More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG1385 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG1385  cytidylate kinase  100 
 
 
227 aa  462  1e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000116404  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1090  cytidylate kinase  75.89 
 
 
226 aa  348  5e-95  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000570118  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1860  cytidylate kinase  64.13 
 
 
220 aa  269  2.9999999999999997e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10096  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2171  cytidylate kinase  59.26 
 
 
224 aa  242  3e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000313487  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1293  cytidylate kinase  57.67 
 
 
224 aa  242  3e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00871161  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0891  cytidylate kinase  55.5 
 
 
230 aa  235  5.0000000000000005e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00236441  decreased coverage  0.00000000000000152921 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1220  cytidylate kinase  55.66 
 
 
225 aa  229  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000130808  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1552  cytidylate kinase  55.19 
 
 
225 aa  229  3e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000178847  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1420  cytidylate kinase  55.19 
 
 
225 aa  228  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000147531  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3792  cytidylate kinase  55.19 
 
 
225 aa  228  8e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157235  hitchhiker  0.0000757077 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1623  cytidylate kinase  54.25 
 
 
225 aa  227  1e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000468562  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1407  cytidylate kinase  54.25 
 
 
225 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000164884  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1379  cytidylate kinase  54.25 
 
 
225 aa  226  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000311756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1378  cytidylate kinase  54.25 
 
 
225 aa  226  2e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000246043  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1518  cytidylate kinase  54.25 
 
 
225 aa  226  2e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000739284  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1659  cytidylate kinase  54.25 
 
 
225 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000228259  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1591  cytidylate kinase  54.25 
 
 
225 aa  226  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.1931099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1008  cytidylate kinase  51.16 
 
 
219 aa  214  5.9999999999999996e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1534  cytidylate kinase  51.18 
 
 
219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1565  cytidylate kinase  51.18 
 
 
219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.464485  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1045  cytidylate kinase  52.31 
 
 
215 aa  211  7.999999999999999e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.117203  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0453  cytidylate kinase  54.67 
 
 
224 aa  202  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1325  cytidylate kinase  49.33 
 
 
226 aa  202  5e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1151  cytidylate kinase  48.17 
 
 
217 aa  199  3e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1331  cytidylate kinase  48.82 
 
 
229 aa  197  9e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000282811  decreased coverage  0.00883322 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1340  cytidylate kinase  47.25 
 
 
217 aa  196  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0841827  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0762  cytidylate kinase  51.8 
 
 
228 aa  192  3e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000614962  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10390  cytidylate kinase  46.76 
 
 
228 aa  192  3e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000240582  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2799  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.7 
 
 
528 aa  189  2.9999999999999997e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.167261 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1604  cytidylate kinase  48.57 
 
 
221 aa  188  5.999999999999999e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0712  cytidylate kinase  48.62 
 
 
227 aa  186  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000327752  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1109  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.58 
 
 
511 aa  186  2e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.976092 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1080  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.58 
 
 
511 aa  186  4e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3387  cytidylate kinase  47.2 
 
 
232 aa  184  8e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000123016  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1152  cytidylate kinase  48.61 
 
 
222 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1151  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.1 
 
 
527 aa  182  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1148  cytidylate kinase  47 
 
 
218 aa  182  3e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2756  cytidylate kinase  46.48 
 
 
230 aa  182  5.0000000000000004e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1409  cytidylate kinase  45.89 
 
 
224 aa  181  6e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0393534  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0964  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  48.36 
 
 
534 aa  180  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.955795  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  44.8 
 
 
218 aa  180  2e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2370  cytidylate kinase  44.29 
 
 
230 aa  180  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.988274  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3339  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.54 
 
 
529 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2816  cytidylate kinase  44.86 
 
 
244 aa  179  2.9999999999999997e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0539109  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10343  putative cytidylate kinase  45.97 
 
 
232 aa  177  8e-44  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17821  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.09 
 
 
510 aa  177  1e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2147  cytidylate kinase  39.72 
 
