More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3805 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3805  major facilitator transporter  100 
 
 		 408 aa  778    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3546  major facilitator transporter  74.81 
 
 		 398 aa  536  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38000  MFS permease  63.87 
 
 		 401 aa  421  1e-117  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3062  transporter  56.46 
 
 		 389 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534836  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2509  major facilitator superfamily MFS_1  60.45 
 
 		 402 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3302  transporter  56.46 
 
 		 389 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1223  major facilitator transporter  52.69 
 
 		 393 aa  394  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2763  major facilitator superfamily MFS_1  60.45 
 
 		 402 aa  382  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.689815  normal  0.779689 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2790  MFS permease  58.38 
 
 		 406 aa  365  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3754  major facilitator transporter  56.23 
 
 		 407 aa  365  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.503769  normal  0.0279175 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7383  major facilitator superfamily (MSF) transporter  56.33 
 
 		 396 aa  361  1e-98  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1033  major facilitator superfamily transporter  59.34 
 
 		 413 aa  347  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.854206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5605  major facilitator transporter  51.21 
 
 		 405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.919705 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7020  major facilitator transporter  51.47 
 
 		 405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303658  normal  0.0738208 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5822  major facilitator transporter  51.21 
 
 		 405 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1474  major facilitator transporter  51.21 
 
 		 405 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00116593  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6354  major facilitator transporter  51.21 
 
 		 405 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.623556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1589  major facilitator transporter  51.74 
 
 		 395 aa  332  5e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.24766  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3304  major facilitator family transporter  53.8 
 
 		 398 aa  331  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3138  major facilitator transporter  52.55 
 
 		 398 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.82105 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4954  major facilitator transporter  50.98 
 
 		 405 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.960972  normal  0.410728 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2393  major facilitator superfamily drug efflux transporter  47.62 
 
 		 404 aa  323  3e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.988182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5762  major facilitator transporter  49.47 
 
 		 404 aa  323  4e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1438  major facilitator superfamily MFS_1  51.15 
 
 		 447 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5502  major facilitator superfamily MFS_1  48.51 
 
 		 388 aa  296  6e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0812471  normal  0.0619637 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1982  major facilitator family transporter  47.54 
 
 		 400 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.21038  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0684  major facilitator family transporter  47.54 
 
 		 400 aa  291  2e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.837842  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0591  major facilitator family transporter  47.54 
 
 		 400 aa  290  3e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2355  major facilitator transporter  51.32 
 
 		 399 aa  270  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.235883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0871  major facilitator transporter  45.73 
 
 		 416 aa  269  7e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0912  major facilitator transporter  48.4 
 
 		 405 aa  263  3e-69  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.973164  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5649  major facilitator transporter  45.7 
 
 		 400 aa  257  2e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2208  major facilitator transporter  51.32 
 
 		 399 aa  257  2e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1242  major facilitator transporter  45.97 
 
 		 433 aa  257  3e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3566  major facilitator family transporter  51.05 
 
 		 399 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3344  bicyclomycin resistance protein  37.63 
 
 		 392 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03770  major facilitator family (MFS) transporter  48.5 
 
 		 401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0949  transporter  37.27 
 
 		 406 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.800881  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1014  transporter  37.27 
 
 		 406 aa  253  3e-66  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.32709  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1182  putative transporter  37.27 
 
 		 403 aa  252  8.000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000458101  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2479  major facilitator transporter  52.66 
 
 		 402 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.469359 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0630  major facilitator transporter  49.87 
 
 		 409 aa  242  7.999999999999999e-63  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0823424  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0610  major facilitator transporter  39.11 
 
 		 399 aa  241  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0971506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3729  major facilitator transporter  38.93 
 
 		 399 aa  240  4e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.487409  normal  0.452524 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3120  major facilitator family transporter  45.41 
 
 		 422 aa  239  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00127728  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0160  major facilitator transporter  38.85 
 
 		 399 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0643  major facilitator transporter  38.85 
 
 		 385 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3408  major facilitator transporter  47.12 
 
 		 431 aa  237  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000015695  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2743  major facilitator transporter  40.43 
 
 		 399 aa  236  6e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0608632  normal  0.943249 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2449  major facilitator transporter  48.34 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0638  major facilitator superfamily MFS_1  40.83 
 
