More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2549 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2549  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 263 aa  541  1e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2276  alpha/beta hydrolase fold  58.91 
 
 		 264 aa  319  3e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.253162  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2122  alpha/beta hydrolase fold  58.24 
 
 		 263 aa  316  3e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1627  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  65.27 
 
 		 262 aa  314  9.999999999999999e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2174  alpha/beta hydrolase fold  51.35 
 
 		 261 aa  265  8e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0285  3-oxoadipate enol-lactonase, putative  51.91 
 
 		 259 aa  263  3e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0385204 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1941  alpha/beta hydrolase fold  50.77 
 
 		 261 aa  246  3e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  40.08 
 
 		 265 aa  168  6e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  38.84 
 
 		 263 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  38.43 
 
 		 263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  38.08 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  39.41 
 
 		 265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  38.02 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  32.44 
 
 		 264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3602  alpha/beta hydrolase fold  31.89 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0636  alpha/beta hydrolase fold protein  36.78 
 
 		 237 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.809032  normal  0.841425 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  33.2 
 
 		 265 aa  145  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0572  alpha/beta hydrolase fold  32.79 
 
 		 266 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1693  hydrolase, alpha/beta fold family  36.63 
 
 		 263 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  0.210784 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  36.14 
 
 		 263 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  30.42 
 
 		 283 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  33.47 
 
 		 280 aa  128  9.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29320  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  35 
 
 		 248 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0263  Alpha/beta hydrolase fold  30.99 
 
 		 266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.191481  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1149  alpha/beta hydrolase fold protein  33.73 
 
 		 265 aa  123  3e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  27.97 
 
 		 277 aa  123  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  32.22 
 
 		 263 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1989  alpha/beta hydrolase fold  36.63 
 
 		 235 aa  115  5e-25  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.512291  normal  0.434462 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3365  Alpha/beta hydrolase  29.55 
 
 		 264 aa  110  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  26.58 
 
 		 266 aa  108  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0914  alpha/beta hydrolase fold protein  32.91 
 
 		 255 aa  108  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5083  3-oxoadipate enol-lactonase  32.27 
 
 		 260 aa  102  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6107  alpha/beta hydrolase fold protein  33.73 
 
 		 231 aa  102  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.519556  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  31.62 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  29.39 
 
 		 279 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  32.95 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0670  alpha/beta hydrolase fold  27.76 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  31.36 
 
 		 261 aa  94.4  2e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1087  alpha/beta hydrolase fold protein  29.96 
 
 		 245 aa  90.5  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0523898  normal  0.954451 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3470  alpha/beta fold family hydrolase  32.26 
 
 		 328 aa  90.1  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  30.04 
 
 		 263 aa  90.5  3e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1764  alpha/beta hydrolase fold  29.92 
 
 		 256 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.112264  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2893  alpha/beta fold family hydrolase  32.26 
 
 		 273 aa  89.7  4e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.511984  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3974  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  32.26 
 
 		 273 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0111  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  32.26 
 
 		 372 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3893  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  32.26 
 
 		 328 aa  89.7  4e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.28749  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1764  alpha/beta fold family hydrolase  26.83 
 
 		 429 aa  89.7  4e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10250  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  32.39 
 
 		 289 aa  89.7  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  30.74 
 
 		 260 aa  89  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2105  alpha/beta hydrolase fold  28.22 
 
 		 265 aa  87.8  1e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2427  alpha/beta hydrolase fold  28.8 
 
 		 278 aa  87.4  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  31.05 
 
 		 271 aa  87.4  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2089  alpha/beta hydrolase  32.05 
 
 		 236 aa  87  3e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.500476  normal  0.419915 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3528  hypothetical protein  30.51 
 
 		 269 aa  86.3  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000191254  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1302  alpha/beta hydrolase fold  30.98 
 
 		 285 aa  86.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  26.72 
 
 		 284 aa  86.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0327  alpha/beta hydrolase  33.5 
 
 		 237 aa  86.3  5e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.145375  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2846  alpha/beta hydrolase  27.39 
 
 		 263 aa  85.9  6e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.455911  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3250  alpha/beta hydrolase fold protein  25.81 
 
 		 247 aa  85.9  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.176315 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1144  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 353 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.612378  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1168  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 353 aa  85.9  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2137  alpha/beta hydrolase fold  27.61 
 
 		 353 aa  85.9  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.887771  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 		 263 aa  85.5  8e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5984  alpha/beta hydrolase fold  26.29 
 
 		 300 aa  85.5  9e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0152397 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6785  alpha/beta hydrolase fold protein  31.48 
 
 		 235 aa  85.1  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5034  alpha/beta hydrolase fold  29.39 
 
 		 245 aa  84.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.246074  normal  0.671643 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0689  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 		 387 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0961  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0172489 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2267  alpha/beta hydrolase fold  27.48 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00239733 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1528  alpha/beta hydrolase fold  30.08 
 
 		 278 aa  84.3  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.241032 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0379  alpha/beta hydrolase fold protein  26.97 
 
 		 285 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.36178  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1544  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 		 406 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4280  Alpha/beta hydrolase  27.34 
 
 		 353 aa  83.6  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1471  alpha/beta hydrolase fold  29.47 
 
 		 234 aa  83.2  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  29.69 
 
 		 251 aa  83.2  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7407  Alpha/beta hydrolase  30 
 
 		 274 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.945303 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02551  hypothetical protein  32.16 
 
 		 239 aa  82.4  0.000000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4206  3-oxoadipate enol-lactonase  28.51 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5267  putative alpha/beta hydrolase; putative prolyl aminopeptidase  27.12 
 
 		 344 aa  82.4  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.385199 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4141  Alpha/beta hydrolase protein  30.99 
 
 		 233 aa  82  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2933  alpha/beta family hydrolase  27.69 
 
 		 377 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.761124 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1050  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 		 352 aa  82  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3812  alpha/beta hydrolase fold  25.51 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.281797  normal  0.255747 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  27.55 
 
 		 259 aa  81.3  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  28.28 
 
 		 275 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  26.34 
 
 		 276 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  26.97 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1047  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 		 352 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  26.92 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1746  alpha/beta fold family hydrolase  26.07 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.294927  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4363  alpha/beta hydrolase fold protein  30.51 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.594028  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  25.4 
 
 		 264 aa  80.5  0.00000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0446  3-oxoadipate enol-lactonase  31.05 
 
 		 264 aa  80.1  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2856  alpha/beta fold family hydrolase  26.07 
 
 		 441 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0981  alpha/beta hydrolase fold protein  26.45 
 
 		 254 aa  80.5  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2800  alpha/beta fold family hydrolase  26.07 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  25.6 
 
 		 254 aa  79.7  0.00000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2740  alpha/beta fold family hydrolase  26.07 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0581  alpha/beta fold family hydrolase  26.07 
 
 		 342 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.346537  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>