65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_4244 on replicon NC_007490
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007490  RSP_4244  hypothetical protein  100 
 
 		 261 aa  541  1e-153  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200113  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1373  hypothetical protein  53.36 
 
 		 269 aa  271  1e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0476075  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0229  hypothetical protein  38.26 
 
 		 271 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2878  hypothetical protein  38.26 
 
 		 271 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4791  hypothetical protein  39.43 
 
 		 254 aa  168  7e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0204  diaminopimelate epimerase  37.88 
 
 		 246 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3235  protein of unknown function DUF955  35.62 
 
 		 270 aa  78.2  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.554214  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6832  protein of unknown function DUF955  29.67 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000166978  normal  0.022054 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0882  hypothetical protein  35.33 
 
 		 182 aa  65.9  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.956838 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4660  hypothetical protein  27.89 
 
 		 289 aa  65.1  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0678  hypothetical protein  32.35 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0204911  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7309  protein of unknown function DUF955  30.67 
 
 		 283 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  unclonable  0.00000000844609  hitchhiker  0.000028574 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0887  hypothetical protein  34.21 
 
 		 168 aa  59.7  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.102968  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0050  protein of unknown function DUF955  34.56 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000733414 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4357  hypothetical protein  25.93 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.162656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0226  hypothetical protein  30.86 
 
 		 174 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0412  hypothetical protein  29.29 
 
 		 188 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2247  protein of unknown function DUF955  28.1 
 
 		 251 aa  52.8  0.000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0026086 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2374  hypothetical protein  30 
 
 		 289 aa  52.4  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.126111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2718  hypothetical protein  27.03 
 
 		 266 aa  52.4  0.000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.588824 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0443  hypothetical protein  29.81 
 
 		 170 aa  52.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0678  protein of unknown function DUF955  27.59 
 
 		 147 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0128  hypothetical protein  38.67 
 
 		 175 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0552  hypothetical protein  23.87 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007616  NmulC_2781  hypothetical protein  30 
 
 		 291 aa  50.4  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.572225  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2203  hypothetical protein  31.97 
 
 		 282 aa  50.4  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00000000655138  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2296  hypothetical protein  26.09 
 
 		 307 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.738211  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6746  hypothetical protein  29.65 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5181  hypothetical protein  26.92 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0229751 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3186  hypothetical protein  26.92 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5098  hypothetical protein  26.92 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5156  hypothetical protein  32.69 
 
 		 292 aa  48.5  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40571  normal  0.261763 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0651  hypothetical protein  28.49 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1107  helix-turn-helix domain protein  27.61 
 
 		 410 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2671  protein of unknown function DUF955  31.19 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0743  hypothetical protein  32.06 
 
 		 296 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0909  hypothetical protein  30.77 
 
 		 221 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1191  hypothetical protein  30 
 
 		 177 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  hitchhiker  0.000518947  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3288  hypothetical protein  44.62 
 
 		 169 aa  46.2  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0186314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0096  hypothetical protein  28.28 
 
 		 289 aa  45.8  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2613  hypothetical protein  29.85 
 
 		 216 aa  45.8  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.277347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2661  hypothetical protein  29.85 
 
 		 216 aa  45.8  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2853  hypothetical protein  29.85 
 
 		 216 aa  45.8  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.14989  normal  0.354963 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12052  transcriptional regulator  27.27 
 
 		 346 aa  45.4  0.0009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.12403  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1350  hypothetical protein  27.34 
 
 		 362 aa  45.4  0.0009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2215  hypothetical protein  28.93 
 
 		 171 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00779528  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0852  hypothetical protein  32.73 
 
 		 224 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0868  hypothetical protein  32.73 
 
 		 224 aa  45.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4770  protein of unknown function DUF955  26.75 
 
 		 399 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.166779  hitchhiker  0.00150402 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1455  protein of unknown function DUF955  31.78 
 
 		 269 aa  45.4  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.642925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1806  hypothetical protein  30.67 
 
 		 370 aa  44.3  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.057388 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4600  protein of unknown function DUF955  35.05 
 
 		 350 aa  44.3  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1603  adenine deaminase  36.11 
 
 		 347 aa  44.3  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000366307  hitchhiker  0.000640003 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1391  hypothetical protein  27.73 
 
 		 342 aa  44.3  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0551  hypothetical protein  30.81 
 
 		 294 aa  44.3  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1121  hypothetical protein  29.17 
 
 		 267 aa  43.9  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000113456 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2812  helix-turn-helix domain protein  29.17 
 
 		 347 aa  43.9  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0133  hypothetical protein  32.65 
 
 		 391 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0138  hypothetical protein  32.65 
 
 		 391 aa  43.9  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.217596  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2504  protein of unknown function DUF955  33.04 
 
 		 272 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.557214 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1823  hypothetical protein  31.48 
 
 		 173 aa  43.5  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0277  hypothetical protein  27.34 
 
 		 248 aa  43.1  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000415699  normal  0.688868 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37310  hypothetical protein  26.21 
 
 		 302 aa  42.7  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1156  hypothetical protein  27.7 
 
 		 302 aa  42.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00041987  hitchhiker  0.00000269723 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1743  hypothetical protein  25.13 
 
 		 236 aa  42  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000786691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>