More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0733 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0733  histidine kinase  100 
 
 		 1347 aa  2628    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4147  ATP-binding region ATPase domain protein  25.19 
 
 		 1230 aa  259  3e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.175374 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6300  histidine kinase  32.85 
 
 		 1255 aa  258  8e-67  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.396058 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3020  histidine kinase  34.93 
 
 		 1282 aa  249  2e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.883771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2197  two-component sensor histidine kinase (sensor protein AtoS)  33.25 
 
 		 1234 aa  226  2e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.993549 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03680  nitrogen regulation protein ntrY  30.77 
 
 		 470 aa  226  3e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.177814  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1190  histidine kinase  32.43 
 
 		 484 aa  215  5.999999999999999e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.496715  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0937  histidine kinase  29.19 
 
 		 471 aa  188  7e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1733  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 		 594 aa  174  9e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.756975 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3487  histidine kinase  41.32 
 
 		 581 aa  172  3e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0451928  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3423  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 		 581 aa  172  5e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0671901  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.56 
 
 		 610 aa  168  6.9999999999999995e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0709  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.7 
 
 		 738 aa  166  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000623284  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3342  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  40.77 
 
 		 581 aa  162  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0336288  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0620  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 518 aa  162  5e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0812  nitrogen regulation protein NtrY, putative  40.76 
 
 		 748 aa  161  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.439119  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3408  histidine kinase  41.64 
 
 		 573 aa  160  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.0068838  normal  0.336005 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  39.91 
 
 		 734 aa  158  7e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2344  two component signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 		 752 aa  155  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000619377  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0777  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 		 748 aa  155  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 		 756 aa  155  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.361287  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2624  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.57 
 
 		 729 aa  155  7e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.608847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3361  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 		 756 aa  154  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2738  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.45 
 
 		 749 aa  154  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.789248  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1376  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 		 737 aa  151  9e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.00550904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 		 746 aa  150  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131978  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2693  histidine kinase  32.08 
 
 		 656 aa  148  6e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.23882e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1523  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 656 aa  148  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3018  Signal transduction histidine kinase, NtrY  37.13 
 
 		 712 aa  145  5e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1617  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 		 763 aa  145  7e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1110  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 508 aa  144  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.230539  normal  0.126752 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4084  histidine kinase  38.03 
 
 		 705 aa  144  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0018  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.77 
 
 		 710 aa  144  9.999999999999999e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.2698 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6820  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 532 aa  144  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0182  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.87 
 
 		 708 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000583847 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0199  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.5 
 
 		 734 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.779269  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1929  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 		 742 aa  142  4.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 		 763 aa  140  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  31.07 
 
 		 487 aa  140  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0554  histidine kinase  30.89 
 
 		 499 aa  140  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.83 
 
 		 733 aa  139  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 		 756 aa  139  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0285475 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 		 731 aa  138  7.000000000000001e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0577  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.53 
 
 		 516 aa  138  9e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1679  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 		 760 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.859765  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1422  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.02 
 
 		 655 aa  137  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000957952  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1199  histidine kinase  39.12 
 
 		 525 aa  137  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.893151  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4401  sensor histidine kinase  30.92 
 
 		 484 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4804  sensor histidine kinase  30.92 
 
 		 484 aa  136  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1130  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 		 525 aa  137  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.351901  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 725 aa  137  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1395  histidine kinase  30.79 
 
 		 581 aa  136  3e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.87 
 
 		 784 aa  136  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.714466 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0457  sensor histidine kinase  32.67 
 
 		 484 aa  136  3e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00889324 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0390  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 744 aa  135  3.9999999999999996e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1834  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 		 736 aa  135  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.273222  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2591  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 		 762 aa  135  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.682378  normal  0.0198144 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  30.29 
 
 		 673 aa  135  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1319  sensor histidine kinase  41.95 
 
 		 367 aa  135  6e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4418  sensor histidine kinase  30.59 
 
 		 484 aa  135  6e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4787  sensor histidine kinase  30.92 
 
 		 484 aa  135  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4566  sensor histidine kinase  30.92 
 
 		 484 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.784652  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1927  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.18 
 
 		 596 aa  134  1.0000000000000001e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4921  sensor histidine kinase  30.92 
 
 		 484 aa  134  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.348457  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1071  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.65 
 
 		 498 aa  134  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 756 aa  134  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.857607  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1491  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 814 aa  132  3e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0430544 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5940  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 779 aa  132  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.363869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4418  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.92 
 
 		 611 aa  132  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1907  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.36 
 
 		 747 aa  132  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.77 
 
 		 494 aa  132  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2579  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 		 761 aa  132  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.838184  normal  0.345494 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 491 aa  132  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0612  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 516 aa  132  6e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4782  sensor histidine kinase  30.59 
 
 		 484 aa  131  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 		 755 aa  132  7.000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35 
 
 		 747 aa  130  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0604  histidine kinase  33.99 
 
 		 516 aa  131  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1629  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 		 756 aa  131  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.102015  normal  0.506038 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6542  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 753 aa  131  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4398  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 		 745 aa  131  1.0000000000000001e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13461  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  30.75 
 
 		 674 aa  130  2.0000000000000002e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 718 aa  130  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.838483 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.57 
 
 		 762 aa  130  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0943385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 741 aa  130  2.0000000000000002e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.820438  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0249  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 768 aa  129  3e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.513538  normal  0.0270747 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.34 
 
 		 639 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 639 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.64 
 
 		 747 aa  129  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3902  histidine kinase  32.51 
 
 		 468 aa  129  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116044 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.62 
 
 		 765 aa  129  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.341187  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4128  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 752 aa  128  6e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.43986 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 592 aa  128  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3352  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 		 480 aa  129  6e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1838  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.77 
 
 		 764 aa  128  7e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0701  Cache sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 655 aa  128  8.000000000000001e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.831837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4191  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 		 476 aa  128  8.000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000558631  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4001  histidine kinase  36.99 
 
 		 774 aa  128  9e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000232996 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.11 
 
 		 757 aa  128  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.203555  normal  0.0623449 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.08 
 
 		 640 aa  127  1e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>