More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0408 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0408  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  513  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3483  hypothetical protein  63.81 
 
 		 257 aa  328  4e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2870  hypothetical protein  62.11 
 
 		 260 aa  306  2.0000000000000002e-82  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2459  ABC transporter, inner membrane subunit  59.92 
 
 		 260 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.584552  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1122  hypothetical protein  59.92 
 
 		 260 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.195173 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1852  protein of unknown function DUF140  62.26 
 
 		 261 aa  301  8.000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1067  hypothetical protein  58.73 
 
 		 260 aa  298  4e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.312621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0014  hypothetical protein  54.9 
 
 		 264 aa  289  3e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.394088  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1738  hypothetical protein  59.2 
 
 		 260 aa  278  6e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.025954  normal  0.425979 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2379  hypothetical protein  55.86 
 
 		 258 aa  275  7e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.644527 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1329  hypothetical protein  55.12 
 
 		 270 aa  272  3e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.116361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1780  hypothetical protein  52.17 
 
 		 260 aa  269  2.9999999999999997e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.117267 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1577  hypothetical protein  56.57 
 
 		 268 aa  259  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.303696 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0676  protein of unknown function DUF140  51.87 
 
 		 256 aa  247  1e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.496775 
 
 
-
 
NC_002978  WD0989  hypothetical protein  47.01 
 
 		 260 aa  245  4.9999999999999997e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.348409  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0050  hypothetical protein  49.4 
 
 		 265 aa  244  9.999999999999999e-64  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0084  hypothetical protein  51 
 
 		 275 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.485873  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3690  hypothetical protein  52.16 
 
 		 252 aa  228  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3181  protein of unknown function DUF140  46.83 
 
 		 261 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.35104  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0562  hypothetical protein  48.18 
 
 		 256 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000209401  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1039  hypothetical protein  45.78 
 
 		 256 aa  210  2e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1976  hypothetical protein  45.15 
 
 		 250 aa  202  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.45767  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0817  hypothetical protein  46.96 
 
 		 257 aa  201  8e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.879823  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0788  hypothetical protein  45.63 
 
 		 257 aa  200  1.9999999999999998e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2082  protein of unknown function DUF140  43.51 
 
 		 251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1863  ABC amino acid transporter, inner membrane subunit  43.51 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.685467  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1997  protein of unknown function DUF140  43.51 
 
 		 251 aa  196  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0327  hypothetical protein  42.91 
 
 		 258 aa  193  2e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.650486  normal  0.733671 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0447  ABC-type toluene export protein  41.86 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000256221  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0365  protein of unknown function DUF140  42.75 
 
 		 246 aa  189  4e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2890  hypothetical protein  45.81 
 
 		 258 aa  188  7e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1687  hypothetical protein  42.17 
 
 		 263 aa  183  2.0000000000000003e-45  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1245  hypothetical protein  41.04 
 
 		 257 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0697  putative ABC transporter, permease protein  42.86 
 
 		 250 aa  181  9.000000000000001e-45  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1900  transporter, putative  41.41 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0473  hypothetical protein  44.44 
 
 		 258 aa  180  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000261611  unclonable  0.00000724337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4107  protein of unknown function DUF140  41.74 
 
 		 263 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.2496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4068  protein of unknown function DUF140  41.74 
 
 		 263 aa  179  4e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2064  protein of unknown function DUF140  41.63 
 
 		 260 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.478173  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2450  hypothetical protein  40.89 
 
 		 266 aa  176  2e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0685  hypothetical protein  43.26 
 
 		 250 aa  175  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1009  protein of unknown function DUF140  39.84 
 
 		 263 aa  175  6e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000708007  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0402  hypothetical protein  41.13 
 
 		 258 aa  175  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.738566  normal  0.849154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1271  hypothetical protein  45.07 
 
 		 255 aa  175  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.584401  hitchhiker  0.000000000788442 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3706  hypothetical protein  41.77 
 
 		 258 aa  175  7e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.311916  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0378  hypothetical protein  42.86 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.82879 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1507  protein of unknown function DUF140  39.06 
 
 		 258 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.621937 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2734  protein of unknown function DUF140  39.06 
 
