More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3494 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  77.94 
 
 		 668 aa  1078    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 664 aa  1370    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  81.35 
 
 		 665 aa  1135    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  83.16 
 
 		 671 aa  1154    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  59.49 
 
 		 661 aa  842    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  52.56 
 
 		 659 aa  689    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2917  short chain dehydrogenase  47.31 
 
 		 665 aa  605  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0126943  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  41.44 
 
 		 671 aa  455  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  40.9 
 
 		 637 aa  435  1e-120  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1527  short chain dehydrogenase  41.67 
 
 		 653 aa  431  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  39.51 
 
 		 642 aa  420  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  40.31 
 
 		 701 aa  419  1e-116  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  39.06 
 
 		 650 aa  410  1e-113  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  50.38 
 
 		 292 aa  271  2e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0182353  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.44 
 
 		 295 aa  249  1e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.366872  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1299  fatty acyl-CoA reductase protein  46.42 
 
 		 295 aa  242  1e-62  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11576  fatty acyl-CoA reductase  44.72 
 
 		 341 aa  236  8e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.53 
 
 		 305 aa  236  9e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0726  short chain dehydrogenase  46.33 
 
 		 291 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.352329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0732  short chain dehydrogenase  46.33 
 
 		 291 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.403449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0746  short chain dehydrogenase  46.33 
 
 		 291 aa  222  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.095749 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0944  short chain dehydrogenase  44.57 
 
 		 294 aa  214  2.9999999999999995e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0026  short chain dehydrogenase  43.82 
 
 		 319 aa  213  1e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122051  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10558  short chain dehydrogenase  43.58 
 
 		 294 aa  197  7e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0196339 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0860  short chain dehydrogenase  45.19 
 
 		 291 aa  188  2e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0854  short chain dehydrogenase  44.35 
 
 		 291 aa  186  9e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0871  short chain dehydrogenase  44.35 
 
 		 291 aa  186  9e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 		 273 aa  184  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.690765 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3466  short chain dehydrogenase  43.24 
 
 		 294 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.241299 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.61 
 
 		 275 aa  176  9e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.02 
 
 		 280 aa  172  2e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4094  Male sterility domain protein  31.58 
 
 		 359 aa  171  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.796216  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1667  hypothetical protein  33.06 
 
 		 358 aa  166  9e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0262372  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2676  hypothetical protein  31.84 
 
 		 373 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0511814 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4728  hypothetical protein  30.19 
 
 		 354 aa  157  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1327  Male sterility domain protein  30.16 
 
 		 356 aa  151  3e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.38219  normal  0.51823 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2685  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.5 
 
 		 383 aa  149  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2871  Male sterility domain protein  32.22 
 
 		 381 aa  148  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2778  male sterility domain protein  31.94 
 
 		 383 aa  147  9e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0456239  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2731  Male sterility domain protein  30.96 
 
 		 392 aa  141  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.885706  hitchhiker  0.00797999 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6897  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.65 
 
 		 290 aa  134  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05318  hypothetical protein similar to nonribosomal peptide synthetase 10 (Broad)  25.55 
 
 		 1270 aa  125  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.556036  normal  0.849429 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.54 
 
 		 347 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1650  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.84 
 
 		 254 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.206138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  32.87 
 
 		 242 aa  114  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6716  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.86 
 
 		 247 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  32.87 
 
 		 242 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0391  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.65 
 
 		 279 aa  112  3e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.319463  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0348  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  35.24 
 
 		 244 aa  110  6e-23  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.708158  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.51 
 
 		 244 aa  110  8.000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1430  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 		 286 aa  109  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5308  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.49 
 
 		 239 aa  109  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.17 
 
 		 255 aa  109  1e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.43 
 
 		 317 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00194851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 		 339 aa  108  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4927  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.94 
 
 		 239 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5015  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.94 
 
 		 239 aa  108  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.67 
 
 		 264 aa  108  4e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2512  3-oxoacyl-(acyl-carrier protein) reductase  31.94 
 
 		 236 aa  107  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0588198  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 		 342 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4042  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.39 
 
 		 264 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4357  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.39 
 
 		 264 aa  107  7e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.1 
 
 		 344 aa  107  7e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.753226  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4268  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  34.39 
 
 		 264 aa  107  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.39 
 
 		 252 aa  107  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0726  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.34 
 
 		 366 aa  107  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.642345  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4205  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  33.86 
 
 		 264 aa  106  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.87 
 
 		 251 aa  106  1e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3881  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase  34.39 
 
 		 264 aa  106  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2522  Male sterility domain protein  30.16 
 
 		 410 aa  106  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.34008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.18 
 
 		 274 aa  106  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.448097 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4158  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  34.39 
 
 		 264 aa  107  1e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.94 
 
 		 257 aa  107  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.76225  normal  0.242071 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3908  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.33 
 
 		 272 aa  106  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.106718  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.28 
 
 		 230 aa  105  3e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2595  thioester reductase  28.73 
 
 		 506 aa  105  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.410224  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3889  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  34.39 
 
 		 264 aa  105  4e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.674087  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0364  Male sterility domain protein  30.27 
 
 		 493 aa  105  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.88 
 
 		 249 aa  104  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.399133  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1337  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  30.32 
 
 		 238 aa  104  6e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.541378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0031  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.22 
 
 		 340 aa  103  7e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2367  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.24 
 
 		 272 aa  104  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.264463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.36 
 
 		 250 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  36.36 
 
 		 241 aa  103  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 		 260 aa  103  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.88 
 
 		 249 aa  103  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0992  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  33.86 
 
 		 264 aa  102  2e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0034  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 		 340 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0147442  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1519  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.35 
 
 		 259 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3967  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.8 
 
 		 264 aa  102  2e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0321162  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0046  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.09 
 
 		 340 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.21 
 
 		 262 aa  102  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3571  short chain dehydrogenase  31.42 
 
 		 256 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0445953  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.57 
 
 		 255 aa  102  3e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.05 
 
 		 257 aa  101  4e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1137  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.08 
 
 		 255 aa  101  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.420878 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3912  thioester reductase domain-containing protein  28.25 
 
 		 505 aa  101  4e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.501975  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4244  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  33.33 
 
 		 264 aa  101  5e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1266  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.07 
 
 		 278 aa  101  5e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.343225  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.36 
 
 		 256 aa  100  6e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>