More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0576 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0576  ABC transporter related  100 
 
 		 264 aa  531  1e-150  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.490377  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0129  ABC transporter related  90.34 
 
 		 264 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0061  ABC transporter related  88.28 
 
 		 269 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0358  ABC transporter related  80 
 
 		 270 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.996244 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7658  putative ABC transporter, ATP-binding protein  80.33 
 
 		 241 aa  395  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0435  ABC transporter related  62.29 
 
 		 245 aa  293  2e-78  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2238  ABC transporter related  58.26 
 
 		 246 aa  288  8e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0769136  normal  0.0562594 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0126  ABC transporter component  60.17 
 
 		 271 aa  279  4e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3169  ABC transporter, ATPase subunit  49.36 
 
 		 250 aa  233  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.386052  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3286  ABC transporter-related protein  48.51 
 
 		 250 aa  223  2e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.874938  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3360  ABC transporter related  48.09 
 
 		 250 aa  222  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1617  ABC transporter related  48.51 
 
 		 259 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.428283 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2783  ABC transporter-related protein  40.97 
 
 		 244 aa  179  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.474433  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  37.3 
 
 		 243 aa  172  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3159  ABC transporter, 2 fused ATPase and 1 inner membrane subunits  40.49 
 
 		 901 aa  171  9e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.827226  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3896  ABC transporter related  40.08 
 
 		 901 aa  169  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.184002 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  37.3 
 
 		 243 aa  168  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3538  ABC transporter related  40 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2686  ABC transporter, ATP-binding protein  36.4 
 
 		 930 aa  163  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1350  ABC transporter, ATP binding/permease protein  38.02 
 
 		 922 aa  163  3e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3660  ABC transporter permease ATP-binding protein  38.02 
 
 		 924 aa  162  4.0000000000000004e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.388882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0018  ABC transporter related  35.16 
 
 		 909 aa  162  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1504  ABC transporter related  38.46 
 
 		 914 aa  160  1e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.13475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0170  ABC-2 type transport system  36.21 
 
 		 925 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.476544  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0167  response regulator receiver domain-containing protein  37.55 
 
 		 921 aa  159  3e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281851 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  38.82 
 
 		 315 aa  159  3e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  35.74 
 
 		 251 aa  160  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1824  ABC transporter related  38.46 
 
 		 926 aa  159  4e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3216  hypothetical protein  38.24 
 
 		 901 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.881603  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.47 
 
 		 317 aa  158  1e-37  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0316  ABC transporter related  36.21 
 
 		 901 aa  158  1e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  36.19 
 
 		 904 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0809  ABC transporter-related protein  38.14 
 
 		 257 aa  156  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9217  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  37.04 
 
 		 913 aa  156  4e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.808205  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4362  ABC transporter related  37.71 
 
 		 322 aa  156  4e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  38.97 
 
 		 314 aa  155  5.0000000000000005e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  37.24 
 
 		 241 aa  155  5.0000000000000005e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4915  ABC transporter related  38.03 
 
 		 933 aa  155  8e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2361  ABC transporter related  38.03 
 
 		 936 aa  155  9e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0787622  normal  0.702477 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03336  fused ribosome-associated ATPase: ATP-binding protein/ATP-binding protein/predicted membrane protein  33.72 
 
 		 911 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0228  ABC transporter related protein  33.72 
 
 		 911 aa  154  1e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03288  hypothetical protein  33.72 
 
 		 911 aa  154  1e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4831  ABC transporter, ATP binding protein  33.72 
 
 		 911 aa  154  1e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0139  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  36.44 
 
 		 1071 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1039  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  36.44 
 
 		 1082 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3775  ABC transporter, ATP binding protein  33.72 
 
 		 911 aa  154  1e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1497  ABC transporter related  38.03 
 
 		 936 aa  154  1e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.47 
 
 		 317 aa  154  1e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1432  ABC transporter related  36.96 
 
 		 908 aa  154  1e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0229  ABC transporter related  33.72 
 
 		 911 aa  154  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3685  ABC transporter, ATP binding protein  33.72 
 
 		 911 aa  154  1e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  35.37 
 
 		 916 aa  154  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3968  ABC transporter, ATP binding protein  33.72 
 
 		 911 aa  154  1e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1309  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  36.44 
 
 		 1071 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2633  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  36.44 
 
 		 1066 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0165  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  36.44 
 
 		 1079 aa  154  1e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.243814  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3836  ABC transporter, ATP binding protein  33.72 
 
 		 911 aa  154  1e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.932304  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.91 
 
 		 317 aa  153  2e-36  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2776  response regulator receiver domain-containing protein  36.44 
 
 		 1089 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.591057  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3446  ABC transporter related  36.32 
 
 		 922 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  37.85 
 
 		 356 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.41 
 
 		 323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0759  ABC transporter related  36.75 
 
 		 918 aa  153  2.9999999999999998e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  37.97 
 
 		 315 aa  152  4e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3577  ABC transporter related  36.32 
 
 		 930 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.06 
 
 		 279 aa  152  4e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2950  ABC transporter related  37.12 
 
 		 943 aa  152  4e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0987  ABC-2:ABC transporter related  36.32 
 
 		 920 aa  152  5e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.149444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0438  RND efflux system, cytoplasmic membrane extrusion protein  36.03 
 
 		 1017 aa  152  5e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  37.5 
 
 		 307 aa  152  5e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  38.89 
 
 		 304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4664  ABC transporter related  38.03 
 
 		 927 aa  152  7e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.113948 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  37.97 
 
 		 912 aa  152  7e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  36.52 
 
 		 308 aa  151  8.999999999999999e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.6 
 
 		 316 aa  151  8.999999999999999e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  37.87 
 
 		 907 aa  151  1e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0522  ABC transporter related  40.27 
 
 		 287 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000861338  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  36.29 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3419  ABC transporter related  36.17 
 
 		 929 aa  150  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  39.73 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16780  ABC transporter, ATP binding/permease hybrid protein  35.63 
 
 		 911 aa  150  2e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200958  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2574  ABC transporter related  35.42 
 
 		 346 aa  150  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2749  ABC transporter related  35.83 
 
 		 346 aa  150  2e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0810  ABC transporter related  34.02 
 
 		 932 aa  150  2e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  36.78 
 
 		 327 aa  150  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2641  ABC transporter related  37.39 
 
 		 346 aa  149  3e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1743  ABC transporter related  35.44 
 
 		 917 aa  149  4e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00128073 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0586  ABC transporter-related protein  38.05 
 
 		 327 aa  149  4e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.737047  hitchhiker  0.000179773 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1684  response regulator receiver domain-containing protein  35.89 
 
 		 919 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00676218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  38.39 
 
 		 306 aa  149  5e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  37.87 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.52 
 
 		 343 aa  149  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  35.02 
 
 		 306 aa  149  6e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1950  ABC transporter related  35.9 
 
 		 921 aa  149  6e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.62728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  38.46 
 
 		 326 aa  149  6e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1264  putative ABC transporter, ATP-binding protein  36.52 
 
 		 308 aa  149  7e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000993133  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1514  ABC transporter related  37 
 
 		 318 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2832  ABC transporter related  37 
 
 		 318 aa  149  7e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.442904  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1523  ABC transporter related  37 
 
 		 318 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0170  response regulator receiver domain-containing protein  35.51 
 
 		 930 aa  148  9e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696598  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>