More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0307 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013501  Rmar_0307  Peptidase M23  100 
 
 
298 aa  593  1e-168  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  9.88851e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02890  putative peptidase  30.47 
 
 
320 aa  156  3e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.648813  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0690  hypothetical protein  45.69 
 
 
297 aa  121  2e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2508  Peptidase M23  43.75 
 
 
262 aa  102  5e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.290158  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  38.37 
 
 
247 aa  100  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  41.13 
 
 
419 aa  98.6  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.79397e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  35.64 
 
 
468 aa  97.4  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  38.6 
 
 
241 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.34852e-12 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  32.08 
 
 
369 aa  97.1  4e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  32.08 
 
 
319 aa  95.9  7e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  42.28 
 
 
285 aa  94  3e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  29.54 
 
 
308 aa  93.6  4e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  45.22 
 
 
582 aa  92.8  6e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4836  Peptidase M23  40.52 
 
 
230 aa  92.4  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  6.39661e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1646  membrane proteins related to metalloendopeptidase-like  38.1 
 
 
248 aa  92.4  7e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.570168  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3807  peptidase M23B  44.92 
 
 
361 aa  92.8  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.759615  normal  0.544086 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0059  M24/M37 family peptidase  44.07 
 
 
378 aa  91.7  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88686  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  41.59 
 
 
452 aa  92  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  3.78681e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  37.86 
 
 
367 aa  92  1e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  41.8 
 
 
301 aa  90.9  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0654  Peptidase M23  36.51 
 
 
274 aa  90.5  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3699  peptidase M23B  42.74 
 
 
379 aa  90.1  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0535  peptidase M23B  32.24 
 
 
247 aa  90.1  4e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0332  peptidase M23B  39.84 
 
 
434 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00544  peptidase, M23/M37 family protein  40.77 
 
 
387 aa  89.7  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  46.08 
 
 
377 aa  89  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0050  peptidase M23B  42.74 
 
 
377 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.46051e-06 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0042  peptidase M23B  42.74 
 
 
377 aa  88.6  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.701038  hitchhiker  0.00314235 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  42.31 
 
 
324 aa  88.6  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4878  peptidase M23B  42.74 
 
 
378 aa  88.6  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  39.58 
 
 
358 aa  88.2  1e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4218  peptidase M23B  43.59 
 
 
377 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  37.14 
 
 
375 aa  87.4  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4022  peptidase M23B  37.24 
 
 
377 aa  87.4  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  37.3 
 
 
282 aa  88.2  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4471  peptidase M23B  43.59 
 
 
377 aa  87.4  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.211003  hitchhiker  1.59575e-05 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  40.98 
 
 
274 aa  87.4  3e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  3.10987e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4886  peptidase M23B  38.21 
 
 
441 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1350  peptidase M23B  40 
 
 
240 aa  87  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.25735e-05  hitchhiker  1.13309e-10 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2189  peptidase M23B  37.6 
 
 
426 aa  86.7  4e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  41.38 
 
 
438 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0472  Peptidase M23  32.64 
 
 
223 aa  87  4e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  41.38 
 
 
438 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0039  peptidase M23B  41.88 
 
 
377 aa  86.3  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5108  peptidase M23B  41.38 
 
 
438 aa  86.3  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0048  M24/M37 family peptidase  41.53 
 
 
344 aa  86.7  5e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0408  peptidase M23B  41.38 
 
 
428 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4756  peptidase M23B  38.71 
 
 
333 aa  86.3  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0919319  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  42.59 
 
 
754 aa  86.3  7e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  9.99045e-10  decreased coverage  6.82898e-06 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  43.52 
 
 
727 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  43.52 
 
 
727 aa  85.9  7e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  5.39525e-05  unclonable  8.07187e-09 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2425  hypothetical protein  44.79 
 
 
439 aa  85.9  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  2.32327e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  42.42 
 
 
304 aa  85.5  9e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  39.8 
 
 
375 aa  85.5  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  2.19165e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  39.83 
 
 
824 aa  85.5  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0046  Peptidase M23  41.03 
 
