More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3242 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3102  glutamate synthase subunit beta  75 
 
 		 488 aa  760    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.541547 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0382  glutamate synthase subunit beta  80.12 
 
 		 488 aa  780    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0306  glutamate synthase subunit beta  79.71 
 
 		 488 aa  780    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2964  glutamate synthase subunit beta  95.07 
 
 		 487 aa  935    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3590  glutamate synthase subunit beta  80.78 
 
 		 489 aa  815    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.633224  hitchhiker  0.00000356893 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2735  glutamate synthase subunit beta  77.25 
 
 		 488 aa  753    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3746  glutamate synthase subunit beta  77.66 
 
 		 488 aa  756    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0218  glutamate synthase (NADH) small subunit  76.84 
 
 		 488 aa  755    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3125  glutamate synthase subunit beta  86.86 
 
 		 487 aa  884    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.996212  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2895  glutamate synthase subunit beta  98.77 
 
 		 487 aa  994    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.944872  normal  0.217171 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3716  glutamate synthase subunit beta  77.66 
 
 		 488 aa  756    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.912921  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1603  glutamate synthase subunit beta  64.79 
 
 		 480 aa  639    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.879773  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2786  glutamate synthase subunit beta  77.25 
 
 		 488 aa  753    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3500  glutamate synthase subunit beta  79.71 
 
 		 488 aa  778    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3689  glutamate synthase subunit beta  77.46 
 
 		 488 aa  755    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3013  glutamate synthase subunit beta  78.28 
 
 		 488 aa  764    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3395  glutamate synthase subunit beta  72.51 
 
 		 491 aa  739    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2934  glutamate synthase subunit beta  71.11 
 
 		 488 aa  728    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0710  glutamate synthase subunit beta  72.76 
 
 		 492 aa  706    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.893657  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0792  glutamate synthase subunit beta  75.2 
 
 		 488 aa  773    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.135801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0366  glutamate synthase subunit beta  80.57 
 
 		 489 aa  811    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.635845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1768  glutamate synthase subunit beta  77.25 
 
 		 488 aa  753    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956795  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3262  glutamate synthase subunit beta  86.24 
 
 		 487 aa  878    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2627  glutamate synthase subunit beta  71.93 
 
 		 488 aa  713    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0331  glutamate synthase subunit beta  79.71 
 
 		 488 aa  805    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.718365  normal  0.62843 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2704  glutamate synthase subunit beta  80.12 
 
 		 488 aa  781    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1153  glutamate synthase subunit beta  75.81 
 
 		 492 aa  774    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0322  glutamate synthase subunit beta  79.92 
 
 		 488 aa  807    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3242  glutamate synthase subunit beta  100 
 
 		 487 aa  1003    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2787  glutamate synthase subunit beta  81.35 
 
 		 505 aa  799    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0403  glutamate synthase subunit beta  80.12 
 
 		 488 aa  781    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.709199  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0095  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  75.36 
 
 		 487 aa  758    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.440417  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5557  glutamate synthase subunit beta  72.71 
 
 		 491 aa  740    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.536283  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0843  glutamate synthase subunit beta  77.62 
 
 		 487 aa  773    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0264  glutamate synthase (NADH) small subunit  63.89 
 
 		 478 aa  644    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153251  normal  0.0665114 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1009  glutamate synthase subunit beta  75.61 
 
 		 492 aa  766    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0684  glutamate synthase subunit beta  74.8 
 
 		 488 aa  763    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.874899 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0742  glutamate synthase subunit beta  72.36 
 
 		 492 aa  702    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0648887  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3217  glutamate synthase subunit beta  77.25 
 
 		 506 aa  753    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2396  glutamate synthase subunit beta  71.75 
 
 		 492 aa  745    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2040  glutamate synthase subunit beta  62.42 
 
 		 479 aa  624  1e-177  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.401643  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3175  glutamate synthase (NADH) small subunit  63.97 
 
 		 477 aa  600  1e-170  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3032  glutamate synthase subunit beta  60.29 
 
 		 472 aa  600  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1963  glutamate synthase subunit beta  62.4 
 
 		 473 aa  590  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3874  glutamate synthase subunit beta  59.88 
 
 		 472 aa  587  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134009 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1137  glutamate synthase subunit beta  58.52 
 
 		 484 aa  578  1e-164  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0331749  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2954  glutamate synthase subunit beta  57.72 
 
 		 484 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4530  glutamate synthase subunit beta  57.31 
 
 		 484 aa  570  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0876  glutamate synthase subunit beta  57.31 
 
 		 484 aa  569  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.490935 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1616  glutamate synthases, NADH/NADPH, small subunit  57.49 
 
 		 488 aa  565  1e-160  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0960  glutamate synthase subunit beta  57.52 
 
