More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2104 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2104  ABC transporter component  100 
 
 		 264 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1748  ABC transporter related  67.42 
 
 		 264 aa  353  2e-96  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1947  ABC transporter related  67.42 
 
 		 264 aa  353  2e-96  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.477016  normal  0.349831 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1209  ABC transporter-related protein  65.53 
 
 		 264 aa  349  3e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0487778 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3143  ABC transporter-related protein  67.05 
 
 		 264 aa  349  3e-95  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.288919  normal  0.982216 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4313  ABC transporter related  66.67 
 
 		 264 aa  342  2.9999999999999997e-93  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.887716  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3142  ABC transporter, ATP-binding protein  65.53 
 
 		 264 aa  342  4e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0690  ABC transport system ATP-binding protein  65.53 
 
 		 264 aa  342  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.553471  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0442  ABC transporter, ATP-binding protein  65.53 
 
 		 264 aa  342  4e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0762699  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1087  ABC transporter related  63.64 
 
 		 264 aa  342  4e-93  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0111  ABC transporter, ATP-binding protein  65.53 
 
 		 264 aa  342  4e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1477  ABC transporter, ATP-binding protein  65.53 
 
 		 264 aa  342  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0524  ABC transporter, ATP-binding protein  65.53 
 
 		 264 aa  342  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2905  ABC transporter, ATP-binding protein  65.53 
 
 		 264 aa  342  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0507  ABC transporter, ATP-binding protein  65.53 
 
 		 264 aa  340  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1313  ABC transporter related  65.15 
 
 		 264 aa  340  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2040  ABC transporter-related protein  65.53 
 
 		 264 aa  340  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0865072 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1714  ABC transporter related  63.5 
 
 		 264 aa  339  2.9999999999999998e-92  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0481461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0474  ABC transporter related  64.77 
 
 		 264 aa  338  5e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.753612  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1504  ABC transporter related  64.39 
 
 		 264 aa  337  8e-92  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1601  ABC transporter related  63.12 
 
 		 264 aa  337  9.999999999999999e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.81737 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6159  ABC transporter, ATPase subunit  64.39 
 
 		 264 aa  335  2.9999999999999997e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1275  ABC transporter ATP-binding protein  67.8 
 
 		 264 aa  335  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1437  ABC transporter, ATPase subunit  62.74 
 
 		 264 aa  334  7.999999999999999e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.432186 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1463  ABC transporter related  63.64 
 
 		 264 aa  334  7.999999999999999e-91  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.466344  hitchhiker  0.000000593097 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14370  putative ABC-transporter ATP-binding component  67.42 
 
 		 264 aa  334  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1738  ABC transporter ATP-binding protein  64.02 
 
 		 264 aa  333  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.924585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2840  ABC transporter related  64.39 
 
 		 264 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2216  ABC transporter related  64.39 
 
 		 264 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315955  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2829  ABC transporter related  64.39 
 
 		 264 aa  332  3e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0235677  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1951  ABC transporter related  64.77 
 
 		 264 aa  326  2.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.168978  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3065  ABC transporter related  60.98 
 
 		 264 aa  311  1e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4044  ABC transporter related  59.85 
 
 		 264 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0823  ABC transporter ATP-binding protein  57.89 
 
 		 267 aa  303  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0106274 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3721  ABC transporter related  58.33 
 
 		 264 aa  304  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002972  ABC transporter ATP-binding protein  59.7 
 
 		 264 aa  302  4.0000000000000003e-81  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2869  ABC transporter related  59.62 
 
 		 265 aa  292  3e-78  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02938  hypothetical protein  59.7 
 
 		 264 aa  290  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0865  ABC transporter related  55.89 
 
 		 264 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0621  ABC transporter, ATP-binding protein  60.41 
 
 		 245 aa  288  6e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.183641  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1976  ABC transporter, ATP-binding protein  55.51 
 
 		 264 aa  284  1.0000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.333354  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2056  ABC transporter, ATP-binding protein  55.51 
 
 		 264 aa  283  2.0000000000000002e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0323  hypothetical protein  50.95 
 
 		 264 aa  273  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0704987  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19970  ABC transporter related  53.49 
 
 		 265 aa  269  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0719287  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0049  ABC transporter, ATP-binding protein  53.23 
 
 		 264 aa  268  5.9999999999999995e-71  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2830  ABC transporter related  50.76 
 
