234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_4582 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1264  fusaric acid resistance protein region  98.48 
 
 		 725 aa  1447    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1218  fusaric acid resistance protein, putative  67.81 
 
 		 728 aa  943    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.555217  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1046  fusaric acid resistance protein region  68.33 
 
 		 729 aa  972    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0210878  normal  0.52784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1212  hypothetical protein  62.32 
 
 		 731 aa  875    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0420333  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0939  fusaric acid resistance protein region  75.1 
 
 		 730 aa  1117    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0867  fusaric acid resistance protein region  96.83 
 
 		 725 aa  1408    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4582  fusaric acid resistance protein region  100 
 
 		 725 aa  1466    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0691108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04000  Fusaric acid resistance domain protein  51.64 
 
 		 725 aa  718    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.302401  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1345  AraE family aromatic acid exporter  47.49 
 
 		 736 aa  642    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_13530  putative outer membrane protein  62.61 
 
 		 731 aa  887    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52940  hypothetical protein  55.24 
 
 		 731 aa  793    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4459  fusaric acid resistance protein region  98.48 
 
 		 725 aa  1447    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4639  fusaric acid resistance protein region  55.98 
 
 		 732 aa  792    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2782  Fusaric acid resistance protein conserved region  48.64 
 
 		 739 aa  644    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747937 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1583  fusaric acid resistance protein region  48.02 
 
 		 744 aa  629  1e-179  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.434957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4593  fusaric acid resistance protein  46.82 
 
 		 734 aa  628  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.131682  normal  0.850292 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1369  fusaric acid resistance protein region  47.08 
 
 		 733 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.205794  normal  0.721238 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1330  fusaric acid resistance protein region  47.08 
 
 		 733 aa  625  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1426  fusaric acid resistance protein region  47.44 
 
 		 734 aa  622  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0966  fusaric acid resistance protein region  47.36 
 
 		 734 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.499354  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1448  fusaric acid resistance protein region  47.36 
 
 		 734 aa  617  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2626  fusaric acid resistance domain-containing protein  48.73 
 
 		 733 aa  609  1e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.215952  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1867  fusaric acid resistance protein region  48.14 
 
 		 733 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00213786 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0934  fusaric acid resistance protein, putative  48.79 
 
 		 733 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1853  fusaric acid resistance protein, putative  48.79 
 
 		 733 aa  601  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1467  putative fusaric acid resistance protein  48.79 
 
 		 733 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0414  putative fusaric acid resistance protein  48.79 
 
 		 733 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.800995  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1677  fusaric acid resistance domain-containing protein  48.79 
 
 		 733 aa  601  1e-170  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1699  putative fusaric acid resistance protein  48.79 
 
 		 733 aa  601  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.143561  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0748  putative fusaric acid resistance protein  48.79 
 
 		 733 aa  601  1e-170  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5075  fusaric acid resistance protein region  40.63 
 
 		 726 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0750969  normal  0.788772 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4798  Fusaric acid resistance protein conserved region  40.8 
 
 		 722 aa  497  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0857117  hitchhiker  0.0000430951 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4213  fusaric acid resistance protein region  40.65 
 
 		 726 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.260755 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4042  fusaric acid resistance protein region  40.82 
 
 		 727 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.599052  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4324  fusaric acid resistance protein region  40.82 
 
 		 727 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1682  fusaric acid resistance protein  40.9 
 
 		 727 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.158795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3739  fusaric acid resistance protein region  40.25 
 
 		 726 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.7262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3197  fusaric acid resistance protein region  40.71 
 
 		 727 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4286  fusaric acid resistance protein region  40.41 
 
 		 727 aa  459  1e-127  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.566792 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0595  fusaric acid resistance domain-containing protein  39.89 
 
 		 745 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2328  fusaric acid resistance domain-containing protein  39.89 
 
 		 745 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0873  fusaric acid resistance domain-containing protein  39.89 
 
 		 745 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1110  putative fusaric acid resistance protein  39.56 
 
 		 745 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.853894  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1024  putative fusaric acid resistance protein  39.56 
 
 		 745 aa  451  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1840  fusaric acid resistance domain-containing protein  39.89 
 
 		 745 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.868681  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1647  fusaric acid resistance domain-containing protein  39.89 
 
 		 743 aa  429  1e-118  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0396  aromatic acid (fusaric acid) exporter, (ArAE)family  38.73 
 
 		 727 aa  411  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2911  hypothetical protein  33.8 
 
 		 726 aa  376  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4279  putative fusaric acid resistance protein  31.25 
 
