More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1352 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1352  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
272 aa  534  1e-151  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.15703  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.84 
 
 
272 aa  408  1e-113  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1302  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  55.04 
 
 
258 aa  234  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.12307  hitchhiker  0.00977234 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.8 
 
 
260 aa  209  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.49 
 
 
258 aa  166  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.703839 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3727  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.14 
 
 
258 aa  160  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.358068  hitchhiker  0.00171141 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3027  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.78 
 
 
272 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333155 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1902  short chain dehydrogenase  38.22 
 
 
269 aa  151  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0327948  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1686  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 
269 aa  149  4e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.292744  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4667  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.39 
 
 
234 aa  149  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.01 
 
 
264 aa  149  6e-35  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.52 
 
 
258 aa  145  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.89 
 
 
261 aa  142  8e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16295  predicted protein  37.67 
 
 
237 aa  141  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0303319  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.96 
 
 
277 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
266 aa  139  4.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.71 
 
 
257 aa  137  2e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.706164 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 
264 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.95 
 
 
264 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.95 
 
 
264 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.95 
 
 
264 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.16 
 
 
244 aa  135  5e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2186  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.72 
 
 
248 aa  135  5e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0361624 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.98 
 
 
336 aa  135  6.0000000000000005e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.753592 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.35 
 
 
291 aa  135  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0718028  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.62 
 
 
338 aa  135  8e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.95 
 
 
264 aa  135  9e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4665  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.96 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.871012  hitchhiker  0.000000000383418 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.99 
 
 
252 aa  135  9.999999999999999e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.95 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.56 
 
 
264 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  33.33 
 
 
236 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3758  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.87 
 
 
299 aa  133  3e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.297651  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3453  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.84 
 
 
267 aa  133  3e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.282255  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 
264 aa  133  3e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2674  short chain dehydrogenase  40.21 
 
 
286 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.570073  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  32.56 
 
 
264 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  32.56 
 
 
264 aa  132  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  32.17 
 
 
264 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.45 
 
 
249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1352  oxidoreductase  41.94 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.904457  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3217  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.01 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1321  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.96 
 
 
282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.889604  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4853  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.74 
 
 
248 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154391  normal  0.241568 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5810  short chain dehydrogenase  45.11 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.930868  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4702  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.46 
 
 
272 aa  131  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.315563  normal  0.0714958 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3968  short chain dehydrogenase  31.27 
 
 
269 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0231224  normal  0.018096 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.01 
 
 
262 aa  130  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.207826 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6615  short chain dehydrogenase  38.22 
 
 
271 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.522985  normal  0.0823373 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10780  short chain dehydrogenase  40 
 
 
275 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0194  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.07 
 
 
244 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.39 
 
 
249 aa  130  3e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3292  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 
268 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.392753  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0086  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.1 
 
 
272 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.45 
 
 
314 aa  130  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2596  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.83 
 
 
287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.7335  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  42.16 
 
 
301 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.62 
 
 
276 aa  129  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0943  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.09 
 
 
293 aa  129  6e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2968  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.62 
 
 
272 aa  129  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.118258  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1704  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
327 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151565  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1627  oxidoreductase  35.19 
 
 
255 aa  129  7.000000000000001e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2479  short chain dehydrogenase  38.92 
 
 
279 aa  128  8.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4138  short chain dehydrogenase  41.71 
 
 
303 aa  128  8.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.452621  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.62 
 
 
273 aa  127  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2393  short chain dehydrogenase  38.71 
 
 
344 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.895738 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.87 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000223483  normal  0.996665 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0579  short chain dehydrogenase  33.47 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0389  short chain dehydrogenase  35.25 
 
 
270 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3415  short chain dehydrogenase  33.59 
 
 
268 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.560569  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3588  short chain dehydrogenase  32.28 
 
 
267 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5454  short chain dehydrogenase  35.61 
 
 
342 aa  125  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00420602 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.92 
 
 
317 aa  126  5e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3738  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 
245 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.880926  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0767  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.98 
 
 
330 aa  125  6e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3844  short chain dehydrogenase  34.25 
 
 
267 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000447473 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  39.89 
 
 
283 aa  125  6e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0437  short chain dehydrogenase  32.28 
 
 
267 aa  125  6e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1418  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.47 
 
 
334 aa  125  6e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000382267 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4040  short chain dehydrogenase  34.25 
 
 
267 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0416  short chain dehydrogenase  34.25 
 
 
267 aa  125  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1019  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.58 
 
 
330 aa  125  7e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0961773  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0818  short chain dehydrogenase  38.76 
 
 
242 aa  125  7e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2238  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.01 
 
 
317 aa  125  7e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.63 
 
 
235 aa  125  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0764891  hitchhiker  0.00221105 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3918  short chain dehydrogenase  34.25 
 
 
267 aa  125  8.000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3507  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.94 
 
 
355 aa  125  8.000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2810  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
284 aa  125  9e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.329601  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0441  short chain dehydrogenase  31.89 
 
 
267 aa  125  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00444  short chain dehydrogenase  33.72 
 
 
269 aa  125  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.72 
 
 
256 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0532  short chain dehydrogenase  33.72 
 
 
269 aa  125  1e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0438  short chain dehydrogenase  32.68 
 
 
267 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0572  short chain dehydrogenase  33.72 
 
 
269 aa  124  1e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4281  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 
236 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2737  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.05 
 
 
245 aa  124  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 
277 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000182624  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.97 
 
 
236 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.157663  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0501  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.25 
 
 
264 aa  124  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.132419  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3123  short chain dehydrogenase  33.72 
 
 
256 aa  125  1e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000111305 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>