 		 387 aa  229  7e-59  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2190  major facilitator transporter  36.06 
 
 		 394 aa  228  2e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.637684  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5771  major facilitator superfamily MFS_1  48.04 
 
 		 413 aa  228  2e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.926843 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3455  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 399 aa  226  5.0000000000000005e-58  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3334  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 399 aa  226  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3197  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 399 aa  226  6e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3303  major facilitator superfamily MFS_1  44.96 
 
 		 419 aa  221  9.999999999999999e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00459923  normal  0.0115406 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0289  major facilitator transporter  49.73 
 
 		 427 aa  220  3e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000369004  unclonable  0.0000000000514998 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2797  major facilitator transporter  49.21 
 
 		 427 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0004999  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0309  major facilitator transporter  49.21 
 
 		 427 aa  221  3e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000378785  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2415  major facilitator transporter  42.34 
 
 		 415 aa  219  7e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0245324  normal  0.166892 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0212  major facilitator transporter  49.06 
 
 		 427 aa  218  2e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000448649  unclonable  0.0000000000115228 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3477  major facilitator transporter  42.82 
 
 		 405 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.222248  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1197  major facilitator family transporter  40.57 
 
 		 399 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2956  major facilitator superfamily MFS_1  44.3 
 
 		 419 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.127266  hitchhiker  0.000719262 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0548  major facilitator transporter  38.5 
 
 		 401 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0970  major facilitator transporter  40.27 
 
 		 395 aa  213  5.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.586357 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0538  major facilitator transporter  38.62 
 
 		 401 aa  213  5.999999999999999e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.925567 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2654  major facilitator superfamily MFS_1  39.52 
 
 		 399 aa  213  7e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.400382  normal  0.458588 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7086  major facilitator transporter  38.46 
 
 		 390 aa  213  7e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1506  major facilitator transporter  39.15 
 
 		 404 aa  212  7.999999999999999e-54  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3539  major facilitator superfamily MFS_1  40.7 
 
 		 415 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6119  major facilitator superfamily MFS_1  34.23 
 
 		 413 aa  210  4e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2274  major facilitator superfamily transporter  40.1 
 
 		 411 aa  210  5e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.670451  hitchhiker  0.000000383306 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1297  major facilitator superfamily MFS_1  39.05 
 
 		 410 aa  209  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.807255 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0024  major facilitator transporter  41.24 
 
 		 383 aa  209  7e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0151304 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3162  major facilitator superfamily MFS_1  42.3 
 
 		 397 aa  209  7e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1860  major facilitator transporter  38.07 
 
 		 403 aa  208  1e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000002484  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0503  major facilitator family transporter  38.87 
 
 		 401 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.766631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1462  major facilitator transporter  39.63 
 
 		 400 aa  208  2e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3799  major facilitator transporter  46.01 
 
 		 433 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000291886  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0028  MFS permease  46.01 
 
 		 422 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0000623855  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3860  major facilitator transporter  46.01 
 
 		 442 aa  207  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.320217  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1704  major facilitator transporter  37.59 
 
 		 426 aa  206  7e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.136946  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02536  predicted transporter  39.51 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2817  major facilitator family transporter  39.51 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3465  MFS transporter  39.66 
 
 		 405 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3428  major facilitator family transporter  39.66 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1026  major facilitator transporter  39.51 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.164339 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3925  major facilitator family transporter  39.51 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.51646 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2467  transporter, putative  39.66 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3320  putative transporter  39.66 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6027  major facilitator transporter  41.23 
 
 		 403 aa  204  2e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.11639  normal  0.400144 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3465  major facilitator family transporter  39.66 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3326  major facilitator superfamily MFS_1  38.24 
 
 		 406 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2637  major facilitator superfamily MFS_1  35.93 
 
 		 391 aa  204  2e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0859065  normal  0.0265177 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0386  putative transporter  39.66 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1246  putative transporter  39.66 
 
 		 399 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.580202  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2989  major facilitator superfamily MFS_1  45.01 
 
 		 423 aa  203  4e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.250766  normal  0.409989 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3161  major facilitator transporter  39.15 
 
 		 394 aa  202  7e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>