 
362 aa  85.1  1e-15  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  1.5395e-07 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2172  peptidase M23B  40.5 
 
 
284 aa  85.1  1e-15  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4247  peptidase M23B  34.67 
 
 
416 aa  85.5  1e-15  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.843239  normal  0.0136995 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0031  M24/M37 family peptidase  42.34 
 
 
299 aa  85.5  1e-15  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  37.3 
 
 
321 aa  85.1  1e-15  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0046  peptidase M23B  40.68 
 
 
362 aa  85.1  1e-15  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  unclonable  1.29234e-05 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0042  peptidase M23B  41.03 
 
 
362 aa  85.1  1e-15  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  37.01 
 
 
309 aa  85.5  1e-15  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  2.49073e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4333  peptidase M23B  40.68 
 
 
362 aa  85.1  1e-15  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3741  peptidase M23B  38.76 
 
 
332 aa  85.1  1e-15  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.65677 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2139  hypothetical protein  38.4 
 
 
438 aa  84.3  2e-15  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  1.92356e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  41.32 
 
 
288 aa  84.3  2e-15  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3212  peptidase M23B  39.34 
 
 
417 aa  84.3  2e-15  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.321571  normal  0.507005 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5328  peptidase, M23/M37 family  37.4 
 
 
440 aa  84.7  2e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2049  hypothetical protein  43.75 
 
 
439 aa  84.7  2e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.245619  normal  0.249878 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2104  hypothetical protein  43.75 
 
 
439 aa  84.7  2e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.391602  normal  0.665324 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2044  hypothetical protein  43.75 
 
 
439 aa  84.7  2e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.713076  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1358  hypothetical protein  43.75 
 
 
439 aa  84.7  2e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1234  hypothetical protein  43.75 
 
 
439 aa  84.7  2e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00307381  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  38.98 
 
 
590 aa  84.3  2e-15  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  1.65223e-11  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2026  hypothetical protein  38.4 
 
 
438 aa  84.3  2e-15  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.48125e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  40.8 
 
 
247 aa  84.7  2e-15  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.97073e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  39.85 
 
 
349 aa  84.3  2e-15  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  38.79 
 
 
494 aa  84.7  2e-15  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1949  hypothetical protein  41.67 
 
 
440 aa  83.6  3e-15  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0407362  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  44.44 
 
 
751 aa  84  3e-15  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.6694e-14 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  40.2 
 
 
318 aa  84  3e-15  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  1.08635e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2086  hypothetical protein  41.67 
 
 
440 aa  83.6  3e-15  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  3.91864e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2416  hypothetical protein  38.4 
 
 
410 aa  84  3e-15  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.44361e-06  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  39.66 
 
 
404 aa  83.6  3e-15  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01815  hypothetical protein  41.67 
 
 
440 aa  83.6  3e-15  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000786117  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1784  Peptidase M23  41.67 
 
 
440 aa  83.6  3e-15  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  4.97391e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2592  hypothetical protein  41.67 
 
 
440 aa  83.6  3e-15  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  7.37786e-05  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0952  hypothetical protein  41.67 
 
 
440 aa  83.6  3e-15  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  3.81632e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1776  hypothetical protein  41.67 
 
 
440 aa  83.6  3e-15  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  3.17074e-06  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1330  hypothetical protein  41.67 
 
 
440 aa  83.6  3e-15  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0147983  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  38.39 
 
 
537 aa  83.6  4e-15  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01827  predicted peptidase  41.67 
 
 
419 aa  83.6  4e-15  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000774309  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  38.39 
 
 
501 aa  83.6  4e-15  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2772  hypothetical protein  44.79 
 
 
440 aa  83.2  4e-15  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  8.02583e-05  hitchhiker  0.00694213 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  40.4 
 
 
310 aa  83.2  5e-15  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  4.87918e-10  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04650  Peptidase M23B family  42.72 
 
 
420 aa  83.2  5e-15  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  41.53 
 
 
198 aa  83.2  5e-15  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2119  Peptidase M23  40.54 
 
 
323 aa  83.2  5e-15  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0798  peptidase M23B  37.69 
 
 
352 aa  83.2  5e-15  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>