More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0437 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0437  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
412 aa  830    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.148474  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3601  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.37 
 
 
399 aa  348  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.93 
 
 
394 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000651793  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2677  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.49 
 
 
395 aa  322  7e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.971959  normal  0.344308 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1119  sensor histidine kinase/response regulator  42.12 
 
 
420 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.09 
 
 
396 aa  311  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 
396 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  37.92 
 
 
391 aa  260  4e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3357  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.34 
 
 
970 aa  154  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.984464  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4259  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 
804 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2000  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 
515 aa  151  2e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2683  histidine kinase  36.29 
 
 
490 aa  150  4e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000711589 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
488 aa  149  6e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  34.74 
 
 
674 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0675  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
855 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
595 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0599  sensor histidine kinase  32.08 
 
 
516 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.712445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1057  histidine kinase  35.66 
 
 
673 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0263803 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2497  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.18 
 
 
1168 aa  146  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0638  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.48 
 
 
373 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 
662 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1952  histidine kinase  35.02 
 
 
560 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2492  sensory box histidine kinase  36.02 
 
 
830 aa  144  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2812  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
495 aa  144  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2923  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.08 
 
 
541 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.252505  hitchhiker  0.00000000439976 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1867  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
586 aa  143  5e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2657  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
829 aa  143  6e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0672  histidine kinase  37.77 
 
 
373 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  32.53 
 
 
614 aa  143  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.47 
 
 
546 aa  142  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0531  sensory histidine kinase AtoS  35.66 
 
 
611 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 
522 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
630 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2011  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 
584 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
548 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0420  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.2 
 
 
458 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00956949  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1578  histidine kinase  35.65 
 
 
829 aa  141  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0672  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.34 
 
 
373 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  34 
 
 
548 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1972  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.82 
 
 
747 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.466348  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
654 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1907  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.4 
 
 
747 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2057  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.82 
 
 
747 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.376311  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1952  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.79 
 
 
752 aa  139  7e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.664907  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1016  sensor protein ZraS  36.97 
 
 
450 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0625472  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 
548 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4097  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 
766 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0282  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
494 aa  138  2e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3826  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 
492 aa  137  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.873199  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1841  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.19 
 
 
832 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3573  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
402 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.855521  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2560  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
540 aa  137  3.0000000000000003e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.948735  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4002  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
765 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248889  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0913  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  27.62 
 
 
544 aa  137  4e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.54 
 
 
365 aa  137  4e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1992  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 
372 aa  137  4e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1138  histidine kinase  37.27 
 
 
234 aa  137  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0668  histidine kinase  32.93 
 
 
542 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.512830000000001e-32 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1361  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.55 
 
 
912 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0109  histidine kinase  33.33 
 
 
461 aa  136  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000786251 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0076  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
427 aa  136  7.000000000000001e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000670582  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3849  ATP-binding region ATPase domain protein  33.86 
 
 
483 aa  135  9e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2419  sensor histidine kinase  33.05 
 
 
595 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2380  sensor histidine kinase  33.05 
 
 
595 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.343005  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0267  histidine kinase  35.12 
 
 
517 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0229879 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2742  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 
544 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.617202  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1796  histidine kinase  34.51 
 
 
584 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2653  sensor histidine kinase  33.05 
 
 
595 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000377576 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
368 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.834527  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3376  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 
691 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1897  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.11 
 
 
488 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0969879 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3582  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
516 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0103358 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2426  sporulation kinase B  28.07 
 
 
422 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000668804  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1033  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
581 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.487661 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2665  sensor histidine kinase  33.05 
 
 
590 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650271 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2659  hypothetical protein  33.05 
 
 
595 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
378 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2216  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 
475 aa  134  3e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.263831  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  35 
 
 
621 aa  134  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2662  hypothetical protein  32.62 
 
 
595 aa  134  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1094  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
364 aa  134  3e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3279  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
608 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00154728  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  35.15 
 
 
614 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0233  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.82 
 
 
553 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.446176  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0960  histidine kinase  34.55 
 
 
531 aa  133  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.57 
 
 
598 aa  133  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4237  sensor protein ZraS  33.76 
 
 
458 aa  133  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.355168  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2094  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
872 aa  133  6e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2456  sensor histidine kinase  32.62 
 
 
509 aa  133  6.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.237642  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2916  sensor histidine kinase  35.34 
 
 
487 aa  132  7.999999999999999e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.691073  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4151  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.71 
 
 
1519 aa  132  7.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0865128  normal  0.147126 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2703  hypothetical protein  32.62 
 
 
595 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.894836  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2636  sensor histidine kinase  32.62 
 
 
499 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4495  sensor protein ZraS  33.76 
 
 
458 aa  132  7.999999999999999e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000791685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2661  sporulation kinase B  27.63 
 
 
422 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000107303 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0642  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
492 aa  132  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.400591  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0582  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.68 
 
 
587 aa  132  9e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2463  sporulation kinase B  27.63 
 
 
422 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.956719  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 
542 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4547  sensor protein ZraS  33.33 
 
 
458 aa  132  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00542205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>