.76 
 
 		 611 aa  472  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.744492 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4234  hypothetical protein  60.51 
 
 		 608 aa  452  1.0000000000000001e-126  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.66689  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2502  hypothetical protein  54.96 
 
 		 622 aa  402  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.547349  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1186  hypothetical protein  42.24 
 
 		 615 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.439347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1187  hypothetical protein  41.81 
 
 		 615 aa  172  9e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1257  hypothetical protein  41.81 
 
 		 615 aa  171  1e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0275437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1120  hypothetical protein  35.31 
 
 		 627 aa  171  2e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.235834  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2185  putative lipoprotein  36.22 
 
 		 617 aa  166  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0983749  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1331  protein of unknown function DUF885  41.2 
 
 		 616 aa  164  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000481618  hitchhiker  0.000370472 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3361  hypothetical protein  40.09 
 
 		 615 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3190  hypothetical protein  40.77 
 
 		 616 aa  162  6e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000502664  normal  0.261555 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3032  hypothetical protein  40.77 
 
 		 616 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.913985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3047  hypothetical protein  40.34 
 
 		 616 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000223999  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1325  hypothetical protein  33.88 
 
 		 614 aa  159  6e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0980607 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1130  hypothetical protein  34.53 
 
 		 613 aa  158  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0221143  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2694  hypothetical protein  39.06 
 
 		 628 aa  157  3e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.290043  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2484  hypothetical protein  38.36 
 
 		 625 aa  155  1e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.129536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2692  hypothetical protein  32.77 
 
 		 624 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000199463  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1225  hypothetical protein  34.39 
 
 		 613 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000182029  normal  0.162619 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08886  hypothetical protein  34.22 
 
 		 602 aa  152  7e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0383418  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2577  hypothetical protein  32.08 
 
 		 630 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0043  hypothetical protein  30.19 
 
 		 618 aa  139  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0062992  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02708  hypothetical protein  30.31 
 
 		 617 aa  136  6.0000000000000005e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4257  hypothetical protein  38.57 
 
 		 636 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00173192  hitchhiker  0.000137041 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2867  hypothetical protein  36.25 
 
 		 618 aa  134  3e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000160677  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1934  hypothetical protein  29.84 
 
 		 628 aa  128  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.188591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0679  hypothetical protein  36 
 
 		 605 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1492  hypothetical protein  33.78 
 
 		 628 aa  125  1e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000165722  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1935  hypothetical protein  29.23 
 
 		 625 aa  120  3e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0229438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3456  hypothetical protein  28.66 
 
 		 605 aa  117  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.203936  normal  0.029844 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2044  twin-arginine translocation pathway signal  29.82 
 
 		 614 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.153512 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1933  hypothetical protein  32.61 
 
 		 629 aa  112  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.545709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3964  hypothetical protein  31.53 
 
 		 621 aa  107  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0089  hypothetical protein  26.84 
 
 		 635 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3722  hypothetical protein  31.05 
 
 		 594 aa  106  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.241744 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0094  hypothetical protein  26.84 
 
 		 635 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0095  hypothetical protein  26.84 
 
 		 635 aa  105  1e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4005  hypothetical protein  27.47 
 
 		 601 aa  104  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4118  hypothetical protein  27.47 
 
 		 601 aa  104  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0084  hypothetical protein  28 
 
 		 619 aa  104  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.332216 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3913  hypothetical protein  27.47 
 
 		 601 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.10642 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1390  hypothetical protein  29.66 
 
 		 609 aa  102  9e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0045  hypothetical protein  29.09 
 
 		 603 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.227814  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4353  hypothetical protein  29.39 
 
 		 603 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4298  protein of unknown function DUF885  28.79 
 
 		 603 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000426014 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4392  hypothetical protein  27.87 
 
 		 604 aa  100  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4495  hypothetical protein  28.79 
 
 		 603 aa  100  4e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.340398 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2913  hypothetical protein  26.95 
 
 		 585 aa  99.4  8e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00043  hypothetical protein  31.01 
 
 		 583 aa  99.4  9e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3915  hypothetical protein  29.18 
 
 		 603 aa  97.8  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.490464  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1979  protein of unknown function DUF885  28.2 
 
 		 592 aa  97.8  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0497  protein of unknown function DUF885  27.62 
 
 		 587 aa  96.3  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.362585  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3202  putative lipoprotein  27.27 
 
 		 633 aa  96.3  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4732  hypothetical protein  27.38 
 
 		 601 aa  95.9  8e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0040  hypothetical protein  29.43 
 
 		 602 aa  95.5  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2850  hypothetical protein  25.5 
 
 		 613 aa  94.7  2e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3398  hypothetical protein  29.52 
 
 		 610 aa  95.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.15376 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0145  hypothetical protein  27.19 
 
 		 637 aa  93.6  5e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.549685  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2512  protein of unknown function DUF885  27.52 
 
 		 605 aa  93.2  7e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.141981 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4640  hypothetical protein  24.55 
 
 		 639 aa  92  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.800021 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0095  hypothetical protein  29.1 
 
 		 599 aa  92  1e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0128  hypothetical protein  27.19 
 
 		 635 aa  92.4  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.185093  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3959  protein of unknown function DUF885  33.98 
 
 		 590 aa  90.5  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0052  hypothetical protein  27.91 
 
 		 591 aa  90.1  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0722154 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0040  hypothetical protein  27.6 
 
 		 589 aa  89.7  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01796  hypothetical protein  28.38 
 
 		 629 aa  89.7  7e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.378298  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3628  hypothetical protein  31.22 
 
 		 599 aa  89.4  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2418  hypothetical protein  25 
 
 		 607 aa  88.2  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.562363  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2471  hypothetical protein  28.8 
 
 		 611 aa  88.6  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000555519 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4378  hypothetical protein  27.14 
 
 		 595 aa  87.8  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0089  hypothetical protein  26.03 
 
 		 599 aa  87.8  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00456954 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2645  hypothetical protein  27.95 
 
 		 610 aa  87  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.301133  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2620  hypothetical protein  26 
 
 		 609 aa  85.9  9e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1632  hypothetical protein  25.36 
 
 		 609 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0345608  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2922  protein of unknown function DUF885  25.99 
 
 		 646 aa  82.8  0.000000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.799276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1669  hypothetical protein  25.18 
 
 		 609 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0645699  normal  0.180826 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2711  protein of unknown function DUF885  24.92 
 
 		 609 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.921119  decreased coverage  0.00000003491 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1578  hypothetical protein  27.41 
 
 		 616 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.222544  normal  0.140348 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3072  hypothetical protein  26.58 
 
 		 616 aa  80.9  0.00000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000286308  hitchhiker  0.000500018 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1831  hypothetical protein  26.17 
 
 		 609 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1647  hypothetical protein  25 
 
 		 609 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01443  hypothetical protein  28.14 
 
 		 621 aa  80.5  0.00000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01442  lipoprotein, putative  23.26 
 
 		 610 aa  80.1  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0588  Prolyl oligopeptidase  24.84 
 
 		 1283 aa  79.3  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7255  protein of unknown function DUF885  26.38 
 
 		 589 aa  76.6  0.0000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00409593  normal  0.317417 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2457  hypothetical protein  25.78 
 
 		 609 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000006339 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2527  hypothetical protein  25.39 
 
 		 609 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.219284  unclonable  0.0000429666 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2619  hypothetical protein  25 
 
 		 611 aa  74.7  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000485801 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1261  hypothetical protein  24.6 
 
 		 609 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000229182 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2373  hypothetical protein  28.49 
 
 		 566 aa  74.7  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1524  hypothetical protein  26 
 
 		 609 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>