More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2918 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0315  1A family penicillin-binding protein  57.16 
 
 		 795 aa  929    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.640379 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1268  1A family penicillin-binding protein  55.54 
 
 		 786 aa  876    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00608444  normal  0.905221 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2976  penicillin-binding 1 transmembrane protein  59.85 
 
 		 801 aa  958    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.893289  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0088  penicillin-binding protein, 1A family  56.77 
 
 		 778 aa  859    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0128257 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1321  1A family penicillin-binding protein  53.95 
 
 		 837 aa  844    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000393559 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2799  1A family penicillin-binding protein  58.69 
 
 		 796 aa  945    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1497  1A family penicillin-binding protein  54.66 
 
 		 846 aa  862    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.178558  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2752  1A family penicillin-binding protein  57.86 
 
 		 797 aa  903    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3201  1A family penicillin-binding protein  57.86 
 
 		 797 aa  903    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0209  penicillin-binding protein 1A  58.38 
 
 		 771 aa  884    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1016  penicillin-binding protein 1A  52.9 
 
 		 778 aa  795    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3254  penicillin-binding protein, 1A family  61.89 
 
 		 777 aa  953    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0272171  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0671  1A family penicillin-binding protein  71.62 
 
 		 805 aa  1225    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152404 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3136  penicillin-binding protein 1A  61.06 
 
 		 791 aa  961    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3763  1A family penicillin-binding protein  57.73 
 
 		 797 aa  900    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.763292  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0201  peptidoglycan glycosyltransferase  54.1 
 
 		 793 aa  745    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.558494 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1268  1A family penicillin-binding protein  54.66 
 
 		 840 aa  862    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2518  1A family penicillin-binding protein  54.79 
 
 		 840 aa  853    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.316382  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3734  1A family penicillin-binding protein  57.73 
 
 		 797 aa  900    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1996  1A family penicillin-binding protein  54.66 
 
 		 840 aa  862    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.704723  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0024  penicillin-binding protein, 1A family  65.79 
 
 		 802 aa  1094    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3486  penicillin-binding protein 1A  57.36 
 
 		 796 aa  929    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5259  penicillin-binding protein 1A  53.32 
 
 		 838 aa  840    Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000072806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2411  1A family penicillin-binding protein  54.79 
 
 		 840 aa  853    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0833  penicillin-binding protein, 1A family  53.94 
 
 		 807 aa  760    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2078  penicillin-binding protein 1A  50.9 
 
 		 777 aa  790    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.162741  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0023  1A family penicillin-binding protein  73.12 
 
 		 799 aa  1189    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.432475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2082  1A family penicillin-binding protein  55.17 
 
 		 840 aa  866    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.264276  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3029  1A family penicillin-binding protein  57.49 
 
 		 797 aa  890    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0290  1A family penicillin-binding protein  57.42 
 
 		 797 aa  932    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.308967  normal  0.891054 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2802  1A family penicillin-binding protein  57.86 
 
 		 797 aa  902    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.437708  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0092  1A family penicillin-binding protein  55.76 
 
 		 778 aa  862    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000436892  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1139  penicillin-binding protein, 1A family  72.09 
 
 		 774 aa  1172    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0388878  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0917  penicillin-binding protein 1A  50.93 
 
 		 752 aa  781    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2918  penicillin-binding protein 1A  100 
 
 		 797 aa  1633    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.850822  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3408  1A family penicillin-binding protein  65.37 
 
 		 766 aa  1036    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000649652 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2462  penicillin-binding protein 1A  54.09 
 
 		 791 aa  768    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0780  penicillin-binding protein 1A  77.01 
 
 		 804 aa  1274    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0995  1A family penicillin-binding protein  74.81 
 
 		 797 aa  1223    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0354  putative penicillin-binding 1 (peptoglycansynthetase) transmembrane protein, MrcA  57.53 
 
 		 799 aa  931    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0136569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1961  putative penicillin-binding (peptidoglycan synthetase) transmembrane protein, mrcA  54.07 
 
 		 836 aa  882    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.935067  normal  0.0226413 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1972  1A family penicillin-binding protein  52.99 
 
 		 839 aa  834    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.125323  normal  0.0456782 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0176  1A family penicillin-binding protein  55.3 
 
 		 776 aa  771    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3603  penicillin-binding protein, 1A family  57.53 
 
 		 799 aa  928    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00689676  hitchhiker  0.000000108854 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1862  1A family penicillin-binding protein  53 
 
 		 839 aa  835    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.000000145704  hitchhiker  0.0000925337 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3274  penicillin-binding protein 1A  61.63 
 
 		 792 aa  972    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0698  penicillin-binding protein, 1A family  74.87 
 
 		 779 aa  1233    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2720  penicillin-binding protein 1A  57.81 
 
 		 797 aa  937    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3114  peptidoglycan glycosyltransferase  64.32 
 
