More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0069 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  100 
 
 		 336 aa  672    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  62.82 
 
 		 326 aa  395  1e-109  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  63.49 
 
 		 333 aa  386  1e-106  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0067  ABC transporter related  61.66 
 
 		 319 aa  386  1e-106  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.269646 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2760  ABC transporter related  59.62 
 
 		 318 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  61.59 
 
 		 307 aa  366  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4185  ABC transporter related  58.41 
 
 		 320 aa  359  4e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  56.74 
 
 		 335 aa  353  2.9999999999999997e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2913  ABC transporter ATP binding protein  59.35 
 
 		 321 aa  351  8.999999999999999e-96  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.334365  normal  0.685369 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  59.28 
 
 		 319 aa  350  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  53.82 
 
 		 309 aa  295  7e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0881  ABC transporter-related protein  54.18 
 
 		 309 aa  288  9e-77  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  53.49 
 
 		 309 aa  288  1e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  49.83 
 
 		 310 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  49.83 
 
 		 310 aa  280  4e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  49.68 
 
 		 308 aa  278  1e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3671  ABC transporter, ATP-binding protein  49.2 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.185943  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3729  ABC transporter, ATP-binding protein  49.2 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374644  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3698  ABC transporter, ATP-binding protein  49.2 
 
 		 308 aa  276  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2719  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 308 aa  276  5e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2770  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 313 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3234  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 313 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0864209  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1783  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 		 313 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  48.68 
 
 		 319 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  49.83 
 
 		 316 aa  274  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2998  ABC transporter, ATP-binding protein  50.66 
 
 		 336 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.863941  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  49.51 
 
 		 316 aa  274  2.0000000000000002e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  49.35 
 
 		 308 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  49.67 
 
 		 308 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  53.51 
 
 		 309 aa  273  4.0000000000000004e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0420  ABC transporter related  49.35 
 
 		 308 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.344346  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  48.7 
 
 		 308 aa  272  6e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0399  ABC transporter related  49.35 
 
 		 308 aa  272  7e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928709 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  49.34 
 
 		 308 aa  272  7e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  49.17 
 
 		 321 aa  271  1e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  50.34 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3234  ABC transporter related  49.17 
 
 		 321 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67956  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  48.69 
 
 		 319 aa  270  2e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  50 
 
 		 305 aa  269  5.9999999999999995e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4456  ABC transporter related  50.68 
 
 		 319 aa  268  8e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2744  ABC transporter related  45.9 
 
 		 309 aa  268  8.999999999999999e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  45.6 
 
 		 318 aa  268  8.999999999999999e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  47.4 
 
 		 325 aa  267  2e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1778  ABC transporter related  43.97 
 
 		 320 aa  267  2e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.627055  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2956  ABC transporter ATP-binding protein  48.5 
 
 		 321 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.513437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2687  ABC transporter related  48.7 
 
 		 308 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152044  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  47.49 
 
 		 297 aa  265  1e-69  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1983  ABC transporter related  45.39 
 
 		 308 aa  265  1e-69  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.063118  normal  0.0186324 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3269  ABC transporter related  45.51 
 
 		 329 aa  263  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0342  ABC transporter related  49.32 
 
 		 306 aa  264  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.568895  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0163  ABC transporter, ATP-binding protein  49.32 
 
 		 306 aa  264  2e-69  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0703  ABC transporter related  48.86 
 
 		 310 aa  263  3e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0518791 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1079  ABC transporter related protein  45.02 
 
 		 325 aa  262  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  48.34 
 
 		 325 aa  262  6.999999999999999e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6149  putative ABC transporter (ATP binding protein)  44.48 
 
 		 306 aa  262  8e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.397223  normal  0.143638 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  47.67 
 
 		 315 aa  261  1e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0826  putative ATP-binding ABC transporter protein  48.54 
 
 		 334 aa  260  2e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5530  ABC transporter related  46.13 
 
 		 309 aa  259  6e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1019  ABC transporter-related protein  48.85 
 
 		 343 aa  258  8e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0772  ABC transporter, ATP-binding protein  42.9 
 
 		 319 aa  258  1e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4024  ABC transporter related  45.48 
 
 		 306 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3274  ABC multidrug/carbohydrate efflux transporter, ATPase subunit  46.18 
 
 		 308 aa  256  4e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.791052  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3370  ABC transporter related  45.82 
 
 		 306 aa  255  8e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450084 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  43.09 
 
 		 309 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2740  ABC transporter related  45.48 
 
 		 306 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3909  ABC transporter-related protein  41.8 
 
 		 319 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1097  ABC transporter related  42.86 
 
 		 316 aa  254  2.0000000000000002e-66  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2361  ABC transporter, ATPase subunit  43.85 
 
 		 306 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.112898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1498  ABC transporter related  44.16 
 
 		 315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.933175  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  47.16 
 
 		 298 aa  253  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0809  ABC transporter related  46.47 
 
 		 333 aa  253  3e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4007  ABC transporter related  45.85 
 
 		 308 aa  253  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4181  ABC transporter-like  44.08 
 
 		 310 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0746  ABC transporter related  44.11 
 
 		 310 aa  253  5.000000000000001e-66  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1010  ABC transporter, ATP-binding protein  41.06 
 
 		 304 aa  252  6e-66  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156347  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1140  ABC transporter ATP-binding protein  41.06 
 
 		 304 aa  252  6e-66  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000662244  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1895  ABC transporter ATP-binding protein  42.43 
 
 		 310 aa  252  7e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6045  ABC transporter related  44.82 
 
 		 308 aa  252  7e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.463248  normal  0.338507 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2648  ABC transporter related  45.85 
 
 		 318 aa  252  7e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1470  ABC transporter related  42.43 
 
 		 310 aa  251  8.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3232  ABC transporter related  42.52 
 
 		 311 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.479641  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1351  ABC transporter related  43.23 
 
 		 320 aa  251  9.000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3820  ABC transporter related  42.43 
 
 		 310 aa  251  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0978  ABC transporter, ATP-binding protein  47.6 
 
 		 309 aa  251  9.000000000000001e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.080297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3137  ABC transporter related protein  46.56 
 
 		 316 aa  251  9.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00124665  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3141  ABC transporter-related protein  42.14 
 
 		 313 aa  251  1e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  41.67 
 
 		 315 aa  251  2e-65  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1505  ABC transporter related  42.43 
 
 		 310 aa  250  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2277  ABC efflux pump, ATPase subunit  44.82 
 
 		 308 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0775451  normal  0.282727 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4685  ABC transporter related  44.34 
 
 		 315 aa  250  3e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0550662 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2019  ABC transporter related  45.82 
 
 		 306 aa  250  3e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.778403  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1859  ABC transporter related  44.88 
 
 		 307 aa  249  4e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1220  ABC transporter related  44.85 
 
 		 309 aa  248  7e-65  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00788547 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03054  ABC transporter ATP-binding protein  44.98 
 
 		 314 aa  248  9e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0675  ABC transporter related  41.69 
 
 		 308 aa  248  9e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.965541  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0830  ABC transporter related  41.25 
 
 		 312 aa  248  9e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2122  ABC transporter, ATP-binding protein  45.03 
 
 		 308 aa  248  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0606  ABC transporter related  40.67 
 
 		 321 aa  248  1e-64  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  46.52 
 
 		 341 aa  248  1e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  44.22 
 
 		 309 aa  247  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>