105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_3582 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_1814  hypothetical protein  98.41 
 
 		 100 aa  122  1e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3582  hypothetical protein  100 
 
 		 63 aa  121  3e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.765416  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1491  hypothetical protein  79.37 
 
 		 63 aa  100  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.248534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1840  hypothetical protein  52.54 
 
 		 60 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327409  normal  0.891126 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22880  putative Fe-S protein  49.12 
 
 		 70 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.900753  normal  0.190729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1931  putative Fe-S protein  49.12 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236199  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5160  hypothetical protein  44.44 
 
 		 57 aa  57.8  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3157  hypothetical protein  35.59 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982589  normal  0.105283 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2468  hypothetical protein  36.54 
 
 		 60 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.835928  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2864  hypothetical protein  34.04 
 
 		 66 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2233  hypothetical protein  37.25 
 
 		 60 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.256275  normal  0.539616 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2107  hypothetical protein  34.78 
 
 		 66 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4259  hypothetical protein  35.59 
 
 		 69 aa  50.4  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.699772  normal  0.0946677 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1275  hypothetical protein  37.1 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3626  hypothetical protein  34.78 
 
 		 66 aa  50.4  0.000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.200251  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1466  hypothetical protein  38.98 
 
 		 72 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5051  hypothetical protein  40 
 
 		 57 aa  50.1  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.728065 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1617  hypothetical protein  38.18 
 
 		 303 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2045  hypothetical protein  36.51 
 
 		 68 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0738495  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2290  hypothetical protein  34.78 
 
 		 66 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.813592 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1889  protein of unknown function DUF1289  33.33 
 
 		 68 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.102819  normal  0.458319 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1455  hypothetical protein  41.67 
 
 		 74 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.13475 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0179  hypothetical protein  35.71 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1551  hypothetical protein  36.36 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355099  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4266  hypothetical protein  45.24 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.710344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1060  hypothetical protein  45.24 
 
 		 65 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1012  hypothetical protein  47.5 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.547742 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4760  hypothetical protein  40 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.177325  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3407  hypothetical protein  40 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6017  hypothetical protein  45.45 
 
 		 56 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3459  hypothetical protein  34.92 
 
 		 65 aa  47.4  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.203383 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4775  protein of unknown function DUF1289  40.74 
 
 		 57 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0172971  hitchhiker  0.00190197 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3396  hypothetical protein  33.33 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0264738  normal  0.348066 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2479  hypothetical protein  38.46 
 
 		 60 aa  47  0.00009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00121761  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1997  hypothetical protein  40.74 
 
 		 61 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.205951  normal  0.0114926 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2528  hypothetical protein  37.25 
 
 		 72 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2063  hypothetical protein  35.29 
 
 		 73 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15252  normal  0.0794579 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0350  hypothetical protein  46 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0364  hypothetical protein  46 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.164105  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3407  hypothetical protein  37.5 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.29096  normal  0.480404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1781  hypothetical protein  36.21 
 
 		 155 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.686046  normal  0.010605 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4164  hypothetical protein  40.48 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.197255 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5318  protein of unknown function DUF1289  38.89 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0754  protein of unknown function DUF1289  37.93 
 
 		 66 aa  45.4  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2184  protein of unknown function DUF1289  30.77 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.768607  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0541  hypothetical protein  46.94 
 
 		 52 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15880  hypothetical protein  37.5 
 
 		 64 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0875787 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3202  hypothetical protein  33.33 
 
 		 61 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0163  hypothetical protein  36.21 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3823  YbaK/prolyl-tRNA synthetase associated protein  40.38 
 
 		 248 aa  44.7  0.0005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2102  hypothetical protein  32.73 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.771844  normal  0.72512 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1366  hypothetical protein  37.5 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.985025  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5278  hypothetical protein  31.03 
 
 		 61 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0311  hypothetical protein  41.51 
 
 		 110 aa  43.9  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2867  hypothetical protein  36 
 
 		 64 aa  43.9  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.510606  hitchhiker  0.0000394649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3515  hypothetical protein  36.07 
 
 		 155 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.16682  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1057  hypothetical protein  35.85 
 
 		 79 aa  43.9  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.350668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4109  hypothetical protein  38.18 
 
 		 61 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.711121 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41450  hypothetical protein  36.07 
 
 		 155 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1838  hypothetical protein  36.21 
 
 		 80 aa  43.5  0.0009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0228  hypothetical protein  36.54 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3751  hypothetical protein  33.93 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1727  hypothetical protein  33.93 
 
 		 156 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.557178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2144  hypothetical protein  33.33 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4272  hypothetical protein  42.59 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0930636 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2320  protein of unknown function DUF1289  31.67 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3430  hypothetical protein  34.48 
 
 		 155 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.843526 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0119  protein of unknown function DUF1289  42.86 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.421597 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1318  protein of unknown function DUF1289  42.5 
 
 		 267 aa  42.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.196513  normal  0.297563 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5224  hypothetical protein  32.61 
 
 		 74 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5051  hypothetical protein  36.84 
 
 		 67 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.443997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5133  hypothetical protein  32.61 
 
 		 74 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.581719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5172  protein of unknown function DUF1289  31.88 
 
 		 154 aa  42  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4045  hypothetical protein  33.33 
 
 		 156 aa  41.6  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1947  hypothetical protein  46.15 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00081955  normal  0.856414 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6327  hypothetical protein  36.84 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1599  hypothetical protein  38 
 
 		 65 aa  41.6  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.317306  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1676  hypothetical protein  36.84 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.412222  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1752  hypothetical protein  36.84 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1605  hypothetical protein  29.51 
 
 		 73 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0647603  normal  0.193551 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06026  hypothetical protein  34.48 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5285  hypothetical protein  32.61 
 
 		 74 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0248  hypothetical protein  32.61 
 
 		 70 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.561278 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1768  hypothetical protein  36.84 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.459955 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1674  hypothetical protein  36.84 
 
 		 67 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0337304  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2340  hypothetical protein  33.33 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641884  hitchhiker  0.000153816 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2577  hypothetical protein  32.14 
 
 		 158 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.196464  hitchhiker  0.00127539 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1765  hypothetical protein  39.66 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.55498e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1508  hypothetical protein  34.48 
 
 		 80 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.144967 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1941  hypothetical protein  33.33 
 
 		 171 aa  41.2  0.005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00337629 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1874  hypothetical protein  39.66 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  unclonable  0.00000000000160461  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1018  protein of unknown function DUF1289  36.21 
 
 		 89 aa  41.2  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0740712  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2641  hypothetical protein  35 
 
 		 159 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4672  hypothetical protein  35 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2312  protein of unknown function DUF1289  43.59 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.292265  normal  0.245299 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0775  hypothetical protein  41.46 
 
 		 102 aa  40.4  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.385738  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5495  hypothetical protein  30 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2683  hypothetical protein  36.36 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.344711  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1341  hypothetical protein  36.36 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0389331  normal  0.17465 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4029  hypothetical protein  35 
 
 		 147 aa  40  0.009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>