More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3800 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_3800  major facilitator transporter  100 
 
 		 420 aa  821    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131241 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1579  major facilitator family transporter  88.39 
 
 		 402 aa  591  1e-167  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4451  major facilitator transporter  63.03 
 
 		 402 aa  450  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.915935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2456  major facilitator transporter  55.73 
 
 		 398 aa  402  1e-111  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.298076  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0048  major facilitator transporter  58.17 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1160  major facilitator superfamily MFS_1  53.33 
 
 		 403 aa  397  1e-109  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000554807  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0207  putative transporter transmembrane protein  56.95 
 
 		 408 aa  390  1e-107  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0038  major facilitator superfamily MFS_1  55.7 
 
 		 407 aa  389  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6377  major facilitator transporter  56.28 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860251  normal  0.451181 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1136  major facilitator superfamily MFS_1  59.57 
 
 		 408 aa  389  1e-107  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.454267 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2979  major facilitator transporter  55.92 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.504162  normal  0.470483 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2601  major facilitator transporter  53.33 
 
 		 404 aa  387  1e-106  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.206455 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0328  purine ribonucleoside efflux pump NepI  53.18 
 
 		 397 aa  384  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1362  major facilitator transporter  58.54 
 
 		 403 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.726387  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5629  major facilitator transporter  56.27 
 
 		 404 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.208414  normal  0.0407096 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6467  major facilitator transporter  58.54 
 
 		 403 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.070181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3286  major facilitator superfamily MFS_1  53.76 
 
 		 411 aa  372  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3070  membrane protein OpdE  52.51 
 
 		 402 aa  370  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3611  major facilitator superfamily MFS_1  54.75 
 
 		 410 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0632  major facilitator transporter  54.75 
 
 		 410 aa  363  3e-99  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1945  major facilitator transporter  51.94 
 
 		 401 aa  361  1e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2319  major facilitator superfamily MFS_1  48.88 
 
 		 396 aa  359  5e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0805208  normal  0.902577 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2475  major facilitator transporter  54.5 
 
 		 402 aa  359  7e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46904  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2738  major facilitator superfamily MFS_1  51.18 
 
 		 416 aa  354  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2011  major facilitator superfamily MFS_1  53.97 
 
 		 409 aa  353  4e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4801  major facilitator transporter  51.87 
 
 		 376 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.603186  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0719  major facilitator superfamily MFS_1  51.29 
 
 		 400 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0835  major facilitator superfamily MFS_1  48.91 
 
 		 433 aa  312  9e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1448  major facilitator superfamily MFS_1  48.87 
 
 		 403 aa  311  1e-83  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.015793  normal  0.569498 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1406  major facilitator superfamily MFS_1  48.59 
 
 		 403 aa  309  6.999999999999999e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.61061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6830  major facilitator transporter  48.34 
 
 		 394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3472  major facilitator transporter  48 
 
 		 403 aa  303  5.000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.059656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0782  major facilitator superfamily MFS_1  48.61 
 
 		 384 aa  300  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0032  ribonucleoside transporter  42.56 
 
 		 396 aa  298  1e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.646856 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4025  ribonucleoside transporter  42.38 
 
 		 394 aa  297  2e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.84574 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2563  major facilitator transporter  48.87 
 
 		 403 aa  296  4e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3875  ribonucleoside transporter  42.38 
 
 		 451 aa  296  5e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0037  ribonucleoside transporter  42.38 
 
 		 451 aa  296  5e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4170  ribonucleoside transporter  42.38 
 
 		 451 aa  296  5e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03546  predicted transporter  42.38 
 
 		 451 aa  296  7e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03488  hypothetical protein  42.38 
 
 		 451 aa  296  7e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0041  major facilitator superfamily MFS_1  42.38 
 
 		 412 aa  295  8e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4887  major facilitator transporter  47.59 
 
 		 398 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5383  major facilitator transporter  47.59 
 
 		 398 aa  295  1e-78  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5114  major facilitator transporter  49.44 
 
 		 399 aa  293  3e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.958171  normal  0.0993786 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3960  major facilitator transporter  48.59 
 
 		 400 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.116559 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0841  major facilitator superfamily MFS_1  44.88 
 
 		 395 aa  290  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5294  major facilitator transporter  47.09 
 
 		 379 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.264331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3560  major facilitator transporter  48.31 
 