 
232 aa  177  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0902079  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1346  cytidylate kinase  44.02 
 
 
219 aa  175  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0048747  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1180  cytidylate kinase  46.26 
 
 
232 aa  175  5e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.848672  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1165  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.67 
 
 
516 aa  175  5e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.841072  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1640  cytidylate kinase  41.55 
 
 
231 aa  174  8e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.302898 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0348  cytidylate kinase  43.17 
 
 
237 aa  174  9e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000112286  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1333  cytidylate kinase  45.97 
 
 
252 aa  174  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.671241 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20401  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  45.67 
 
 
516 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.523642  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  43.32 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3494  cytidylate kinase  45.91 
 
 
228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.121252  normal  0.220697 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0451  cytidylate kinase  45.58 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.001027  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  44.04 
 
 
229 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0725  cytidylate kinase  43.84 
 
 
514 aa  172  2.9999999999999996e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0311607  normal  0.0975143 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0930  cytidylate kinase  40.78 
 
 
234 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2943  cytidylate kinase  42.72 
 
 
228 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.142488 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1884  cytidylate kinase  41.94 
 
 
235 aa  172  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000963447  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2928  cytidylate kinase  42.72 
 
 
228 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2972  cytidylate kinase  42.72 
 
 
228 aa  172  5e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469011  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0594  cytidylate kinase  45.21 
 
 
213 aa  171  5.999999999999999e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  42.18 
 
 
229 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1682  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  47.53 
 
 
510 aa  171  9e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3643  cytidylate kinase  42.65 
 
 
229 aa  170  1e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000551434  normal  0.674927 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0416  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.75 
 
 
480 aa  171  1e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.130302  normal  0.171776 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11727  cytidylate kinase  41.28 
 
 
230 aa  169  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.808416  normal  0.551451 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  42.92 
 
 
228 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  42.92 
 
 
228 aa  168  6e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4282  pantoate/beta-alanine ligase  44.34 
 
 
539 aa  168  6e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22471  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.44 
 
 
488 aa  168  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0695  cytidylate kinase  40.91 
 
 
223 aa  167  8e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09660  cytidylate kinase  43.12 
 
 
223 aa  167  8e-41  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5340  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.15 
 
 
526 aa  167  9e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2605  cytidylate kinase  42.51 
 
 
233 aa  167  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17771  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  46.19 
 
 
509 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  42.47 
 
 
228 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1465  cytidylate kinase  40.09 
 
 
240 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00293534  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1622  cytidylate kinase  47.83 
 
 
217 aa  167  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0865  cytidylate kinase  42.18 
 
 
232 aa  166  2e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.054851  normal  0.903587 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  42.92 
 
 
225 aa  166  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  41.4 
 
 
221 aa  166  2e-40  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2827  cytidylate kinase  44.29 
 
 
223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000300632  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14810  cytidylate kinase  43.89 
 
 
269 aa  166  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  43.12 
 
 
229 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2999  cytidylate kinase  41.26 
 
 
218 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.202126  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1752  cytidylate kinase  39.73 
 
 
227 aa  166  4e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000000925539  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0417  cytidylate kinase  41.99 
 
 
237 aa  166  4e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000354402  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1375  cytidylate kinase  38.57 
 
 
230 aa  165  5e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1371  cytidylate kinase  38.57 
 
 
230 aa  165  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0179  cytidylate kinase  43.75 
 
 
227 aa  165  5e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000847233  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1914  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.75 
 
 
483 aa  164  6.9999999999999995e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.650764  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2219  cytidylate kinase  40.54 
 
 
224 aa  164  6.9999999999999995e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000392774  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2164  cytidylate kinase  38.57 
 
 
232 aa  164  8e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00199731  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1954  cytidylate kinase  40 
 
 
230 aa  164  1.0000000000000001e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000903512  normal  0.349566 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  43 
 
 
227 aa  164  1.0000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17111  bifunctional pantoate ligase/cytidylate kinase  43.27 
 
 
517 aa  164  1.0000000000000001e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>