120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2754 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_2754  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 332 aa  700    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2787  radical SAM domain-containing protein  37.88 
 
 		 307 aa  229  5e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3263  radical SAM family Fe-S oxidoreductase  24.09 
 
 		 339 aa  108  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.620706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0796  Radical SAM domain protein  24.15 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.151454 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0240  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 		 340 aa  106  6e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.548206  normal  0.016979 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0205  Radical SAM domain protein  21.88 
 
 		 340 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0667932  normal  0.157312 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3345  radical SAM domain-containing protein  25.81 
 
 		 338 aa  90.5  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1114  radical SAM domain-containing protein  24.15 
 
 		 322 aa  90.9  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0901  radical SAM superfamily protein  24.15 
 
 		 358 aa  90.5  4e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3252  Elongator protein 3/MiaB/NifB  23.47 
 
 		 313 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0506  radical SAM domain-containing protein  24.38 
 
 		 319 aa  89  1e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00221713  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1124  Fe-S oxidoreductases  22.9 
 
 		 338 aa  85.5  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  24.47 
 
 		 332 aa  85.1  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2349  Radical SAM domain protein  23.6 
 
 		 873 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0804  hypothetical protein  20.92 
 
 		 342 aa  81.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0369  radical SAM domain-containing protein  23.95 
 
 		 317 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.722387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  26.92 
 
 		 337 aa  79.3  0.00000000000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2551  radical SAM family protein  27.59 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0419  Fe-S oxidoreductase-like protein  24.72 
 
 		 284 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.399377  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0802  radical SAM domain-containing protein  26.25 
 
 		 349 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.186903  normal  0.699659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1849  Radical SAM domain protein  20.72 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2743  radical SAM family protein  24.09 
 
 		 335 aa  72.8  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0967  radical SAM domain-containing protein  23.73 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.182528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2553  radical SAM family protein  23.43 
 
 		 341 aa  72  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3724  Radical SAM domain protein  22.65 
 
 		 355 aa  72  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2552  radical SAM family protein  25 
 
 		 340 aa  71.6  0.00000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4173  Radical SAM domain protein  23.75 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4900  radical SAM domain-containing protein  22.54 
 
 		 351 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594108  decreased coverage  0.000796621 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4172  Radical SAM domain protein  25.5 
 
 		 338 aa  70.1  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1126  Fe-S oxidoreductase  24.39 
 
 		 347 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3289  Radical SAM domain protein  25.61 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.814974  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2224  Radical SAM domain protein  22.9 
 
 		 329 aa  67.4  0.0000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4175  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 		 342 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  23.69 
 
 		 778 aa  64.3  0.000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3342  radical SAM domain-containing protein  22.73 
 
 		 359 aa  63.5  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3406  radical SAM domain-containing protein  23.55 
 
 		 330 aa  61.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2515  radical SAM domain-containing protein  24.27 
 
 		 471 aa  60.5  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0363  radical SAM domain-containing protein  25.15 
 
 		 327 aa  58.9  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.411689  normal  0.816586 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0411  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.239535 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2884  Fe-S oxidoreductase  24.02 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00154845  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0197  radical SAM family protein  23.18 
 
 		 367 aa  58.5  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  22.46 
 
 		 800 aa  57.4  0.0000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1873  Radical SAM domain protein  26.39 
 
 		 450 aa  56.6  0.0000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0885  glycosyltransferase  32.17 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.356928  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1394  radical SAM domain-containing protein  24.38 
 
 		 451 aa  56.2  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1605  hypothetical protein  23 
 
 		 305 aa  56.2  0.0000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1235  radical SAM domain-containing protein  21.43 
 
 		 434 aa  55.8  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.9409  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0905  radical SAM domain-containing protein  27.7 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.54943  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0928  radical SAM domain-containing protein  23.6 
 
 		 355 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0991666  normal  0.304718 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0122  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 		 289 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1458  heme biosynthesis protein  29.08 
 
 		 349 aa  53.5  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5580  hypothetical protein  20.34 
 
 		 292 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.488042  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5552  hypothetical protein  20.34 
 
 		 292 aa  53.1  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.05586e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5597  hypothetical protein  20.34 
 
 		 292 aa  52.8  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5311  hypothetical protein  20.34 
 
 		 292 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5139  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  20.34 
 
 		 292 aa  52.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.219844  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5707  hypothetical protein  20.34 
 
 		 292 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1043  radical SAM domain-containing protein  23.31 
 
 		 297 aa  53.1  0.000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.104928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5642  hypothetical protein  20.34 
 
 		 292 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00436698  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1542  Radical SAM domain protein  20.94 
 
 		 372 aa  52.4  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0085806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2413  radical SAM domain-containing protein  24.02 
 
 		 445 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.336702  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1390  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.17 
 
 		 296 aa  52.4  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.212128  normal  0.415748 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0342  radical SAM domain-containing protein  24.65 
 
 		 335 aa  52  0.00001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0151075 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5367  hypothetical protein  20.42 
 
 		 279 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0445867  hitchhiker  0.0000016486 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5153  molybdenum cofactor biosynthesis enzyme  20 
 
 		 292 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.120302  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0871  radical SAM family protein  24.14 
 
 		 357 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1255  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.23 
 
 		 319 aa  51.6  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2248  radical SAM domain-containing protein  21.39 
 
 		 332 aa  51.6  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000187282  normal  0.0755271 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1915  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.88 
 
 		 321 aa  50.8  0.00003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5251  radical SAM domain-containing protein  20 
 
 		 292 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14401  hypothetical protein  24.15 
 
 		 311 aa  50.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.32313  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0838  radical SAM domain-containing protein  25.95 
 
 		 465 aa  50.1  0.00006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0155744  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.87 
 
 		 348 aa  49.3  0.00008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.28 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2507  radical SAM domain-containing protein  24.36 
 
 		 421 aa  48.9  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0853  radical SAM domain-containing protein  23.16 
 
 		 332 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.796243 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.68 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.99 
 
 		 298 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3973  radical SAM domain-containing protein  22.34 
 
 		 292 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0952  Radical SAM domain protein  23.53 
 
 		 437 aa  48.5  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00605498  hitchhiker  0.00000184095 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0159  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.88 
 
 		 322 aa  48.1  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000610838  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1880  Radical SAM domain protein  25.76 
 
 		 359 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1381  radical SAM domain-containing protein  20 
 
 		 345 aa  48.1  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  26.36 
 
 		 445 aa  47.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  21.82 
 
 		 347 aa  47.8  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5046  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.67 
 
 		 337 aa  47.4  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.41268  normal  0.0131922 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.99 
 
 		 298 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08560  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  23.91 
 
 		 366 aa  47  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.209245  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1326  hypothetical protein  21.45 
 
 		 337 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0224562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  26.83 
 
 		 326 aa  46.6  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4536  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.67 
 
 		 337 aa  47  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.792195 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.84 
 
 		 299 aa  47  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2991  Radical SAM domain protein  20.77 
 
 		 397 aa  46.6  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2056  Radical SAM domain protein  22.73 
 
 		 340 aa  46.2  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1943  Radical SAM domain protein  22.52 
 
 		 315 aa  45.8  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.227047  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1692  radical SAM family protein  20.47 
 
 		 290 aa  45.8  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  26.82 
 
 		 292 aa  45.4  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4751  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.79 
 
 		 356 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3864  Radical SAM domain protein  21.1 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0170641  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1363  radical SAM domain-containing protein  25.53 
 
 		 458 aa  45.4  0.001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.359943  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>