More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3578 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  100 
 
 		 213 aa  421  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  56.88 
 
 		 226 aa  182  3e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  53.45 
 
 		 204 aa  178  7e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  54.17 
 
 		 228 aa  176  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  55.56 
 
 		 230 aa  175  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.29 
 
 		 204 aa  172  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.55 
 
 		 207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  54.9 
 
 		 230 aa  172  2.9999999999999996e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  51.11 
 
 		 208 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  54.04 
 
 		 217 aa  172  5e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  55.33 
 
 		 222 aa  170  1e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  54.72 
 
 		 210 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  50.58 
 
 		 202 aa  167  8e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  50 
 
 		 202 aa  167  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  52.87 
 
 		 210 aa  164  6.9999999999999995e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  53.74 
 
 		 202 aa  164  6.9999999999999995e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  50.98 
 
 		 222 aa  158  6e-38  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  48.47 
 
 		 207 aa  157  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  51.3 
 
 		 179 aa  157  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  49.37 
 
 		 206 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  48.1 
 
 		 187 aa  156  3e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  48.73 
 
 		 206 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  47.37 
 
 		 210 aa  155  6e-37  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  48.67 
 
 		 206 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  49.66 
 
 		 197 aa  151  8.999999999999999e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  47.27 
 
 		 205 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  48.37 
 
 		 189 aa  149  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  47.59 
 
 		 203 aa  149  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  46.33 
 
 		 186 aa  148  6e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  47.71 
 
 		 186 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  46.93 
 
 		 181 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  45.86 
 
 		 197 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2874  GrpE protein  46 
 
 		 187 aa  145  5e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  40.78 
 
 		 201 aa  142  4e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0208  GrpE protein  44.1 
 
 		 188 aa  142  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  48.03 
 
 		 181 aa  135  4e-31  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  46.63 
 
 		 205 aa  134  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14947  mitochondrial GrpE-like protein  40.59 
 
 		 240 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0088904  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  43.68 
 
 		 181 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64096  predicted protein  37.11 
 
 		 188 aa  124  8.000000000000001e-28  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.20813  normal  0.0799005 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  45.32 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15032  predicted protein  41.18 
 
 		 157 aa  120  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189878  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  43.31 
 
 		 186 aa  119  3e-26  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1974  GrpE protein  40.48 
 
 		 210 aa  117  9.999999999999999e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.26677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0111  GrpE protein  32.99 
 
 		 199 aa  115  3.9999999999999997e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  43.41 
 
 		 194 aa  115  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1485  heat shock protein GrpE  39.2 
 
 		 182 aa  112  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  42.42 
 
 		 185 aa  111  8.000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1647  GrpE protein  40.57 
 
 		 202 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.165316  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2497  putative heat shock protein  42.37 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.437332 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  38.46 
 
 		 193 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  42.45 
 
 		 198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  39.22 
 
 		 181 aa  108  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0730  heat shock protein GrpE  38.42 
 
 		 195 aa  108  6e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0176899  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0849  heat shock protein GrpE  41.33 
 
 		 175 aa  108  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0936  heat shock protein GrpE  39.63 
 
 		 169 aa  108  8.000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0941203  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  33.71 
 
 		 191 aa  108  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  39.87 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  43.42 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0965  heat shock protein GrpE  37.37 
 
 		 195 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000249934  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  40.91 
 
 		 181 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  35.12 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0168  co-chaperone GrpE  32.31 
 
 		 203 aa  106  2e-22  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  37.85 
 
 		 184 aa  106  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  41.01 
 
 		 201 aa  106  3e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  38.04 
 
 		 213 aa  105  4e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1259  heat shock protein GrpE  41.33 
 
 		 176 aa  105  6e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.481119  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  42 
 
 		 211 aa  105  7e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  39.29 
 
 		 212 aa  104  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  39.22 
 
 		 189 aa  104  9e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  36.31 
 
 		 208 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  37.57 
 
 		 180 aa  104  1e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2575  GrpE protein  41.56 
 
 		 181 aa  104  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160939 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  41.83 
 
 		 178 aa  104  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0774  heat shock protein GrpE  41.33 
 
 		 176 aa  104  1e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.142311  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  38.26 
 
 		 206 aa  103  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  41.83 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  38.16 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  39.73 
 
 		 204 aa  103  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  38.82 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  35.12 
 
 		 245 aa  102  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  35.89 
 
 		 209 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  37.04 
 
 		 205 aa  102  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0924  GrpE protein  38.07 
 
 		 184 aa  102  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.929146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1040  heat shock protein GrpE  41.36 
 
 		 184 aa  102  5e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3533  heat shock protein GrpE  36.17 
 
 		 189 aa  102  6e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00974284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  37.27 
 
 		 209 aa  101  8e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3643  GrpE protein  39.87 
 
 		 221 aa  101  8e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  36.53 
 
 		 198 aa  101  9e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  37.01 
 
 		 186 aa  100  1e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  35.82 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  36.91 
 
 		 200 aa  100  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0069  GrpE protein  38.89 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.311586  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1381  heat shock protein GrpE  37.58 
 
 		 208 aa  101  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  0.00117514  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2014  GrpE protein  37.82 
 
 		 361 aa  100  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3296  heat shock protein GrpE  37.78 
 
 		 195 aa  100  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0127245  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1062  GrpE protein  41.04 
 
 		 169 aa  101  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0506342  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1973  GrpE protein  36.13 
 
 		 223 aa  100  2e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.268651  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  40.13 
 
 		 186 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  36.24 
 
 		 206 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>