More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0078 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0078  PfkB  100 
 
 		 318 aa  605  9.999999999999999e-173  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  42.86 
 
 		 329 aa  220  1.9999999999999999e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  43.71 
 
 		 317 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0369  ribokinase-like domain-containing protein  41.03 
 
 		 322 aa  195  7e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3696  ribokinase-like domain-containing protein  43.77 
 
 		 301 aa  186  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.657474  normal  0.0341375 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2438  PfkB domain protein  42.57 
 
 		 323 aa  182  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1382  PfkB domain protein  41.84 
 
 		 326 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.847746  normal  0.299274 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0949  ribokinase-like domain-containing protein  41.41 
 
 		 301 aa  175  7e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.206012 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01440  sugar kinase, ribokinase  41.97 
 
 		 315 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  39.74 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5056  PfkB domain protein  41.88 
 
 		 320 aa  173  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0189  PfkB family carbohydrate kinase  38.56 
 
 		 339 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  42.75 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2291  PfkB domain protein  39.5 
 
 		 329 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6346  PfkB  39.74 
 
 		 330 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1733  ribokinase-like domain-containing protein  39.74 
 
 		 330 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  36.1 
 
 		 327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5029  ribokinase family sugar kinase  39.02 
 
 		 330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.351369 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0756  PfkB domain protein  39.55 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0819977  normal  0.156556 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1746  ribokinase-like domain-containing protein  39.41 
 
 		 330 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.931195 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2132  PfkB domain protein  41.67 
 
 		 344 aa  162  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29260  sugar kinase, ribokinase  39.09 
 
 		 311 aa  162  6e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.466231 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2296  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  40.92 
 
 		 329 aa  162  7e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1297  2-keto-3-deoxygalactonate kinase / 2-keto-3-deoxygluconate kinase  35.6 
 
 		 308 aa  161  1e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0169  ribokinase-like domain-containing protein  36.33 
 
 		 312 aa  160  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  38.49 
 
 		 328 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5016  PfkB domain protein  41.32 
 
 		 321 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.816187  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0690  PfkB domain protein  37.91 
 
 		 329 aa  160  3e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.107436  normal  0.316336 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1654  ribokinase-like domain-containing protein  38.89 
 
 		 330 aa  158  9e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.290792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2096  putative 2-keto-gluconokinase  39.27 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2288  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.27 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3887  PfkB domain-containing protein  36.57 
 
 		 314 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.316925  normal  0.428898 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1654  ribokinase-like domain-containing protein  38.89 
 
 		 330 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.909879 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2154  putative 2-keto-gluconokinase  39.27 
 
 		 329 aa  157  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0961  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  39.27 
 
 		 329 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  37.22 
 
 		 320 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  35.05 
 
 		 317 aa  156  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0933  PfkB domain protein  32.36 
 
 		 313 aa  155  1e-36  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0971681  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  36.25 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0059  ribokinase-like domain-containing protein  34.2 
 
 		 319 aa  153  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  38.46 
 
 		 340 aa  153  5e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4291  PfkB domain protein  40.97 
 
 		 342 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.672218 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5479  PfkB domain protein  44.36 
 
 		 321 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1486  ribokinase-like domain-containing protein  36.98 
 
 		 315 aa  149  7e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0722  PfkB domain protein  40.13 
 
 		 363 aa  149  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.140829 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2428  PfkB domain protein  40.73 
 
 		 318 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000311556  hitchhiker  0.00635887 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1865  ribokinase-like domain-containing protein  40.22 
 
 		 320 aa  147  3e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.314409  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  32.18 
 
 		 320 aa  146  5e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2566  ribokinase-like domain-containing protein  37.17 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.255946  normal  0.104834 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2979  putative 2-ketogluconate kinase  37.3 
 
 		 316 aa  142  8e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.441094  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5491  PfkB domain protein  41.52 
 
 		 320 aa  141  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.386009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26890  2-ketogluconate kinase  36.51 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00940196  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0442  PfkB domain protein  28.17 
 
 		 326 aa  139  4.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3215  PfkB domain protein  33.66 
 
 		 317 aa  139  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2902  PfkB  34.41 
 
 		 345 aa  139  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.358173  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2380  ribokinase-like domain-containing protein  36.84 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1626  PfkB domain protein  39.49 
 
 		 319 aa  138  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  0.814532 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35340  putative 2-ketogluconate kinase  37.82 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00857937  normal  0.115887 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0130  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  30.46 
 
 		 320 aa  138  1e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3378  PfkB domain protein  36.51 
 
 		 316 aa  136  5e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0607501 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2067  ribokinase-like domain-containing protein  36.68 
 
 		 324 aa  136  6.0000000000000005e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0314864  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0115  PfkB domain protein  29.58 
 
 		 313 aa  133  5e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0274  PfkB  35.46 
 
 		 306 aa  132  6e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0936  PfkB  34.8 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0963  PfkB  34.8 
 
 		 308 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.371081  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1358  2-keto-3-deoxygluconate kinase  36.66 
 
 		 291 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  32.39 
 
 		 323 aa  127  2.0000000000000002e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1489  ribokinase-like domain-containing protein  35.58 
 
 		 308 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.538606  normal  0.0997526 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2569  ribokinase-like domain-containing protein  35.44 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4676  PfkB domain protein  39.22 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0212656  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5081  ribokinase family sugar kinase  34.83 
 
 		 308 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.89362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  33.64 
 
 		 645 aa  124  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2870  PfkB domain protein  33.22 
 
 		 318 aa  124  3e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6298  PfkB  33.33 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1781  ribokinase-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 308 aa  123  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630486  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3008  PfkB domain protein  37.86 
 
 		 343 aa  123  4e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.554278  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2509  PfkB domain protein  31.07 
 
 		 317 aa  123  5e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.893739 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2277  PfkB domain protein  33.43 
 
 		 332 aa  122  6e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.262567  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0502  2-dehydro-3-deoxygluconokinase  29.25 
 
 		 320 aa  122  6e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0463  PfkB domain protein  33.77 
 
 		 318 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.949852 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1806  ribokinase-like domain-containing protein  33.71 
 
 		 308 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.420282 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4198  PfkB domain protein  34.57 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1671  PfkB domain protein  28.3 
 
 		 338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4308  PfkB domain protein  34.57 
 
 		 308 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.600778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  34.63 
 
 		 312 aa  120  3.9999999999999996e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2594  PfkB  39.64 
 
 		 319 aa  119  7e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.2534  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  29.22 
 
 		 319 aa  119  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  34.08 
 
 		 642 aa  118  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3485  PfkB domain protein  33.14 
 
 		 347 aa  118  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0227  ribokinase-like domain-containing protein  28.97 
 
 		 344 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.068215  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  29.55 
 
 		 338 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1721  ribokinase-like domain-containing protein  33.71 
 
 		 308 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2283  PfkB domain protein  32.56 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.196107  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1380  PfkB domain protein  28.44 
 
 		 331 aa  117  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000087223  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05074  putative fructokinase-like protein (sugar kinase)  33.83 
 
 		 309 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  29.74 
 
 		 317 aa  115  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0974  ribokinase-like domain-containing protein  32.37 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.715323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2077  ribokinase-like domain-containing protein  31.37 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2113  ribokinase-like domain-containing protein  31.37 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398904  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2385  PfkB domain protein  28.66 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>