More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0718 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0718  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 
251 aa  518  1e-146  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000110627  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1117  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  80.65 
 
 
255 aa  424  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000186599  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1477  ABC transporter related  61.89 
 
 
242 aa  310  1e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2805  ABC transporter related protein  62.3 
 
 
242 aa  310  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0540  ABC transporter-related protein  60.25 
 
 
243 aa  303  1.0000000000000001e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.453027  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1936  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  61.07 
 
 
245 aa  298  7e-80  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0352158  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3968  ABC transporter related  58.54 
 
 
244 aa  298  7e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.258821  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0528  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  61.32 
 
 
258 aa  297  1e-79  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.191469  normal  0.015863 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2207  ABC transporter related protein  59.43 
 
 
242 aa  296  2e-79  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.897836  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2156  ABC transporter related  57.79 
 
 
254 aa  295  5e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2143  ABC transporter related  57.79 
 
 
254 aa  295  5e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.410301  hitchhiker  0.00273031 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2202  ABC transporter related  57.79 
 
 
242 aa  294  8e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.723591  normal  0.0560155 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1511  ABC transporter related  61.29 
 
 
246 aa  293  2e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3983  ABC transporter related protein  56.97 
 
 
252 aa  291  6e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.563124 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36880  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  55.92 
 
 
257 aa  290  1e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0447  amino acid transporter ATP-binding protein  56.73 
 
 
248 aa  289  4e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0253286  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2801  ABC transporter related  57.14 
 
 
258 aa  288  5.0000000000000004e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.830798  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0810  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  56.97 
 
 
247 aa  287  1e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.64253  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3464  ABC transporter related  54.69 
 
 
253 aa  286  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.409594  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4396  ABC transporter related  55.51 
 
 
259 aa  286  2e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3987  ABC transporter related  57.38 
 
 
255 aa  285  4e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0621823 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02364  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase  55.74 
 
 
249 aa  285  5e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2521  ABC transporter related  56.33 
 
 
251 aa  285  5.999999999999999e-76  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000873561 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0672  ABC transporter related protein  55.74 
 
 
247 aa  284  7e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.20068  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0972  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.51 
 
 
251 aa  283  1.0000000000000001e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000308614  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3912  ABC transporter related protein  56.56 
 
 
262 aa  284  1.0000000000000001e-75  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4950  ABC transporter related  53.78 
 
 
259 aa  284  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5456  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  54.1 
 
 
252 aa  283  2.0000000000000002e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1105  ABC transporter related  57.02 
 
 
258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.750493 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1702  ABC transporter related  56.43 
 
 
253 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.478201 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1757  ABC transporter related  57.56 
 
 
257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.931252  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15420  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  56.91 
 
 
274 aa  283  2.0000000000000002e-75  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0145582  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6440  ABC transporter related  57.02 
 
 
258 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0335  ABC transporter related  57.02 
 
 
249 aa  282  3.0000000000000004e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.739682  normal  0.0719591 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1560  ABC transporter related  57.14 
 
 
257 aa  281  5.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.643949 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003414  ABC-type polar amino acid transport system ATPase component  55.33 
 
 
249 aa  282  5.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000616788  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1791  ABC transporter related protein  55.33 
 
 
256 aa  281  6.000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.319605  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0297  ABC transporter related  56.79 
 
 
263 aa  281  6.000000000000001e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0606  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.89 
 
 
243 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4663  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.48 
 
 
242 aa  281  1e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.583474  hitchhiker  2.7569099999999997e-21 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0551  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  61.89 
 
 
243 aa  281  1e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3745  ABC transporter related  56.54 
 
 
259 aa  280  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0639  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  61.89 
 
 
243 aa  281  1e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.533598  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3416  ABC transporter related  54.92 
 
 
251 aa  280  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0239  ABC transporter related  54.51 
 
 
241 aa  280  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0675  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.48 
 
 
242 aa  280  1e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0696  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.89 
 
 
284 aa  280  1e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2001  ABC transporter related  55.69 
 
 
258 aa  281  1e-74  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1498  ABC transporter related  56.15 
 
 
257 aa  281  1e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.293491 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27700  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.15 
 
