More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1608 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 113 aa  227  4e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  51.89 
 
 		 111 aa  123  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  48.54 
 
 		 129 aa  108  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  44.76 
 
 		 132 aa  98.6  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  48.39 
 
 		 113 aa  98.6  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  52.22 
 
 		 114 aa  97.1  7e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  47.52 
 
 		 114 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 125 aa  95.5  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 129 aa  95.1  2e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 138 aa  94.4  5e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 129 aa  92.8  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  40.95 
 
 		 129 aa  92.4  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  46.74 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1891  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 129 aa  91.3  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  46.74 
 
 		 135 aa  91.3  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1702  transcriptional regulator, ArsR family  43.43 
 
 		 137 aa  90.9  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000822998 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  42.27 
 
 		 112 aa  91.3  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 124 aa  88.6  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 111 aa  89  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  47.13 
 
 		 120 aa  88.2  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2313  ArsR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 114 aa  87  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 120 aa  84.3  5e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 106 aa  83.6  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0476  transcriptional regulator, ArsR family  42.86 
 
 		 110 aa  83.2  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  44.09 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  40.4 
 
 		 118 aa  79.3  0.00000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  46.43 
 
 		 120 aa  79.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4684  ArsR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.504517  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 127 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29211  regulatory proteins, ArsR family protein  48.1 
 
 		 101 aa  73.6  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0938  ArsR family transcriptional regulator  42.53 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249211  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 118 aa  73.2  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 106 aa  72.8  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  46.07 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  46.07 
 
 		 112 aa  72  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13760  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 125 aa  71.6  0.000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.933244  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  38.14 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1486  ArsR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 138 aa  68.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 		 106 aa  68.2  0.00000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2011  regulatory protein, ArsR  39.29 
 
 		 135 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184845  normal  0.0811991 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  43.59 
 
 		 121 aa  67.8  0.00000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 109 aa  66.2  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0432  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 111 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.714368 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1488  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1510  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.836055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2135  ArsR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  2.25327e-28  decreased coverage  0.0000795687 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1231  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 95 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  40.7 
 
 		 110 aa  65.5  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2535  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  39.53 
 
 		 122 aa  65.1  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 111 aa  65.5  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0753  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 		 95 aa  65.1  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  34.48 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0136  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0687  regulatory protein ArsR  36.36 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  34.34 
 
 		 108 aa  64.3  0.0000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05920  transcriptional regulator, ArsR family  42.11 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.560602 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  33.7 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0422  transcriptional regulator, ArsR family  44.44 
 
 		 121 aa  63.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3728  regulatory protein, ArsR  37.8 
 
 		 119 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.369834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1901  regulatory protein, ArsR  37.65 
 
 		 141 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 218 aa  62.8  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3138  regulatory protein ArsR  35.29 
 
 		 127 aa  62.4  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1540  transcriptional regulator, ArsR family  30.59 
 
 		 105 aa  62.4  0.000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.26048  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  37.66 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2290  transcription repressor SmtB-like protein  42.05 
 
 		 119 aa  62  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0771617  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3224  regulatory protein, ArsR  35.29 
 
 		 136 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.930108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22370  regulatory protein ArsR  38.37 
 
 		 123 aa  61.6  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3727  regulatory protein, ArsR  35.29 
 
 		 137 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.438217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0633  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0662  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0563  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0505  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0507  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1557  transcriptional regulator, ArsR family  33.68 
 
 		 105 aa  61.2  0.000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0128912  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3726  ArsR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 107 aa  61.2  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.870281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0594  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0722  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1372  ArsR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.792915 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0509  ArsR family transcriptional regulator  40.24 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2827  transcriptional regulator, ArsR family  43.06 
 
 		 115 aa  61.2  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4705  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.22146 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0651  transcriptional regulator, ArsR family  40.24 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000016978 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  36.25 
 
 		 98 aa  60.8  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0511  regulatory protein ArsR  41.77 
 
 		 125 aa  60.8  0.000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0444  ArsR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 126 aa  60.8  0.000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.450624  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  32.94 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2588  putative cadmium resistance transcriptional regulator CadC  40.91 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2927  ArsR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 111 aa  60.5  0.000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1770  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.83595  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1730  transcriptional regulator, ArsR family  41.18 
 
 		 113 aa  60.1  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0742  transcriptional regulator, ArsR family  37.66 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.228515  normal  0.244799 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  42.7 
 
 		 135 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>