 		 728 aa  318  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2583  fusaric acid resistance protein region  30.29 
 
 		 727 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1863  hypothetical protein  42.71 
 
 		 411 aa  274  3e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0667256 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5713  fusaric acid resistance protein region  27.63 
 
 		 750 aa  227  6e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  0.787817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21280  hypothetical protein  28.4 
 
 		 664 aa  180  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1167  fusaric acid resistance protein region  25.49 
 
 		 676 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00240521 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6856  fusaric acid resistance protein  26.59 
 
 		 700 aa  171  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1263  fusaric acid resistance protein  27.7 
 
 		 676 aa  169  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4120  hypothetical protein  28.5 
 
 		 679 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.215585  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47810  hypothetical protein  28.66 
 
 		 679 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00112495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3787  fusaric acid resistance protein region  28.45 
 
 		 673 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.376332  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4581  fusaric acid resistance protein region  28.45 
 
 		 673 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0331097  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5724  fusaric acid resistance protein region  28.45 
 
 		 673 aa  162  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.367852 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4267  fusaric acid resistance protein region  26.97 
 
 		 662 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4470  fusaric acid resistance protein region  28.87 
 
 		 676 aa  157  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.435927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4008  fusaric acid resistance protein region  28.14 
 
 		 676 aa  156  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1150  fusaric acid resistance protein region  27.95 
 
 		 662 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0139844  normal  0.271992 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2211  fusaric acid resistance protein region  25 
 
 		 670 aa  153  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0710968  hitchhiker  0.000740189 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4316  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.08 
 
 		 672 aa  152  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.888384  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2164  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.87 
 
 		 670 aa  150  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1184  fusaric acid resistance protein region  27.3 
 
 		 662 aa  147  6e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.476236  normal  0.23816 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3343  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.26 
 
 		 688 aa  147  8.000000000000001e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1250  hypothetical protein  25.04 
 
 		 690 aa  145  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2655  fusaric acid resistance protein region  27.94 
 
 		 711 aa  145  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1818  hypothetical protein  39.17 
 
 		 664 aa  145  3e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1992  fusaric acid resistance protein region  27.43 
 
 		 702 aa  143  9e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.355593  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0867  Fusaric acid resistance protein conserved region  27.01 
 
 		 692 aa  139  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1490  fusaric acid resistance protein region  27 
 
 		 662 aa  139  2e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.205086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2636  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.68 
 
 		 741 aa  138  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1401  fusaric acid resistance protein region  27.46 
 
 		 714 aa  138  4e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.855004 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0760  hypothetical protein  24.05 
 
 		 698 aa  137  6.0000000000000005e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.183091  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3001  fusaric acid resistance protein region  23.91 
 
 		 697 aa  137  9e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2320  fusaric acid resistance protein region  25.47 
 
 		 713 aa  136  9.999999999999999e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.300913  normal  0.199301 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5223  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.57 
 
 		 678 aa  136  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0716017 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33190  hypothetical protein  26.02 
 
 		 724 aa  134  5e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0014137 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4864  fusaric acid resistance protein region  28.52 
 
 		 679 aa  134  6.999999999999999e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.436364  normal  0.382045 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2253  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.41 
 
 		 653 aa  133  1.0000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0240  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.4 
 
 		 680 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.182295 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1952  fusaric acid resistance protein region  26.11 
 
 		 704 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5462  fusaric acid resistance protein region  26 
 
 		 718 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0737125 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_4011  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.3 
 
 		 679 aa  129  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0926911 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6623  Fusaric acid resistance protein conserved region  26.57 
 
 		 700 aa  128  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2821  hypothetical protein  33.33 
 
 		 724 aa  126  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.596664  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3193  Fusaric acid resistance protein conserved region  25.6 
 
 		 699 aa  126  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.624391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0216  fusaric acid resistance protein region  27.06 
 
 		 699 aa  126  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.42737  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0484  fusaric acid resistance protein region  28.38 
 
 		 679 aa  126  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.122808  normal  0.212474 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0171  fusaric acid resistance protein region  25.23 
 
 		 687 aa  124  5e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2612  AraE family aromatic acid exporter  28.25 
 
 		 700 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0134  fusaric acid resistance protein region  25.18 
 
 		 681 aa  120  7.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.222528  normal  0.532934 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4155  hypothetical protein  25.37 
 
 		 672 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0306653  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4793  putative inner membrane efflux transporter  24.76 
 
 		 659 aa  120  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.310622  normal  0.638285 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2983  Fusaric acid resistance protein conserved region  24.35 
 
 		 697 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>