 
251 aa  281  1e-74  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.583955 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0707  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.89 
 
 
298 aa  280  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0550  glutamine ABC transporter ATP-binding protein  61.48 
 
 
243 aa  280  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0630  ABC transporter related  55.97 
 
 
263 aa  280  2e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0907  ABC transporter related  56.15 
 
 
254 aa  279  2e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2443  ABC transporter related  54.51 
 
 
261 aa  280  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.172731  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0552  ABC transporter related  60.66 
 
 
243 aa  279  3e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0768  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.07 
 
 
243 aa  279  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0739  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.79 
 
 
269 aa  279  3e-74  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2554  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (amino acid)  56.96 
 
 
256 aa  279  3e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.20723  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0976  ABC transporter-like  56.15 
 
 
254 aa  279  4e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2028  ABC transporter related  55.74 
 
 
242 aa  278  4e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00425116  hitchhiker  0.0013644 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1462  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  55.37 
 
 
246 aa  278  5e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.837039  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1300  general amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.74 
 
 
254 aa  278  6e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748867  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4425  ABC transporter related  55.74 
 
 
254 aa  278  6e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.329357 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4549  ABC transporter related  55.74 
 
 
254 aa  278  6e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6293  ABC transporter related protein  53.69 
 
 
242 aa  278  7e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118906  normal  0.0827304 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1165  glutamine transport ATP-binding protein GlnQ  54.69 
 
 
242 aa  278  7e-74  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.19439  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  54.66 
 
 
246 aa  278  8e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1064  ABC transporter related  56.15 
 
 
252 aa  278  8e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_004310  BR0745  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.79 
 
 
249 aa  277  9e-74  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4041  ABC transporter related  55.6 
 
 
247 aa  278  9e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.662899  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2465  ABC transporter related  55.14 
 
 
249 aa  277  9e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1448  ABC transporter related  54.1 
 
 
251 aa  277  1e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2412  ABC transporter related  55.51 
 
 
250 aa  277  1e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.177058 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1431  ABC transporter related  55.33 
 
 
248 aa  277  1e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0320804 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18720  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  54.51 
 
 
267 aa  277  1e-73  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05950  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  56.15 
 
 
247 aa  276  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3566  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.92 
 
 
252 aa  276  2e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.836501  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03129  predicted amino-acid transporter subunit  54.92 
 
 
252 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0435  ABC transporter related protein  54.92 
 
 
252 aa  276  3e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03080  hypothetical protein  54.92 
 
 
252 aa  276  3e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0125  ABC transporter related protein  54.22 
 
 
246 aa  276  3e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.525287  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0435  ABC transporter related  54.92 
 
 
252 aa  276  3e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.337414 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0055  general L-amino acid transport ATP-binding protein  55.74 
 
 
268 aa  276  3e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4510  ABC transporter related  55.1 
 
 
266 aa  276  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00592633  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2554  ABC transporter related  55.79 
 
 
269 aa  276  3e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0405384  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4592  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.92 
 
 
252 aa  276  3e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.723887  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3466  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.92 
 
 
252 aa  276  3e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0172997  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0502  ABC transporter related  55.51 
 
 
244 aa  276  3e-73  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3757  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  54.92 
 
 
252 aa  276  3e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0539181  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2428  ABC transporter-related protein  57.38 
 
 
264 aa  276  3e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.419191  normal  0.0707207 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3047  ABC transporter related  54.88 
 
 
248 aa  276  3e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.310293  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2223  amino acid permease ATP-binding protein  54.92 
 
 
251 aa  275  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0591  ABC transporter related  56.38 
 
 
255 aa  275  4e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0291942  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0786  ABC transporter, ATP-binding protein  54.51 
 
 
270 aa  275  4e-73  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0020  amino acid ABC transporter ATPase  55.33 
 
 
256 aa  275  5e-73  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.732673  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1075  ABC transporter  54.92 
 
 
254 aa  275  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.520778  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  55.56 
 
 
244 aa  275  5e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2054  general L-amino acid transport ATP-binding subunit  53.28 
 
 
249 aa  275  6e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.3926  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0396  ABC transporter related  55.14 
 
 
262 aa  275  6e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.254108  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>