158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1001 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1001  response regulator receiver protein  100 
 
 		 120 aa  238  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.283402  normal  0.269242 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1154  response regulator receiver protein  93.33 
 
 		 161 aa  222  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  44.44 
 
 		 849 aa  93.6  9e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  41.38 
 
 		 847 aa  89.4  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  41.96 
 
 		 844 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  41.12 
 
 		 847 aa  83.6  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  39.13 
 
 		 847 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  42.86 
 
 		 846 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 		 856 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  40.91 
 
 		 842 aa  79.3  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2399  response regulator receiver protein  37.38 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0186457 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4279  response regulator receiver protein  40.54 
 
 		 120 aa  78.6  0.00000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.718019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0646  response regulator receiver domain-containing protein  44.9 
 
 		 139 aa  78.2  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.452757  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  39.13 
 
 		 855 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0556  response regulator receiver  43.52 
 
 		 140 aa  77  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.032469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01099  bacteriophytochrome protein  34.31 
 
 		 822 aa  73.2  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.506628  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  37.04 
 
 		 844 aa  72.8  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  37.82 
 
 		 1096 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 1111 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  37.65 
 
 		 856 aa  70.9  0.000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  37.96 
 
 		 602 aa  70.5  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6551  putative response regulator receiver (CheY-like protein)  38.05 
 
 		 129 aa  69.3  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.582154 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  36.04 
 
 		 852 aa  69.3  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2532  response regulator receiver protein  37.39 
 
 		 138 aa  69.3  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1267  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  41.58 
 
 		 134 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862788 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0109  response regulator receiver  37.96 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  37.82 
 
 		 1096 aa  67.8  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03021  regulatory protein  36.28 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3435  response regulator receiver protein  40.78 
 
 		 121 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.465011  normal  0.396609 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6064  response regulator receiver domain-containing protein  41.84 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2089  response regulator receiver protein  38.83 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.775144 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1215  response regulator receiver protein  35.71 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0588681  normal  0.159144 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1334  response regulator receiver protein  42.27 
 
 		 126 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.395948 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2323  response regulator receiver protein  43.02 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.03657 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4798  response regulator receiver protein  37.04 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.107601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2608  response regulator receiver protein  41.58 
 
 		 114 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.186263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2183  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 134 aa  62.8  0.000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4933  response regulator receiver protein  31.3 
 
 		 121 aa  61.2  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.124626  normal  0.430513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0251  hypothetical protein  39.45 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3759  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 127 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.514361  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0773  response regulator receiver  38.05 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.863112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6265  response regulator receiver protein  36.28 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3363  response regulator receiver protein  40.4 
 
 		 133 aa  58.5  0.00000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.387857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 631 aa  58.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4846  response regulator receiver protein  36.75 
 
 		 126 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.211413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5346  response regulator receiver protein  43.59 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4155  response regulator receiver domain-containing protein  31.9 
 
 		 123 aa  55.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.918011  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1726  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 115 aa  56.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0708  response regulator receiver protein  34.95 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.795364  normal  0.880104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6449  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 121 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0470  response regulator receiver protein  31.36 
 
 		 133 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6401  response regulator receiver protein  33.01 
 
 		 126 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0738  response regulator receiver domain-containing protein  39.09 
 
 		 156 aa  54.3  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5569  response regulator receiver protein  37.66 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.097054 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  35.85 
 
 		 429 aa  53.9  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7970  response regulator receiver and SARP domain protein  34.26 
 
 		 160 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.304155  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3106  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 152 aa  53.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5707  response regulator receiver protein  32.04 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1920  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 126 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.170402 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 		 559 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6935  response regulator  33.33 
 
 		 141 aa  52  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1296  response regulator receiver protein  39.02 
 
 		 136 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3509  signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 125 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.316868  normal  0.542318 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0677  putative two component-response regulator receiver (CheY-like protein)  34.78 
 
 		 104 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.339833 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2023  response regulator receiver protein  33.62 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0939204  normal  0.968357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1555  hypothetical protein  35 
 
 		 168 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2069  response regulator receiver domain-containing protein  38.1 
 
 		 123 aa  50.1  0.000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.240465  normal  0.487014 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2485  response regulator  33.9 
 
 		 125 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1793  response regulator receiver domain-containing protein  29.57 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244756  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1200  response regulator receiver protein  32.17 
 
 		 126 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4110  response regulator receiver protein  33.94 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00730632  normal  0.59438 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5600  response regulator receiver protein  34.02 
 
 		 124 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2241  response regulator receiver protein  33.94 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.926249 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1965  response regulator receiver  33.94 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.132523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2363  response regulator receiver protein  31.43 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.549917  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7958  response regulator receiver protein  31.96 
 
 		 124 aa  48.1  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0621  response regulator receiver protein  32.67 
 
 		 120 aa  48.9  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2263  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  36.08 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.911956  normal  0.118654 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3299  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 123 aa  48.5  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00414312 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0022  response regulator receiver and SARP domain protein  31.9 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2520  response regulator receiver domain-containing protein  29.82 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.113297  normal  0.478353 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5233  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.64 
 
 		 384 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.222219 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4853  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.04 
 
 		 457 aa  47.8  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231814  hitchhiker  0.00735887 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0432  hypothetical protein  33.98 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.603744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2986  response regulator receiver protein  30.08 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.347118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1774  response regulator receiver  31.31 
 
 		 126 aa  47.8  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0498529  decreased coverage  0.00379005 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2230  response regulator receiver domain-containing protein  36.08 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.454812  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0906  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  36.08 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0019  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 129 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0611118 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0475  response regulator receiver protein  29.46 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1784  response regulator receiver domain-containing protein  30.77 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.474362  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3450  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 448 aa  47  0.00009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4234  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0312747 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0604  response regulator receiver protein  30.36 
 
 		 147 aa  46.6  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5004  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 118 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.325761  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 639 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0717  response regulator receiver protein  34.82 
 
 		 122 aa  46.2  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0892969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2623  response regulator receiver protein  32.04 
 
 		 150 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2937  response regulator receiver protein  27.73 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.972944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5585  response regulator receiver protein  28.04 
 
 		 124 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>