250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5477 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012853  Rleg_5477  filamentation induced by cAMP protein Fic  100 
 
 		 367 aa  758    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0591  filamentation induced by cAMP protein Fic  75.2 
 
 		 373 aa  571  1.0000000000000001e-162  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7373  hypothetical protein  72.4 
 
 		 368 aa  553  1e-156  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.269183  n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4031  filamentation induced by cAMP protein Fic  70.68 
 
 		 372 aa  530  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3755  filamentation induced by cAMP protein Fic  70.68 
 
 		 372 aa  530  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0523363  normal  0.297865 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2127  filamentation induced by cAMP protein Fic  62.13 
 
 		 367 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.296141  normal  1 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3922  filamentation induced by cAMP protein Fic  56.01 
 
 		 379 aa  427  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.393872  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4231  hypothetical protein  52.73 
 
 		 364 aa  385  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.758484 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3797  filamentation induced by cAMP protein Fic  51.91 
 
 		 371 aa  377  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117208 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1091  hypothetical protein  49.73 
 
 		 369 aa  366  1e-100  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6016  filamentation induced by cAMP protein Fic  53.01 
 
 		 343 aa  340  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00688605 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4776  filamentation induced by cAMP protein Fic  52.09 
 
 		 313 aa  333  3e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.199218  normal  0.836687 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2315  filamentation induced by cAMP protein Fic  44.86 
 
 		 376 aa  328  1.0000000000000001e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.655269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5385  filamentation induced by cAMP protein Fic  42.01 
 
 		 370 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3843  filamentation induced by cAMP protein Fic  37 
 
 		 368 aa  236  4e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1129  Fic family protein  38.94 
 
 		 378 aa  235  1.0000000000000001e-60  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0887  Fic family protein  38.66 
 
 		 378 aa  234  2.0000000000000002e-60  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42040  hypothetical protein  39.26 
 
 		 386 aa  233  5e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0677  hypothetical protein  37.84 
 
 		 373 aa  231  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00227082  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4817  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.6 
 
 		 379 aa  229  6e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07450  hypothetical protein  37.57 
 
 		 373 aa  229  8e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000039973  normal  0.18978 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1366  filamentation induced by cAMP protein Fic  38.36 
 
 		 371 aa  223  4.9999999999999996e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0823  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.04 
 
 		 374 aa  223  6e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5004  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.97 
 
 		 381 aa  222  8e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3980  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.89 
 
 		 408 aa  220  3e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.231273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4664  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.73 
 
 		 376 aa  219  5e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.433809  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0523  Fic family protein  36.49 
 
 		 376 aa  213  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2616  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.57 
 
 		 368 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4758  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.66 
 
 		 373 aa  212  7e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3067  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.22 
 
 		 374 aa  212  7e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4506  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.95 
 
 		 365 aa  209  7e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000280664 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5763  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.57 
 
 		 374 aa  209  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6128  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.57 
 
 		 374 aa  209  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3619  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.2 
 
 		 376 aa  208  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6610  filamentation induced by cAMP protein Fic  37.85 
 
 		 374 aa  208  1e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.763797  normal  0.578306 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1182  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.9 
 
 		 374 aa  208  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3490  Fic family protein  34.76 
 
 		 376 aa  206  5e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0361  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.85 
 
 		 371 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0823  Fic family protein  34.76 
 
 		 389 aa  204  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0369  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.58 
 
 		 371 aa  204  3e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3625  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.85 
 
 		 371 aa  203  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4924  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.22 
 
 		 369 aa  202  7e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000928256 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4586  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.77 
 
 		 372 aa  202  7e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.459231 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0980  hypothetical protein  34.86 
 
 		 367 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0812833  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4648  hypothetical protein  36.19 
 
 		 384 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00489554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3804  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.5 
 
 		 371 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.539894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4935  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.2 
 
 		 373 aa  200  3e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.684685  normal  0.113714 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3792  hypothetical protein  35.58 
 
 		 365 aa  200  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0367  hypothetical protein  34.23 
 
