86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1561 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1561  hypothetical protein  100 
 
 		 300 aa  601  1.0000000000000001e-171  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0918  hypothetical protein  89.7 
 
 		 302 aa  441  1e-123  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2640  hypothetical protein  58.85 
 
 		 257 aa  287  2e-76  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.806273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3711  hypothetical protein  58.02 
 
 		 332 aa  275  6e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.642224  hitchhiker  0.00344693 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3709  hypothetical protein  59.48 
 
 		 319 aa  270  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00298451 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3710  hypothetical protein  59.39 
 
 		 330 aa  269  4e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.395031  hitchhiker  0.00336398 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0652  hypothetical protein  58.18 
 
 		 333 aa  257  2e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2294  hypothetical protein  49.82 
 
 		 319 aa  241  9e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.24692  normal  0.213826 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3486  hypothetical protein  49.61 
 
 		 340 aa  216  2.9999999999999998e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.956349 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4427  hypothetical protein  51.35 
 
 		 290 aa  212  7e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.145713  normal  0.510849 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3395  hypothetical protein  51.5 
 
 		 376 aa  211  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317872  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3867  hypothetical protein  50.64 
 
 		 350 aa  209  6e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679985  normal  0.332128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1441  hypothetical protein  50.21 
 
 		 339 aa  208  7e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.958123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2241  hypothetical protein  46.91 
 
 		 345 aa  203  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1217  hypothetical protein  47.9 
 
 		 314 aa  202  8e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.782404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2797  hypothetical protein  51.64 
 
 		 312 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0437541  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0614  hypothetical protein  51.18 
 
 		 402 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.333461  normal  0.0633973 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0728  hypothetical protein  51.13 
 
 		 343 aa  199  5e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3746  hypothetical protein  47.62 
 
 		 321 aa  199  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.55082  hitchhiker  0.000155287 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4135  hypothetical protein  45.29 
 
 		 289 aa  196  3e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2909  hypothetical protein  46.29 
 
 		 310 aa  195  7e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.11169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3655  hypothetical protein  46.7 
 
 		 314 aa  195  7e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.643  normal  0.782958 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0779  hypothetical protein  51.72 
 
 		 249 aa  180  2e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.927601  normal  0.868824 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2206  hypothetical protein  57.32 
 
 		 160 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404614  normal  0.720975 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2205  hypothetical protein  44.55 
 
 		 108 aa  81.6  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.737642  normal  0.905807 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4571  hypothetical protein  32.58 
 
 		 274 aa  70.5  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0215  hypothetical protein  29.44 
 
 		 259 aa  65.5  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0180018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2194  hypothetical protein  33.83 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2633  protein of unknown function DUF820  32.62 
 
 		 251 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.37277 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0882  protein of unknown function DUF820  30.14 
 
 		 284 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.010989  normal  0.659091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4319  protein of unknown function DUF820  32.2 
 
 		 272 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1228  protein of unknown function DUF820  30 
 
 		 240 aa  58.5  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.706034 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1780  protein of unknown function DUF820  32.82 
 
 		 281 aa  58.2  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1501  protein of unknown function DUF820  29.39 
 
 		 245 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4249  protein of unknown function DUF820  24.79 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000136516  unclonable  0.00000000239983 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4210  protein of unknown function DUF820  24.79 
 
 		 250 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0068  protein of unknown function DUF820  25.45 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1972  protein of unknown function DUF820  29.49 
 
 		 252 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000213894  normal  0.0132156 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2193  hypothetical protein  32.58 
 
 		 244 aa  54.7  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0022  protein of unknown function DUF820  28.57 
 
 		 243 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2553  hypothetical protein  36.21 
 
 		 248 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.346144  normal  0.522171 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1945  protein of unknown function DUF820  29.49 
 
 		 252 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1317  protein of unknown function DUF820  24.6 
 
 		 295 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1528  protein of unknown function DUF820  27.95 
 
 		 238 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.963126 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4990  protein of unknown function DUF820  30.34 
 
 		 226 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4500  hypothetical protein  24.61 
 
 		 260 aa  51.6  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3571  protein of unknown function DUF820  32.03 
 
 		 222 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.195938  normal  0.125466 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3900  protein of unknown function DUF820  27.71 
 
 		 232 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0160105  normal  0.148171 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0266  protein of unknown function DUF820  29.6 
 
 		 226 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000132368  decreased coverage  0.00423088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1298  hypothetical protein  32.77 
 
 		 262 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1345  protein of unknown function DUF820  26.02 
 
 		 281 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.05834  unclonable  0.00000000208542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0024  protein of unknown function DUF820  24.77 
 
 		 229 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4438  protein of unknown function DUF820  23.42 
 
 		 229 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3264  protein of unknown function DUF820  29.6 
 
 		 210 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000019093  normal  0.268128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2195  hypothetical protein  32.32 
 
 		 230 aa  48.5  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.478956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2576  protein of unknown function DUF820  27.23 
 
 		 227 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23751  normal  0.975603 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0319  protein of unknown function DUF820  24.02 
 
 		 232 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.191601 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1647  protein of unknown function DUF820  30.63 
 
 		 243 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1620  protein of unknown function DUF820  30.63 
 
 		 243 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3424  protein of unknown function DUF820  34.71 
 
 		 237 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.888337  normal  0.620139 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1252  protein of unknown function DUF820  33.33 
 
 		 247 aa  48.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.000000809595  normal  0.287908 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3484  protein of unknown function DUF820  35 
 
 		 225 aa  47.8  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3885  protein of unknown function DUF820  35.03 
 
 		 231 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0724109  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1052  protein of unknown function DUF820  32.35 
 
 		 187 aa  47.4  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.194748  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2515  protein of unknown function DUF820  26.54 
 
 		 241 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3591  protein of unknown function DUF820  26.54 
 
 		 241 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0889916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1054  protein of unknown function DUF820  25.3 
 
 		 229 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.172098  hitchhiker  0.00807661 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2287  protein of unknown function DUF820  25.88 
 
 		 239 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  hitchhiker  0.00756538 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3403  protein of unknown function DUF820  28.05 
 
 		 256 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.320038 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0100  protein of unknown function DUF820  26.38 
 
 		 248 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0097  protein of unknown function DUF820  26.38 
 
 		 248 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.609374 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1942  protein of unknown function DUF820  33.58 
 
 		 187 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2233  protein of unknown function DUF820  26.06 
 
 		 225 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2447  protein of unknown function DUF820  27.87 
 
 		 255 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2466  hypothetical protein  33.33 
 
 		 245 aa  44.3  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.82595  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0601  protein of unknown function DUF820  29.41 
 
 		 222 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.360831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3851  protein of unknown function DUF820  27.01 
 
 		 218 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2910  hypothetical protein  26.88 
 
 		 265 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.308542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3344  hypothetical protein  25.74 
 
 		 256 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0719317 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1625  hypothetical protein  32.93 
 
 		 244 aa  43.5  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1929  prevent-host-death family protein  35.8 
 
 		 251 aa  43.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1336  hypothetical protein  44.29 
 
 		 203 aa  43.5  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1536  protein of unknown function DUF820  25.6 
 
 		 239 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1227  protein of unknown function DUF820  24.07 
 
 		 217 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3663  protein of unknown function DUF820  28.89 
 
 		 255 aa  42.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.730325  normal  0.78404 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0193  protein of unknown function DUF820  41.79 
 
 		 186 aa  42.4  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>