More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2677 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2677  transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 		 274 aa  552  1e-156  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2354  transcriptional regulator, AraC family  91.24 
 
 		 274 aa  501  1e-141  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.227413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7100  transcriptional regulator, AraC family  36.16 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.723966  normal  0.268951 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3518  transcriptional regulator, AraC family  37.11 
 
 		 275 aa  130  3e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.630647 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00160  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  33.33 
 
 		 311 aa  110  3e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0991  transcriptional regulator, AraC family  27.52 
 
 		 276 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6086  transcriptional regulator, AraC family  31.25 
 
 		 288 aa  99.4  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.993456 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2291  transcriptional regulator, AraC family  26.14 
 
 		 292 aa  96.7  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2431  AraC protein arabinose-binding/dimerisation  25.1 
 
 		 294 aa  96.7  4e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.690566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3095  AraC family transcriptional regulator  25.3 
 
 		 313 aa  93.6  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.570459 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37180  DNA-binding domain-containing protein, AraC-type  30.34 
 
 		 297 aa  82  0.000000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0236  transcriptional regulator, AraC family  25.41 
 
 		 273 aa  77  0.0000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2104  transcriptional regulator, AraC family  28.87 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.244646 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2634  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.27 
 
 		 294 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4772  AraC family transcriptional regulator  28.94 
 
 		 293 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54610  putative transcriptional regulator  28.04 
 
 		 303 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53981  normal  0.0153543 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3596  transcriptional regulator, AraC family  24.26 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000994716  hitchhiker  0.0000611237 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0659  AraC family transcriptional regulator  24.33 
 
 		 290 aa  71.6  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1378  AraC family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 293 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.230612  normal  0.324624 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0936  transcriptional regulator, AraC family  42.35 
 
 		 289 aa  70.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.352467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1862  transcriptional regulator, AraC family  25.67 
 
 		 300 aa  70.9  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4046  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 297 aa  70.5  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1165  AraC family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 278 aa  69.7  0.00000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03564  predicted DNA-binding transcriptional regulator  26.38 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.42509  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5544  transcriptional regulator, AraC family  34.85 
 
 		 463 aa  69.3  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.258636  normal  0.142482 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03507  hypothetical protein  26.38 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.702446  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0023  transcriptional regulator, AraC family  26.38 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4189  AraC family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5113  transcriptional regulator, AraC family  26.38 
 
 		 297 aa  68.9  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.52445 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3483  transcriptional regulator, AraC family  35.58 
 
 		 296 aa  68.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2116  transcriptional regulator, AraC family  34.95 
 
 		 287 aa  68.2  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0918782  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51400  transcriptional regulator AraC family  28.83 
 
 		 310 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3556  transcriptional regulator  31.61 
 
 		 319 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.253425 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1996  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.05 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1157  AraC family transcriptional regulator  35.11 
 
 		 248 aa  66.6  0.0000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2638  transcriptional regulator, AraC family  23.02 
 
 		 282 aa  66.6  0.0000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0125  transcriptional regulator, AraC family  30.13 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1882  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.05 
 
 		 310 aa  66.6  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1909  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.31 
 
 		 314 aa  66.2  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4554  transcriptional regulator, AraC family  39.58 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2063  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 311 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6795  transcriptional regulator, AraC family  25.51 
 
 		 306 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.312804  hitchhiker  0.00000309577 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1501  transcriptional regulator  36.46 
 
 		 347 aa  64.7  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6879  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0489024  normal  0.393248 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1906  AraC family transcriptional regulator  24.61 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5909  transcriptional regulator, AraC family  34 
 
 		 291 aa  64.7  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.678896 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1415  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.172682  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1891  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 294 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2248  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.23 
 
 		 305 aa  63.9  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000211757 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4474  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4668  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.622787 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4999  AraC family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 314 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3416  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0904858  normal  0.667905 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5196  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.82206  normal  0.599062 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2199  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0574  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.389496  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0477  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.555067  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0885  AraC family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0108  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.24 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.24 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.839696  normal  0.0929131 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2264  DNA-binding transcriptional regulator AraC  24.58 
 
 		 310 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4999  AraC family transcriptional regulator  39.02 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.329946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19910  response regulator receiver protein  30.63 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4961  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0263791 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0341  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.729431 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0111  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.24 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.311813 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3305  two component transcriptional regulator, AraC family  31.58 
 
 		 513 aa  63.9  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3578  AraC family transcriptional regulator  29.45 
 
 		 314 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.54425 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0876  transcriptional regulator, AraC family  33.65 
 
 		 405 aa  63.9  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2462  transcriptional regulator  37.89 
 
 		 337 aa  63.9  0.000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0110  DNA-binding transcriptional regulator AraC  27.24 
 
 		 281 aa  63.5  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.234129 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3060  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0611  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.31 
 
 		 280 aa  63.5  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88985  normal  0.0110602 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5220  AraC family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 314 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.974611 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5307  AraC family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 264 aa  63.9  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0914956 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0599  transcriptional regulator  30.67 
 
 		 326 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0878  AraC family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.776666  normal  0.396396 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4138  AraC family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0937  transcriptional regulator, AraC family  30.53 
 
 		 291 aa  63.5  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.440102  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3607  transcriptional regulator, AraC family  34.19 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0600  two component transcriptional regulator, AraC family  40.96 
 
 		 546 aa  63.5  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2799  AraC family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0653395  normal  0.0991111 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2642  transcriptional regulator, AraC family  29.03 
 
 		 304 aa  62.8  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3303  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5064  AraC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 314 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19070  transcriptional regulator, AraC family  42 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.163333  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0193  AraC family transcriptional regulator  30 
 
 		 327 aa  62.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0182  helix-turn-helix domain-containing protein  30.54 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0556726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0285  transcriptional regulator, AraC family  34.65 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000546061  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2146  DNA-binding transcriptional regulator AraC  24.9 
 
 		 316 aa  62.8  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0115  DNA-binding transcriptional regulator AraC  26.85 
 
 		 281 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0539  AraC family DNA-binding response regulator  26.63 
 
 		 529 aa  62.4  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0071  transcriptional regulator, AraC family  29.08 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.462194  normal  0.509071 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2332  DNA-binding transcriptional regulator AraC  24.58 
 
 		 310 aa  62.4  0.000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0890796  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0423  transcriptional regulator, AraC family  36.84 
 
 		 310 aa  62  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2943  helix-turn-helix domain-containing protein  25.33 
 
 		 307 aa  62  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0314532  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3593  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.79 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.50445  hitchhiker  0.000000316606 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0056  DNA-binding transcriptional regulator AraC  25.79 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00065  hypothetical protein  25.79 
 
 		 292 aa  61.6  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4563  transcriptional regulator, AraC family  36.73 
 
 		 255 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238722  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>