More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2124 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2124  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 		 309 aa  634    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.381981  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3930  enoyl-CoA hydratase  95.27 
 
 		 296 aa  584  1e-166  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3297  enoyl-CoA hydratase  94.26 
 
 		 296 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.571809  normal  0.0468568 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5262  enoyl-CoA hydratase  86.49 
 
 		 296 aa  512  1e-144  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509281  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0849  enoyl-CoA hydratase  66.67 
 
 		 301 aa  389  1e-107  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1011  enoyl-CoA hydratase  61.49 
 
 		 295 aa  358  8e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1349  enoyl-CoA hydratase  61.9 
 
 		 294 aa  355  5.999999999999999e-97  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5094  enoyl-CoA hydratase  60.88 
 
 		 289 aa  341  1e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.347482  normal  0.857753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1146  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  59.04 
 
 		 297 aa  339  4e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00156943  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1071  enoyl-CoA hydratase  55.89 
 
 		 290 aa  336  1.9999999999999998e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.231847  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3608  enoyl-CoA hydratase  62.03 
 
 		 291 aa  329  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.793375  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6455  enoyl-CoA hydratase  59.8 
 
 		 293 aa  329  3e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0438732 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0752  enoyl-CoA hydratase  56.33 
 
 		 298 aa  317  1e-85  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.620367 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0583  enoyl-CoA hydratase  52.12 
 
 		 307 aa  315  7e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0362745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2021  enoyl-CoA hydratase  59.66 
 
 		 299 aa  314  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.727479 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  54.26 
 
 		 282 aa  305  7e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0671919  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1010  enoyl-CoA hydratase  51.35 
 
 		 292 aa  296  3e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16470  Enoyl-CoA hydratase  47.6 
 
 		 291 aa  265  5.999999999999999e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.847675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1394  enoyl-CoA hydratase  50.17 
 
 		 288 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.168827  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3638  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  47.39 
 
 		 293 aa  243  3.9999999999999997e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1856  enoyl-CoA hydratase  46.69 
 
 		 288 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.933468  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4488  enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.72 
 
 		 290 aa  228  9e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1523  enoyl-CoA hydratase  44.2 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.61089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1500  enoyl-CoA hydratase  44.2 
 
 		 285 aa  223  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.537215  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1500  enoyl-CoA hydratase  43.84 
 
 		 285 aa  221  9.999999999999999e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00370  enoyl-CoA hydratase/isomerase family protein (AFU_orthologue; AFUA_1G01890)  39.36 
 
 		 291 aa  202  5e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.526484  normal  0.612902 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2248  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.03 
 
 		 274 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000226427  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  38.06 
 
 		 270 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  37.63 
 
 		 275 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 		 275 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.46 
 
 		 271 aa  179  4e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2749  enoyl-CoA hydratase  40.14 
 
 		 267 aa  179  5.999999999999999e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.258906  normal  0.025664 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  37.32 
 
 		 270 aa  178  1e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.68 
 
 		 271 aa  175  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  37.81 
 
 		 270 aa  172  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.63 
 
 		 271 aa  172  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  38.35 
 
 		 270 aa  169  4e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 		 269 aa  169  7e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.1 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  38.35 
 
 		 259 aa  165  1.0000000000000001e-39  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3256  enoyl-CoA hydratase  36.3 
 
 		 263 aa  164  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.184052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.26 
 
 		 274 aa  165  1.0000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  36.84 
 
 		 282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 		 294 aa  162  6e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0811  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.04 
 
 		 281 aa  162  8.000000000000001e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.7195  normal  0.177861 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.05 
 
 		 264 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  38.38 
 
 		 263 aa  159  6e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0481  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.84 
 
 		 270 aa  159  7e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2919  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.23 
 
 		 275 aa  159  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6854  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.82 
 
 		 268 aa  158  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  34.67 
 
 		 257 aa  158  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2735  enoyl-CoA hydratase  38.6 
 
 		 264 aa  156  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.04 
 
 		 273 aa  156  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1754  enoyl-CoA hydratase  36.46 
 
 		 276 aa  155  6e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1904  enoyl-CoA hydratase  38.06 
 
 		 272 aa  155  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0526145  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1999  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.62 
 
 		 270 aa  155  7e-37  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1820  enoyl-CoA hydratase  36.1 
 
 		 281 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1773  enoyl-CoA hydratase  36.1 
 
 		 281 aa  155  9e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3400  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.09 
 
 		 269 aa  154  1e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.213114  normal  0.431531 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  37.59 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.53 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  37.46 
 
 		 265 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 		 259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0876  enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  37.41 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0749  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35.46 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.71459  normal  0.616105 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1487  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.92 
 
 		 267 aa  150  3e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.404398  normal  0.0691329 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  36.88 
 
 		 263 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1276  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.46 
 
 		 257 aa  149  4e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.547187  normal  0.938839 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  35.59 
 
 		 263 aa  148  9e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4799  enoyl-CoA hydratase  35.02 
 
 		 262 aa  148  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.350769  normal  0.223067 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  37.41 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  37.41 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  37.72 
 
 		 262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3566  enoyl-CoA hydratase  37.41 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0331605  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3132  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.38 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.510281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0933  enoyl-CoA hydratase  37.41 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0614585  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  37.41 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  37.41 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  37.41 
 
 		 263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  32.98 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1462  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.42 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  37.05 
 
 		 260 aa  147  3e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3605  enoyl-CoA hydratase  33.45 
 
 		 266 aa  146  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120798  normal  0.818554 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  36.49 
 
 		 263 aa  146  5e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1758  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36 
 
 		 263 aa  146  6e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.599113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2261  enoyl-CoA hydratase  37.46 
 
 		 262 aa  146  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.406768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  36.84 
 
 		 262 aa  145  9e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0938  enoyl-CoA hydratase  34.07 
 
 		 260 aa  145  9e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35 
 
 		 273 aa  145  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.07 
 
 		 261 aa  145  9e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  35.23 
 
 		 264 aa  145  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3030  short chain enoyl-CoA hydratase  34.05 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.390398 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3078  enoyl-CoA hydratase  38.06 
 
 		 263 aa  145  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0533946 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2204  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.66 
 
 		 264 aa  145  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  37.93 
 
 		 663 aa  144  2e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  37.72 
 
 		 262 aa  144  2e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2761  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.62 
 
 		 261 aa  144  2e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.342506  normal  0.0137889 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.04 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>