 		 793 aa  1039    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.183749 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6131  penicillin-binding protein 1A  52.93 
 
 		 839 aa  831    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.353845  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5582  1A family penicillin-binding protein  72.25 
 
 		 824 aa  1216    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0729  1A family penicillin-binding protein  74.12 
 
 		 794 aa  1234    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.239456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2907  penicillin-binding protein, 1A family  61.89 
 
 		 777 aa  953    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0114663 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2369  1A family penicillin-binding protein  54.79 
 
 		 852 aa  863    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2296  penicillin-binding protein, 1A family  54.07 
 
 		 833 aa  878    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0366  1A family penicillin-binding protein  57.81 
 
 		 797 aa  936    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.941804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0306  1A family penicillin-binding protein  57.16 
 
 		 797 aa  928    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1935  1A family penicillin-binding protein  53.32 
 
 		 839 aa  837    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000247834  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1752  1A family penicillin-binding protein  58.07 
 
 		 770 aa  897    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0387  1A family penicillin-binding protein  57.81 
 
 		 797 aa  937    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.495893  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1948  1A family penicillin-binding protein  52.93 
 
 		 839 aa  831    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.135129  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3705  1A family penicillin-binding protein  57.86 
 
 		 797 aa  903    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3314  1A family penicillin-binding protein  54.66 
 
 		 840 aa  862    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.019725  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2152  penicillin-binding protein 1A  42.93 
 
 		 773 aa  610  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.431826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0246  penicillin-binding protein 1A  43.27 
 
 		 814 aa  599  1e-170  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0987  hypothetical protein  42.35 
 
 		 794 aa  588  1e-167  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0956  hypothetical protein  42.08 
 
 		 794 aa  588  1e-166  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2091  penicillin-binding protein 1A  42.57 
 
 		 793 aa  587  1e-166  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0118  multimodular transpeptidase-transglycosylase PBP 1A  42.43 
 
 		 793 aa  585  1.0000000000000001e-165  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5782  penicillin-binding protein 1A  41 
 
 		 823 aa  581  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66670  penicillin-binding protein 1A  41 
 
 		 823 aa  581  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0324  penicillin-binding protein 1A  41.31 
 
 		 830 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3022  Peptidoglycan glycosyltransferase  39.87 
 
 		 817 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.369948  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1936  penicillin-binding protein, 1A family  42.9 
 
 		 790 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2754  1A family penicillin-binding protein  42.12 
 
 		 800 aa  560  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1861  peptidoglycan glycosyltransferase  40.9 
 
 		 854 aa  557  1e-157  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.894237  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1790  1A family penicillin-binding protein  41.03 
 
 		 809 aa  558  1e-157  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2253  1A family penicillin-binding protein  42.62 
 
 		 803 aa  554  1e-156  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.816825  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5134  1A family penicillin-binding protein  38.83 
 
 		 817 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0381  1A family penicillin-binding protein  39.56 
 
 		 817 aa  546  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5084  penicillin-binding protein, 1A family  38.83 
 
 		 817 aa  545  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.846696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0404  penicillin-binding protein 1A  38.7 
 
 		 815 aa  543  1e-153  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0818527  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2056  penicillin-binding protein 1A  40.14 
 
 		 804 aa  543  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000993377  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4957  1A family penicillin-binding protein  38.83 
 
 		 817 aa  545  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5133  penicillin-binding protein  38.88 
 
 		 814 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0554788  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0402  peptidoglycan glycosyltransferase  38.75 
 
 		 814 aa  536  1e-151  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.527889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0541  1A family penicillin-binding protein  39.66 
 
 		 803 aa  536  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45310  Penicillin binding protein 1A  39 
 
 		 819 aa  533  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3704  1A family penicillin-binding protein  39.45 
 
 		 839 aa  530  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.2288  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3900  1A family penicillin-binding protein  39.45 
 
 		 839 aa  528  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.247667  normal  0.227457 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0607  penicillin-binding protein 1A  39.26 
 
 		 839 aa  528  1e-148  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0360567  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0241  1A family penicillin-binding protein  39.45 
 
 		 839 aa  529  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4121  1A family penicillin-binding protein  38.77 
 
 		 814 aa  525  1e-147  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.739203  hitchhiker  0.00000203551 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0332  peptidoglycan synthetase  40.28 
 
 		 851 aa  524  1e-147  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2692  penicillin-binding protein  38.27 
 
 		 846 aa  525  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000762848  hitchhiker  0.0050562 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2212  penicillin-binding protein 1A  39.71 
 
 		 835 aa  522  1e-147  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0274  penicillin-binding protein, 1A family  39.8 
 
 		 790 aa  522  1e-147  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.565405  normal  0.249222 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0280  penicillin-binding protein 1A  39.08 
 
 		 839 aa  520  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3241  penicillin-binding protein, 1A family  37.64 
 
 		 807 aa  521  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3374  penicillin-binding protein 1A  38.26 
 
 		 846 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>