More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3509 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3509  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 125 aa  248  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  0.542318 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3759  response regulator receiver protein  48.65 
 
 		 127 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.514361  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2532  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3337  hypothetical protein  40.74 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.244169  normal  0.34569 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5004  response regulator receiver protein  40.35 
 
 		 118 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.325761  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1629  response regulator receiver domain-containing protein  38.89 
 
 		 129 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.324074  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4279  response regulator receiver protein  44.58 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7970  response regulator receiver and SARP domain protein  40.37 
 
 		 160 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304155  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  44.3 
 
 		 631 aa  67.4  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5707  response regulator receiver protein  36.19 
 
 		 127 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5346  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 118 aa  66.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1396  response regulator receiver domain-containing protein  36.04 
 
 		 117 aa  65.1  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.230809  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2608  response regulator receiver protein  38.89 
 
 		 114 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  39.25 
 
 		 842 aa  65.1  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1920  response regulator receiver protein  38.05 
 
 		 126 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6261  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  38.38 
 
 		 121 aa  64.7  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235266  normal  0.732793 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5238  response regulator receiver protein  46.43 
 
 		 127 aa  64.3  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  normal  0.262734 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6449  response regulator receiver protein  39.64 
 
 		 121 aa  64.3  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2338  response regulator receiver protein  47.5 
 
 		 127 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0449719  normal  0.223899 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5585  response regulator receiver protein  33.06 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5541  response regulator  35.51 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  39.09 
 
 		 856 aa  63.5  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  43.37 
 
 		 852 aa  63.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  39.42 
 
 		 559 aa  62.8  0.000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5233  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.58 
 
 		 384 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3435  response regulator receiver protein  37.86 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465011  normal  0.396609 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4327  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  36.75 
 
 		 875 aa  61.6  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4853  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.73 
 
 		 457 aa  62  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231814  hitchhiker  0.00735887 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3671  Sigma 54 interacting domain protein  36.61 
 
 		 657 aa  62  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1200  response regulator receiver protein  41.38 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0677  putative two component-response regulator receiver (CheY-like protein)  40 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.339833 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0074  response regulator receiver protein  39.42 
 
 		 129 aa  61.2  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4155  response regulator receiver domain-containing protein  35.29 
 
 		 123 aa  61.2  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.918011  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2183  response regulator receiver protein  40.37 
 
 		 134 aa  60.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  38.32 
 
 		 855 aa  60.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0268  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.94 
 
 		 651 aa  60.5  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1296  response regulator receiver protein  36.54 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0556  response regulator receiver  35.14 
 
 		 140 aa  59.7  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.032469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1289  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.704465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  43.59 
 
 		 846 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4234  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 121 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2241  response regulator receiver protein  38.26 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.926249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1965  response regulator receiver  38.26 
 
 		 126 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.132523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 602 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0272  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 128 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.820027  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0109  response regulator receiver  36.94 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4798  response regulator receiver protein  36.04 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.107601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0773  response regulator receiver  38.24 
 
 		 149 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2323  response regulator receiver protein  40.96 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.03657 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4933  response regulator receiver protein  33.64 
 
 		 121 aa  58.2  0.00000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124626  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2937  response regulator receiver protein  34.43 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.972944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4846  response regulator receiver protein  37.17 
 
 		 126 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  31.58 
 
 		 844 aa  57.4  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0019  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 		 639 aa  57  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3363  response regulator receiver protein  36.94 
 
 		 133 aa  57.4  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.387857 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6265  response regulator receiver protein  38.18 
 
 		 136 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0470  response regulator receiver protein  38.53 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  40.62 
 
 		 849 aa  57  0.00000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 1111 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0708  response regulator receiver protein  41.67 
 
 		 123 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  0.880104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  34.82 
 
 		 1096 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2485  response regulator  31.36 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1267  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  35.96 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862788 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7958  response regulator receiver protein  33.66 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0022  response regulator receiver and SARP domain protein  34.78 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2023  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 159 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2069  response regulator receiver domain-containing protein  33.75 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.240465  normal  0.487014 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2032  response regulator receiver protein  35.45 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  32.43 
 
 		 856 aa  55.1  0.0000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5235  response regulator receiver protein  35.87 
 
 		 131 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0801642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0440  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0544928  normal  0.588008 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0407  response regulator receiver  34.71 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.459485 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0475  response regulator receiver protein  34.71 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2363  response regulator receiver protein  36.25 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549917  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0646  response regulator receiver domain-containing protein  34.45 
 
 		 139 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6551  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  32.14 
 
 		 129 aa  54.7  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2986  response regulator receiver protein  34.55 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0621  response regulator receiver protein  36.17 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2193  response regulator  32.73 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0128803  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0738  response regulator receiver domain-containing protein  41.28 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0102  response regulator, putative  32.74 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.248594  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0099  putative response regulator  32.74 
 
 		 124 aa  53.5  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6064  response regulator receiver domain-containing protein  37.62 
 
 		 126 aa  53.5  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6401  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2399  response regulator receiver protein  31.73 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0186457 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2384  response regulator receiver  34.43 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00466139  normal  0.125866 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0115  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  31.3 
 
 		 481 aa  52  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1726  response regulator receiver protein  40 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1934  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 476 aa  52  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.808753  normal  0.132653 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0073  response regulator receiver protein  35.9 
 
 		 144 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5095  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  40 
 
 		 448 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.262214 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3234  response regulator receiver protein  33.93 
 
 		 207 aa  52  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0140449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1001  response regulator receiver protein  34.21 
 
 		 120 aa  52  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283402  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1784  response regulator receiver domain-containing protein  37.66 
 
 		 124 aa  51.6  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474362  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4303  putative two-component response regulator protein  31.87 
 
 		 130 aa  51.6  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3239  two-component response regulator  36.73 
 
 		 235 aa  51.6  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2520  response regulator receiver domain-containing protein  33.33 
 
 		 125 aa  50.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.113297  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0431  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 124 aa  50.8  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0769354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0148  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 448 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.837927 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>