 		 400 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2769  major facilitator transporter  44.63 
 
 		 401 aa  289  6e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4854  major facilitator superfamily MFS_1  46.49 
 
 		 395 aa  288  2e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.011677  normal  0.12131 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35500  Major facilitator superfamily transporter  48.48 
 
 		 376 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2353  major facilitator transporter  44.88 
 
 		 413 aa  274  2.0000000000000002e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3097  major facilitator transporter  44.26 
 
 		 408 aa  273  3e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.326066  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1531  major facilitator transporter  38.81 
 
 		 400 aa  242  9e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4169  major facilitator transporter  37.17 
 
 		 401 aa  235  1.0000000000000001e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.240515  normal  0.577442 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7381  permease  39.66 
 
 		 402 aa  229  9e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0862221  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1133  major facilitator superfamily MFS_1  36.57 
 
 		 397 aa  207  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.144767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2898  major facilitator superfamily MFS_1  39.37 
 
 		 402 aa  203  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.537958  normal  0.729301 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1371  major facilitator superfamily MFS_1  34.62 
 
 		 412 aa  197  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.070689  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5135  major facilitator transporter  34 
 
 		 399 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.774559  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2584  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 		 402 aa  177  2e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.153183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1381  major facilitator transporter  38.26 
 
 		 394 aa  178  2e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2129  major facilitator transporter  31.23 
 
 		 408 aa  176  5e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0230602 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1021  major facilitator transporter  33.53 
 
 		 415 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5698  major facilitator superfamily MFS_1  32.65 
 
 		 415 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.574634 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2152  major facilitator transporter  31.44 
 
 		 408 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2647  major facilitator family transporter  31.19 
 
 		 408 aa  167  2e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3182  major facilitator transporter  31.19 
 
 		 413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5229  transporter  31.49 
 
 		 406 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.276614 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3714  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 418 aa  160  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.310238 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20360  arabinose efflux permease family protein  32.29 
 
 		 410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0512436  normal  0.41144 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2790  major facilitator superfamily MFS_1  30.22 
 
 		 398 aa  153  5.9999999999999996e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0202  major facilitator superfamily MFS_1  32.51 
 
 		 390 aa  152  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1673  major facilitator superfamily MFS_1  32.49 
 
 		 402 aa  151  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4094  major facilitator superfamily MFS_1  32.3 
 
 		 422 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5451  major facilitator transporter  29.31 
 
 		 407 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0131975  normal  0.150445 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4902  major facilitator superfamily MFS_1  30.17 
 
 		 735 aa  146  6e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283889  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2484  major facilitator superfamily MFS_1  30.2 
 
 		 397 aa  145  2e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1897  major facilitator transporter  29.07 
 
 		 397 aa  140  3.9999999999999997e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1788  major facilitator transporter  29.82 
 
 		 399 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0140849 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3194  sugar efflux transporter  28.11 
 
 		 419 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2226  sugar efflux transporter  28.22 
 
 		 396 aa  132  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3686  carbohydrate transporter, putative  30.73 
 
 		 399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3182  major facilitator transporter  26.32 
 
 		 404 aa  130  3e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3102  major facilitator transporter  25.55 
 
 		 415 aa  130  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2694  major facilitator transporter  28.86 
 
 		 392 aa  129  9.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0303666  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0138  sugar efflux transporter  30.16 
 
 		 395 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.789478  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5288  major facilitator transporter  28.27 
 
 		 404 aa  128  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.564821 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0228  major facilitator family transporter  30.53 
 
 		 390 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5225  sugar efflux transporter  26.85 
 
 		 397 aa  127  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000000397206  normal  0.170795 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1627  sugar efflux transporter  28.15 
 
 		 396 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2718  major facilitator family transporter  30.53 
 
 		 390 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2360  major facilitator family transporter  30.53 
 
 		 390 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2440  major facilitator family transporter  30.53 
 
 		 390 aa  127  5e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1694  sugar efflux transporter  28.15 
 
 		 396 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0396225  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0388  major facilitator superfamily MFS_1  29.5 
 
 		 390 aa  126  6e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.295618  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1648  sugar efflux transporter  28.15 
 
 		 396 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1813  sugar efflux transporter  28.15 
 
 		 396 aa  126  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0713  major facilitator transporter  30.53 
 
 		 390 aa  126  6e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>