 		 267 aa  267  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0251  ABC transporter ATP-binding protein  47.88 
 
 		 267 aa  263  2e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000273  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03830  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  53.75 
 
 		 263 aa  263  2e-69  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2163  ABC transporter related  51.71 
 
 		 264 aa  262  4.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.573773 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4551  ABC transporter related  50 
 
 		 264 aa  258  1e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000329769  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2076  ABC transporter, ATP-binding protein  46.92 
 
 		 267 aa  255  6e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000172805  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1945  ABC transporter related  49.22 
 
 		 264 aa  254  7e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.446826  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0630  ABC transporter related  52.65 
 
 		 263 aa  251  9.000000000000001e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.764744  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2854  ABC transporter related protein  49.61 
 
 		 264 aa  248  8e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2586  ABC transporter related protein  47.86 
 
 		 262 aa  244  9e-64  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000199395  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0659  ABC transporter related  48.48 
 
 		 264 aa  242  5e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.548438  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1571  ABC transporter related  51.57 
 
 		 265 aa  241  9e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.865643  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2862  ABC transporter related protein  48.82 
 
 		 270 aa  241  9e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0212  ABC transporter, ATP-binding protein  42.05 
 
 		 265 aa  240  2e-62  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.272765  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1475  ABC transporter related protein  49.61 
 
 		 265 aa  239  5e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0738  ABC transporter related  41.67 
 
 		 265 aa  238  5e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000124437 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0725  ABC transporter related protein  42.05 
 
 		 265 aa  236  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.129055  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1111  ABC transporter, ATPase subunit  49 
 
 		 260 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0075  ABC transporter related  50.21 
 
 		 282 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1118  ABC transporter, ATPase subunit  49 
 
 		 270 aa  231  7.000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.505252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1504  ABC transporter related  47.37 
 
 		 296 aa  222  4.9999999999999996e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0207  ABC transporter related protein  45.16 
 
 		 262 aa  219  3e-56  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2225  ABC transporter related  39.36 
 
 		 257 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0489859  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2362  ABC transporter related protein  43.23 
 
 		 261 aa  209  5e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000588091  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0044  ABC transporter related  39.76 
 
 		 251 aa  199  3.9999999999999996e-50  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1153  ABC transporter ATP-binding protein  44.86 
 
 		 252 aa  194  1e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0266393  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1819  ABC transporter related  40.83 
 
 		 254 aa  192  3e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000182766  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0269  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  41.67 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43348  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0077  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  41.45 
 
 		 251 aa  188  7e-47  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1187  ABC transporter, ATP-binding protein  43.17 
 
 		 253 aa  187  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0260  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  43.23 
 
 		 254 aa  185  5e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1100  ABC transporter related  36.8 
 
 		 242 aa  157  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4373  ABC transporter related  42.38 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6033  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  34.87 
 
 		 349 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  32.39 
 
 		 240 aa  108  9.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0137  cobalt transporter ATP-binding subunit  33.91 
 
 		 290 aa  107  1e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1010  ABC transporter related  30.77 
 
 		 272 aa  106  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000205509  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3261  ABC transporter ATP-binding protein  37.44 
 
 		 246 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2682  cobalt transporter ATP-binding subunit  30.74 
 
 		 285 aa  107  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.150341  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3636  ABC transporter related  31.44 
 
 		 286 aa  106  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375654  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0141  cobalt transporter ATP-binding subunit  34.47 
 
 		 291 aa  106  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000352159  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  38.53 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2936  cobalt transporter ATP-binding subunit  32.47 
 
 		 281 aa  105  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1473  ABC transporter-like protein  34.74 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1025  ABC transporter related  35.07 
 
 		 362 aa  104  1e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0291  cell division ATP-binding protein FtsE, putative  32.49 
 
 		 228 aa  104  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000390691  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  37.85 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1948  cobalt ABC transporter ATPase  31.7 
 
 		 289 aa  103  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.701043  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1370  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.36 
 
 		 373 aa  104  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0791  ABC transporter related  30.6 
 
 		 280 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0233186  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2363  high-affinity branched chain amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  33.76 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  36.49 
 
 		 257 aa  103  3e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4942  ABC transporter related protein  37.44 
 
 		 339 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0955475  normal  0.393607 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1486  ABC transporter related  34.93 
 
 		 358 aa  103  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00353537  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  34.96 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>