More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5094 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_5094  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 289 aa  593  1e-168  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347482  normal  0.857753 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3608  enoyl-CoA hydratase  83.1 
 
 		 291 aa  454  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.793375  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  71.82 
 
 		 294 aa  425  1e-118  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0849  enoyl-CoA hydratase  65.67 
 
 		 301 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  61.22 
 
 		 296 aa  360  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5262  enoyl-CoA hydratase  62.37 
 
 		 296 aa  357  9.999999999999999e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509281  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  61.99 
 
 		 290 aa  354  1e-96  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3297  enoyl-CoA hydratase  61.22 
 
 		 296 aa  336  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.0468568 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2124  enoyl-CoA hydratase  60.88 
 
 		 309 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.381981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2021  enoyl-CoA hydratase  61.03 
 
 		 299 aa  329  3e-89  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0583  enoyl-CoA hydratase  54.1 
 
 		 307 aa  327  1.0000000000000001e-88  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0362745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1011  enoyl-CoA hydratase  57 
 
 		 295 aa  325  8.000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.15 
 
 		 297 aa  319  3e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00156943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6455  enoyl-CoA hydratase  58.33 
 
 		 293 aa  317  2e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0438732 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  60.08 
 
 		 282 aa  313  2.9999999999999996e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0752  enoyl-CoA hydratase  54.96 
 
 		 298 aa  290  2e-77  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.620367 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  47.86 
 
 		 291 aa  266  2.9999999999999995e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4488  enoyl-CoA hydratase/isomerase  50.18 
 
 		 290 aa  251  1e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1010  enoyl-CoA hydratase  44.67 
 
 		 292 aa  241  7.999999999999999e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1856  enoyl-CoA hydratase  46.88 
 
 		 288 aa  238  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1394  enoyl-CoA hydratase  44.95 
 
 		 288 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168827  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3638  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.1 
 
 		 293 aa  231  8.000000000000001e-60  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1500  enoyl-CoA hydratase  44.19 
 
 		 285 aa  223  4e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1500  enoyl-CoA hydratase  44.19 
 
 		 285 aa  222  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1523  enoyl-CoA hydratase  44.19 
 
 		 285 aa  222  4e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.61089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.57 
 
 		 274 aa  192  6e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00370  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01890)  40.15 
 
 		 291 aa  183  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.526484  normal  0.612902 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  39.02 
 
 		 294 aa  171  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 		 268 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1754  enoyl-CoA hydratase  39.84 
 
 		 276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1820  enoyl-CoA hydratase  39.45 
 
 		 281 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1773  enoyl-CoA hydratase  39.45 
 
 		 281 aa  166  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 		 275 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  36.67 
 
 		 270 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3400  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.22 
 
 		 269 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.213114  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.67 
 
 		 271 aa  162  7e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  35.34 
 
 		 270 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.94 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.37 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.09 
 
 		 271 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.29 
 
 		 270 aa  159  7e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.86 
 
 		 275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  38.52 
 
 		 270 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.53 
 
 		 273 aa  152  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.64 
 
 		 274 aa  153  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  39.33 
 
 		 265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.56 
 
 		 279 aa  152  5.9999999999999996e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.82 
 
 		 269 aa  151  1e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.59 
 
 		 257 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.96 
 
 		 267 aa  150  2e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  34.57 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.77 
 
 		 264 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2919  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.7 
 
 		 275 aa  148  9e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0811  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.17 
 
 		 281 aa  148  1.0000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.7195  normal  0.177861 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.76 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  35.98 
 
 		 257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  32.48 
 
 		 263 aa  145  1e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  34.8 
 
 		 270 aa  145  1e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2761  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.82 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.0137889 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.71 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 		 273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4295  short chain enoyl-CoA hydratase  36.7 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1904  enoyl-CoA hydratase  35.38 
 
 		 272 aa  140  3.9999999999999997e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526145  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  36.96 
 
 		 269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  34.6 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4101  enoyl-CoA hydratase  36.06 
 
 		 257 aa  139  4.999999999999999e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0715  enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 		 257 aa  139  7e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.000436418  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  31.48 
 
 		 259 aa  139  7e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.36 
 
 		 260 aa  138  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1843  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.58 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0607617  normal  0.0948943 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0932  hypothetical protein  34.36 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0901  hypothetical protein  34.36 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  35.88 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4640  enoyl-CoA hydratase  36.09 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774216  normal  0.012557 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3801  short chain enoyl-CoA hydratase  33.96 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0161017  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.98 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.87 
 
 		 262 aa  137  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0166  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 		 249 aa  137  2e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  33.84 
 
 		 260 aa  137  2e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0299  enoyl-CoA hydratase  34.67 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.57 
 
 		 264 aa  137  2e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2217  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.47616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3521  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.21 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759702  normal  0.0494202 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.14 
 
 		 262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.08 
 
 		 258 aa  136  4e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  34.55 
 
 		 263 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  34.55 
 
 		 263 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  34.55 
 
 		 263 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  32.13 
 
 		 267 aa  135  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  34.55 
 
 		 263 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  34.55 
 
 		 263 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  34.55 
 
 		 263 aa  135  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  34.55 
 
 		 263 aa  135  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0328  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2184  enoyl-CoA hydratase  35.82 
 
 		 257 aa  135  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.182901  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  36.19 
 
 		 265 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3574  enoyl-CoA hydratase  34.47 
 
 		 257 aa  134  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000415637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>