 		 371 aa  199  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2002  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.61 
 
 		 375 aa  199  7e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.733317  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7631  filamentation induced by cAMP protein, Fic  36.03 
 
 		 386 aa  199  7e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.223579 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3312  hypothetical protein  35.85 
 
 		 376 aa  199  9e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00970462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0336  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.23 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.134655  normal  0.368234 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0359  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.95 
 
 		 375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1770  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.41 
 
 		 370 aa  197  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.385293  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3413  hypothetical protein  34.82 
 
 		 371 aa  197  3e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0366  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.6 
 
 		 375 aa  193  4e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1441  hypothetical protein  33.88 
 
 		 367 aa  192  9e-48  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1095  filamentation induced by cAMP protein (Fic) family protein  34.79 
 
 		 374 aa  185  8e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.298399  normal  0.261915 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0227  filamentation induced by cAMP protein Fic  31.58 
 
 		 376 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000424748  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2357  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.42 
 
 		 371 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0723  filamentation induced by cAMP protein Fic  33.89 
 
 		 373 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.43274  hitchhiker  0.00000454462 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3048  hypothetical protein  59.12 
 
 		 195 aa  160  4e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0296079  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3069  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.56 
 
 		 309 aa  159  5e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1773  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.56 
 
 		 318 aa  131  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0104845 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4024  hypothetical protein  45.7 
 
 		 156 aa  129  7.000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0995  filamentation induced by cAMP protein Fic  32.74 
 
 		 386 aa  77.4  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0390266  hitchhiker  0.00286673 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0233  fic family protein  27.1 
 
 		 377 aa  74.3  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.638848  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0368  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.84 
 
 		 151 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.25447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2109  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.89 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2249  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.51 
 
 		 389 aa  69.7  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0092  fic family protein  30.09 
 
 		 358 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0094  filamentation induced by cAMP protein Fic  30.09 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2669  Fic family protein  26.74 
 
 		 330 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2641  Fic family protein  24.27 
 
 		 328 aa  67.4  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000103829  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5696  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.56 
 
 		 358 aa  66.2  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00196433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0190  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.16 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3924  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.07 
 
 		 391 aa  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0276  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.74 
 
 		 387 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.475066  unclonable  0.0000132219 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0509  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.04 
 
 		 387 aa  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2057  filamentation induced by cAMP protein Fic  36.7 
 
 		 377 aa  65.9  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1010  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.39 
 
 		 401 aa  65.5  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3472  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.48 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2003  fic family protein  30.9 
 
 		 377 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0278833  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0415  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.33 
 
 		 390 aa  65.1  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1955  filamentation induced by cAMP protein Fic  35.48 
 
 		 333 aa  65.1  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.484154  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1397  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.8 
 
 		 316 aa  65.5  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0152  Fic family protein  33.33 
 
 		 416 aa  64.7  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.19734 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3305  filamentation induced by cAMP protein Fic  34.17 
 
 		 393 aa  64.7  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.735842 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1798  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.9 
 
 		 427 aa  63.5  0.000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  hitchhiker  0.000000635308  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0315  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.09 
 
 		 398 aa  63.2  0.000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.300424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0416  filamentation induced by cAMP protein Fic  27.42 
 
 		 336 aa  62.4  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1077  filamentation induced by cAMP protein Fic  26.03 
 
 		 393 aa  62  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.750525 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1880  filamentation induced by cAMP protein Fic  29.06 
 
 		 389 aa  61.6  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000804249  decreased coverage  0.000268134 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0168  Fic family protein  25.93 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3247  hypothetical protein  27.65 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199811  normal  0.982755 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2374  filamentation induced by cAMP protein Fic  28.87 
 
 		 392 aa  60.5  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0692926  normal  0.0752567 
 
 
-
 
NC_002978  WD1314  Fic family protein  25.13 
 
 		 359 aa  60.1  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.148349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6451  filamentation induced by cAMP protein Fic  25.68 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0184045 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2123  hypothetical protein  25.74 
 
 		 368 aa  60.1  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>