 		 484 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.538211  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0760  glutamate synthase subunit beta  57.6 
 
 		 485 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.423731  normal  0.395533 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3777  glutamate synthase subunit beta  56.55 
 
 		 500 aa  561  1.0000000000000001e-159  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5478  glutamate synthase subunit beta  57.03 
 
 		 502 aa  548  1e-155  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2320  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  56.26 
 
 		 496 aa  550  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106456  normal  0.283017 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3465  glutamate synthase subunit beta  55.85 
 
 		 477 aa  546  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.590112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3267  glutamate synthase subunit beta  56.16 
 
 		 477 aa  543  1e-153  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.534293 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1370  glutamate synthase subunit beta  58.52 
 
 		 482 aa  543  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2160  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  53.35 
 
 		 484 aa  544  1e-153  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3591  glutamate synthase subunit beta  56.16 
 
 		 477 aa  543  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.118629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0037  glutamate synthase subunit beta  55.24 
 
 		 477 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.359975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0731  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.62 
 
 		 491 aa  534  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000132905 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2743  glutamate synthase subunit beta  54.49 
 
 		 484 aa  528  1e-148  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.664254  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0707  glutamate synthase (NADH) small subunit  54.47 
 
 		 482 aa  526  1e-148  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153272 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1811  glutamate synthase subunit beta  56.07 
 
 		 476 aa  527  1e-148  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228111  normal  0.213428 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1172  glutamate synthase subunit beta  55.15 
 
 		 477 aa  521  1e-147  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.203047  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3679  glutamate synthase (NADH) small subunit  54.66 
 
 		 471 aa  523  1e-147  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.15931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0119  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  55.31 
 
 		 484 aa  515  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1953  glutamate synthase subunit beta  53.23 
 
 		 489 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1115  glutamate synthase subunit beta  54.53 
 
 		 491 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.765664  normal  0.334154 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3615  glutamate synthase subunit beta  51.7 
 
 		 491 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.28988  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3316  glutamate synthase subunit beta  51.5 
 
 		 491 aa  505  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0108  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.6 
 
 		 488 aa  503  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.808183  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1261  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.51 
 
 		 492 aa  502  1e-141  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.53874  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004467  glutamate synthase [NADPH] small chain  51.91 
 
 		 489 aa  501  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5697  glutamate synthase subunit beta  53.85 
 
 		 488 aa  503  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.159886 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00927  glutamate synthase subunit beta  51.71 
 
 		 489 aa  501  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2865  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  52.02 
 
 		 487 aa  499  1e-140  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000000168893  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5444  glutamate synthase subunit beta  54.02 
 
 		 492 aa  501  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0476  glutamate synthase subunit beta  56.39 
 
 		 473 aa  501  1e-140  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.638304  normal  0.914259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2950  glutamate synthase (NADH) small subunit  52.63 
 
 		 492 aa  495  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.227052  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5065  glutamate synthase subunit beta  53.94 
 
 		 489 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5153  glutamate synthase subunit beta  53.94 
 
 		 489 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.973427 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2563  glutamate synthase subunit beta  50.3 
 
 		 490 aa  496  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2132  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.81 
 
 		 488 aa  495  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.550582  normal  0.12901 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2710  glutamate synthase subunit beta  52.5 
 
 		 485 aa  493  9.999999999999999e-139  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.405041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1174  glutamate synthase (NADH) small subunit  52.75 
 
 		 485 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.153241  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13894  glutamate synthase subunit beta  54.14 
 
 		 488 aa  494  9.999999999999999e-139  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0342  glutamate synthase (NADH) small subunit  53.85 
 
 		 475 aa  492  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20700  glutamate synthase (NADH) small subunit  52.53 
 
 		 488 aa  488  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.176887  normal  0.765232 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3730  glutamate synthase subunit beta  52.3 
 
 		 484 aa  489  1e-137  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.178567  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1692  glutamate synthase subunit beta  50.51 
 
 		 485 aa  491  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0179657  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02910  glutamate synthase (NADH), putative  52.01 
 
 		 2135 aa  485  1e-136  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.844202  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3012  glutamate synthase subunit beta  52.97 
 
 		 480 aa  485  1e-136  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3212  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.7 
 
 		 495 aa  486  1e-136  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5701  glutamate synthase subunit beta  52.43 
 
 		 486 aa  488  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2339  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  49 
 
 		 482 aa  486  1e-136  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3165  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  51.83 
 
 		 484 aa  483  1e-135  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00040465  normal  0.173868 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6713  glutamate synthase, NADH/NADPH, small subunit  50.91 
 
 		 495 aa  480  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1008  glutamate synthase subunit beta  49.2 
 
 		 489 aa  478  1e-134  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>