 		 258 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3003  protein of unknown function DUF140  41.3 
 
 		 264 aa  172  3.9999999999999995e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3053  hypothetical protein  43.48 
 
 		 249 aa  172  5.999999999999999e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.982265  normal  0.151455 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2297  hypothetical protein  39.76 
 
 		 270 aa  171  1e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.346227  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1816  hypothetical protein  41.7 
 
 		 267 aa  170  2e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2257  hypothetical protein  41.81 
 
 		 265 aa  170  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.218555  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0159  protein of unknown function DUF140  39.02 
 
 		 266 aa  170  3e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.821509 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0705  protein of unknown function DUF140  38.33 
 
 		 269 aa  169  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.316668  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1694  protein of unknown function DUF140  40.82 
 
 		 247 aa  168  7e-41  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0852  protein of unknown function DUF140  38.49 
 
 		 267 aa  168  8e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0347867 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4314  hypothetical protein  38.24 
 
 		 252 aa  167  1e-40  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.450744  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0159  toluene tolerance protein Ttg2B, putative  38.28 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0338  protein of unknown function DUF140  38.28 
 
 		 260 aa  167  2e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.521263 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0760  protein of unknown function DUF140  35.69 
 
 		 266 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4570  protein of unknown function DUF140  41.98 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0208  protein of unknown function DUF140  36.44 
 
 		 268 aa  164  1.0000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00143644  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0250  protein of unknown function DUF140  42.92 
 
 		 248 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.233193 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0468  protein of unknown function DUF140  37.5 
 
 		 380 aa  163  3e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5027  ABC transporter permease  35.69 
 
 		 265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57870  ABC transporter permease  35.69 
 
 		 265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4256  hypothetical protein  35.97 
 
 		 265 aa  161  9e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2886  ABC-type transporter inner membrane protein  38.16 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.201575  normal  0.797194 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0966  hypothetical protein  35.97 
 
 		 265 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0959  hypothetical protein  35.97 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1886  protein of unknown function DUF140  41.35 
 
 		 328 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0998  hypothetical protein  35.97 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0741  protein of unknown function DUF140  38.28 
 
 		 267 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.121135  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2708  hypothetical protein  35.25 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2692  hypothetical protein  37.22 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.327255  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3369  hypothetical protein  32.69 
 
 		 261 aa  158  1e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.512056  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0415  hypothetical protein  37.22 
 
 		 255 aa  157  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.177362  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3513  ABC transporter, inner membrane subunit  37.22 
 
 		 255 aa  156  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.525641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1524  hypothetical protein  39.81 
 
 		 261 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0162884  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3208  hypothetical protein  40.23 
 
 		 256 aa  156  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1205  hypothetical protein  36.33 
 
 		 377 aa  156  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.111508 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0342  hypothetical protein  37.22 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.610119 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0318  hypothetical protein  37.44 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.256439  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0394  hypothetical protein  37.22 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.138543  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2119  hypothetical protein  35.04 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0333  hypothetical protein  37.22 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2769  hypothetical protein  37.44 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.686184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0490  protein of unknown function DUF140  40.53 
 
 		 257 aa  156  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0560  hypothetical protein  34.73 
 
 		 259 aa  156  4e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4535  hypothetical protein  32.44 
 
 		 258 aa  155  6e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0023  transporter, putative  40 
 
 		 250 aa  155  7e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0797  protein of unknown function DUF140  37.27 
 
 		 269 aa  155  8e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.841347  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1494  protein of unknown function DUF140  42.38 
 
 		 375 aa  155  8e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000338364  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3258  hypothetical protein  36.55 
 
 		 258 aa  155  8e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3314  protein of unknown function DUF140  36.78 
 
 		 245 aa  155  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.602612  hitchhiker  0.000176122 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2986  ABC transporter, permease  35.65 
 
 		 263 aa  154  9e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2342  protein of unknown function DUF140  38.03 
 
 		 253 aa  154  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.913392  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0497  hypothetical protein  31.3 
 
 		 265 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000163083  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0734  hypothetical protein  33.2 
 
 		 260 aa  154  1e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.336602 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>