63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0985 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0985  DNA binding protein  100 
 
 
115 aa  234  3e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  1.23712e-11  unclonable  1.2964e-06 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2894  XRE family transcriptional regulator  37.62 
 
 
131 aa  62.8  1e-09  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1891  XRE family transcriptional regulator  39.22 
 
 
121 aa  61.6  3e-09  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195255  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3114  XRE family transcriptional regulator  39 
 
 
120 aa  56.6  1e-07  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1998  hypothetical protein  40.21 
 
 
142 aa  56.6  1e-07  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.846621  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2077  hypothetical protein  40.21 
 
 
126 aa  56.2  2e-07  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0843  XRE family transcriptional regulator  41.24 
 
 
130 aa  55.1  4e-07  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0253  hypothetical protein  35.64 
 
 
118 aa  53.9  7e-07  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3945  transcriptional regulator, XRE family  38.38 
 
 
125 aa  52.4  2e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4677  transcriptional regulator, XRE family  33.91 
 
 
120 aa  52.4  2e-06  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4271  transcriptional regulator, XRE family  37.62 
 
 
125 aa  52.8  2e-06  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.313399 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  49.12 
 
 
183 aa  51.2  4e-06  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4662  hypothetical protein  29.46 
 
 
119 aa  49.7  1e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.700483  normal  0.0309667 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 
175 aa  48.9  2e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6140  transcriptional regulator, XRE family  35.29 
 
 
466 aa  48.5  3e-05  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.29056  normal  0.20843 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3219  XRE family transcriptional regulator  31.03 
 
 
125 aa  47.8  5e-05  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  43.33 
 
 
141 aa  47  9e-05  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  41.82 
 
 
128 aa  46.6  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  35.48 
 
 
128 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  36.62 
 
 
500 aa  46.2  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 
161 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 
176 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 
161 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 
161 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0643  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 
191 aa  45.1  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.605698  hitchhiker  0.00857355 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2927  transcriptional regulator, XRE family  32.47 
 
 
130 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.298234 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 
145 aa  44.7  0.0004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  43.86 
 
 
182 aa  44.7  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0858  hypothetical protein  34.85 
 
 
461 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0175977  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2186  MerR family transcriptional regulator  34.85 
 
 
461 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2308  hypothetical protein  34.85 
 
 
461 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0696  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 
228 aa  44.7  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 
277 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3488  XRE family transcriptional regulator  38.1 
 
 
126 aa  43.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
170 aa  43.5  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 
325 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  34.43 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  37.5 
 
 
131 aa  42.7  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  36.07 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
191 aa  42.7  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2004  hypothetical protein  32.08 
 
 
470 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.860284  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1187  Cro/CI family transcriptional regulator  32.08 
 
 
470 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0828  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 
282 aa  41.6  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4240  hypothetical protein  32.86 
 
 
472 aa  41.6  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  34.07 
 
 
140 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1147  hypothetical protein  32.08 
 
 
472 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  37.29 
 
 
191 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3988  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475712  normal  0.319411 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0716  transcriptional regulator  33.33 
 
 
464 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.582865  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3436  XRE family transcriptional regulator  38.64 
 
 
463 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.288452  normal  0.476438 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  36.36 
 
 
156 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3096  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 
477 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0650  transcriptional regulator, XRE family  30.21 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2397  XRE family transcriptional regulator  37.04 
 
 
110 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00284023 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03070  predicted transcriptional regulator  32.2 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  40.35 
 
 
156 aa  40.8  0.006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2772  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 
250 aa  40.8  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4898  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
127 aa  40.8  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.680756  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12758  transcriptional regulator  42.59 
 
 
112 aa  40.8  0.006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.34539e-07  normal  0.119719 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3598  XRE family transcriptional regulator  35.94 
 
 
477 aa  40.8  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.149473  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0067  XRE family transcriptional regulator  34.92 
 
 
233 aa  40.4  0.009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3197  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 
477 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>