More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2154 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_2154  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 129 aa  267  5e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0623  ArsR family transcriptional regulator  79.84 
 
 		 129 aa  221  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0763  transcriptional regulator, ArsR family  79.07 
 
 		 132 aa  220  4.9999999999999996e-57  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0757  transcriptional regulator, ArsR family  75.97 
 
 		 129 aa  211  3.9999999999999995e-54  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.164852 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1704  transcriptional regulator, ArsR family  73.6 
 
 		 125 aa  201  3e-51  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.809199  hitchhiker  0.000421597 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0866  ArsR family transcriptional regulator  73.87 
 
 		 111 aa  183  8e-46  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.799603  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1891  ArsR family transcriptional regulator  60.16 
 
 		 129 aa  159  1e-38  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1608  ArsR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 113 aa  92.8  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.720333  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3259  ArsR family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 138 aa  90.5  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.364539  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3636  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 120 aa  84  7e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  46.74 
 
 		 102 aa  83.6  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2632  ArsR family transcriptional regulator  42.5 
 
 		 127 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.309058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3135  ArsR family transcriptional regulator  39.78 
 
 		 106 aa  80.5  0.000000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.254389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1459  ArsR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.228644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  39.8 
 
 		 112 aa  79.3  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2439  ArsR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 108 aa  79.3  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.985775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1468  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.19105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3748  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 118 aa  77.4  0.00000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2313  ArsR family transcriptional regulator  43.27 
 
 		 114 aa  77  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2040  transcriptional regulator, ArsR family  43.21 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2529  ArsR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 106 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769574 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 109 aa  72.4  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 		 106 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 98 aa  70.1  0.000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4852  transcriptional regulator, ArsR family  35.79 
 
 		 114 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  39.74 
 
 		 109 aa  69.7  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2424  ArsR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 118 aa  70.1  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0938  ArsR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 106 aa  68.6  0.00000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2983  transcriptional regulator, ArsR family  27.93 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000400163  hitchhiker  0.00363811 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1582  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 		 120 aa  67.8  0.00000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00023069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2984  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1940  transcriptional regulator, ArsR family  37.11 
 
 		 111 aa  67  0.00000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000629196  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  40.54 
 
 		 109 aa  65.9  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0561  regulatory protein, ArsR  35.96 
 
 		 108 aa  65.9  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1189  transcriptional regulator, ArsR family  40.79 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0553  transcriptional regulator, ArsR family  32.63 
 
 		 122 aa  64.3  0.0000000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1782  ArsR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  43.42 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0309  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 126 aa  63.9  0.0000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  43.42 
 
 		 107 aa  63.9  0.0000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1794  ArsR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 124 aa  63.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3703  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3967  ArsR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 116 aa  63.5  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.45892  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3756  transcriptional regulator, ArsR family  38.55 
 
 		 135 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.965498 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  37.21 
 
 		 113 aa  63.5  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3283  ArsR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 226 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4684  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 120 aa  62  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.504517  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1925  SAM-dependent methyltransferase  41.27 
 
 		 306 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000216904  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2101  ArsR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 317 aa  61.6  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0466  regulatory protein, ArsR  33.66 
 
 		 108 aa  61.6  0.000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0439  regulatory protein, ArsR  36.05 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2699  transcriptional regulator, ArsR family  39.73 
 
 		 142 aa  60.5  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2941  ArsR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 222 aa  60.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3560  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.84 
 
 		 109 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0818749  normal  0.166027 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1216  transcriptional regulator, ArsR family  39.51 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3006  methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 305 aa  60.1  0.000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0476  transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0357  transcriptional regulator, ArsR family  34.48 
 
 		 310 aa  59.7  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366158  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4471  ArsR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3211  hypothetical protein  43.66 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147206 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2026  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.318848  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2639  transcriptional regulator, ArsR family  32.95 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.981864  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3282  transcriptional regulator, TrmB  35.06 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1691  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3436  hypothetical protein  43.66 
 
 		 112 aa  58.9  0.00000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.547561  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3497  transcriptional regulator, ArsR family  32.22 
 
 		 121 aa  58.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.545017 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5371  transcriptional regulator, TrmB  31.96 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  38.55 
 
 		 117 aa  59.3  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1557  transcriptional regulator, ArsR family  42.67 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0128912  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10586  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 437 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.4131599999999997e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2939  transcriptional regulator, ArsR family  35.71 
 
 		 307 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2077  transcriptional regulator, ArsR family  39.71 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29211  regulatory proteins, ArsR family protein  41.33 
 
 		 101 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12384  ArsR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 135 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1451  ArsR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 341 aa  58.2  0.00000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.166117  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2195  ArsR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000138755  normal  0.370986 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0454  ArsR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 92 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1102  ArsR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.780057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1722  methyltransferase type 11  31.63 
 
 		 341 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2180  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 218 aa  58.2  0.00000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3440  regulatory protein, ArsR  35.44 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.241226  normal  0.160659 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0872  regulatory protein ArsR  39.47 
 
 		 95 aa  57.4  0.00000006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.633689  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1108  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4381  ArsR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 110 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.606402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1407  ArsR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 341 aa  57  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.440659  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4097  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 235 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.896356  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4173  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 235 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.801909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4328  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 235 aa  57  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0812017  normal  0.0670515 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2830  methyltransferase type 11  39.24 
 
 		 349 aa  57  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.157878 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1547  transcriptional regulator, ArsR family  35.16 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1345  transcriptional regulator, ArsR family  34.29 
 
 		 305 aa  57  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.773476  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2641  transcriptional regulator, ArsR family  31.11 
 
 		 113 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.257894  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2267  transcriptional regulator, ArsR family  31.11 
 
 		 118 aa  56.6  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000484642 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 317 aa  56.6  0.0000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1784  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1155  ArsR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05104  arsenate reductase  39.71 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>