More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2453 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2453  transcriptional regulator  100 
 
 		 339 aa  694    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2375  AraC family transcriptional regulator  66.96 
 
 		 351 aa  457  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.229949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0640  AraC family transcriptional regulator  52.29 
 
 		 322 aa  311  1e-83  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5819  transcriptional regulator  51.69 
 
 		 338 aa  306  2.0000000000000002e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.321081  normal  0.280114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2704  AraC family transcriptional regulator  50.62 
 
 		 322 aa  298  1e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.561895  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2686  AraC family transcriptional regulator  50.31 
 
 		 324 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5985  transcriptional regulator  50.15 
 
 		 334 aa  297  2e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0571562 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2046  AraC family transcriptional regulator  50.31 
 
 		 324 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2657  AraC family transcriptional regulator  50.31 
 
 		 324 aa  296  2e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0449258  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1153  ThiJ/PfpI domain-containing protein  50.47 
 
 		 338 aa  295  9e-79  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.074608 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2578  AraC family transcriptional regulator  50.93 
 
 		 322 aa  288  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1312  transcriptional regulator, AraC family  49.84 
 
 		 338 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00374343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0573  transcriptional regulator  46.13 
 
 		 342 aa  279  5e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0972711  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0513  AraC family transcriptional regulator  50.16 
 
 		 387 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1848  transcriptional regulator, AraC family  49.53 
 
 		 338 aa  273  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.172735  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0955  DarR  52.22 
 
 		 369 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1414  AraC family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 346 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2526  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  52.22 
 
 		 369 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0374888  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1610  AraC family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 346 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0268  AraC family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 346 aa  270  2e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0793  AraC family transcriptional regulator  47.38 
 
 		 363 aa  270  2e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.18814  normal  0.0945991 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2667  DarR  52.22 
 
 		 374 aa  270  2e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0231  AraC family transcriptional regulator  52.22 
 
 		 343 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2949  transcriptional regulator, AraC family  50.84 
 
 		 437 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1836  transcriptional regulator  45.65 
 
 		 327 aa  266  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2457  ThiJ/PfpI  62.56 
 
 		 236 aa  266  5e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1581  transcriptional regulator  45.79 
 
 		 335 aa  265  8.999999999999999e-70  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1088  transcriptional regulator, AraC family  46.11 
 
 		 332 aa  264  2e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1036  transcriptional regulator  44.66 
 
 		 375 aa  264  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2605  transcriptional regulator  44.48 
 
 		 319 aa  262  6.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.548413  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1645  transcriptional regulator AraC family  47.08 
 
 		 327 aa  256  4e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3465  transcriptional regulator  43.69 
 
 		 341 aa  254  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40600  putative transcriptional regulator  44.44 
 
 		 334 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1023  AraC family transcription regulator  43.3 
 
 		 345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.243872  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1652  AraC family transcriptional regulator  47.35 
 
 		 327 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0685  AraC family transcriptional regulator  43.49 
 
 		 344 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.787747  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0861  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0865  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  42.86 
 
 		 344 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5976  transcriptional regulator  42.41 
 
 		 325 aa  253  3e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.557743  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0323  AraC family transcriptional regulator  42.55 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3529  AraC family transcriptional regulator  44.48 
 
 		 336 aa  251  1e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2455  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  42.55 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0069  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  42.55 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0621  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  42.55 
 
 		 344 aa  251  1e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.627949  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4716  transcriptional regulator, AraC family  43.93 
 
 		 341 aa  250  2e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.777825 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4319  AraC family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 324 aa  250  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3442  putative transcriptional regulator  43.54 
 
 		 334 aa  249  4e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0113  transcriptional regulator, AraC family  43.31 
 
 		 354 aa  249  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2518  transcriptional regulator, AraC family  46.13 
 
 		 336 aa  249  4e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.179818 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3129  transcriptional regulator, AraC family  40.98 
 
 		 328 aa  247  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.554919  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2990  transcriptional regulator  42.95 
 
 		 320 aa  246  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1704  transcriptional regulator, AraC family  46.13 
 
 		 362 aa  246  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3465  transcriptional regulator, AraC family  45.37 
 
 		 327 aa  246  4e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2196  transcriptional regulator  41.64 
 
 		 334 aa  246  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0874  AraC family transcriptional regulator  43.65 
 
 		 334 aa  246  4.9999999999999997e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2066  AraC family transcriptional regulator  43.91 
 
 		 338 aa  245  8e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.623235  normal  0.45327 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2164  transcriptional regulator  44.24 
 
 		 340 aa  245  9e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.124166  normal  0.0201995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0741  AraC family transcriptional regulator  42.68 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.885746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0747  AraC family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.46918  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0761  AraC family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 321 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.321335  normal  0.450606 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0160  transcriptional regulator, AraC family  47.37 
 
 		 323 aa  242  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0641212  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5796  transcriptional regulator, AraC family  43.12 
 
 		 317 aa  242  7.999999999999999e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5675  transcriptional regulator, AraC family  47.39 
 
 		 320 aa  241  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2808  transcriptional regulator, AraC family  41.59 
 
 		 330 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.627946  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1856  transcriptional regulator, AraC family  44.41 
 
 		 320 aa  238  8e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922042  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6612  transcriptional regulator  41.43 
 
 		 341 aa  238  1e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3774  transcriptional regulator, AraC family  40.92 
 
 		 349 aa  238  1e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0964953  normal  0.0117202 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5514  transcriptional regulator, AraC family  42.46 
 
 		 334 aa  236  3e-61  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.75242  normal  0.0584888 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5267  AraC family transcriptional regulator  42.06 
 
 		 320 aa  235  7e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.589428 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2581  AraC family transcriptional regulator  44.21 
 
 		 325 aa  234  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0339755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6685  AraC family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 321 aa  235  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.745893  normal  0.261527 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5842  AraC family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6209  AraC family transcriptional regulator  40.5 
 
 		 321 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00677646 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1295  AraC family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0776  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  43.21 
 
 		 321 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5148  AraC family transcriptional regulator  45.51 
 
 		 328 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0642429  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1772  AraC family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 321 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2061  AraC family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 321 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.284962  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5748  AraC family transcriptional regulator  40.56 
 
 		 321 aa  233  3e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.389978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0687  DJ-1/PfpI family protein/transcriptional regulator, AraC family  43.21 
 
 		 321 aa  233  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1055  AraC family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 321 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0762  AraC family transcriptional regulator  43.21 
 
 		 321 aa  233  3e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5992  AraC family transcriptional regulator  40.25 
 
 		 348 aa  232  6e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.728993  normal  0.755382 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6950  transcriptional regulator  43.17 
 
 		 310 aa  230  3e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.591911  normal  0.520078 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6986  transcriptional regulator, AraC family  42.95 
 
 		 356 aa  230  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.667581  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5330  AraC family transcriptional regulator  39.88 
 
 		 325 aa  229  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0697804 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0972  AraC family transcriptional regulator  43.17 
 
 		 336 aa  229  7e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3583  transcriptional regulator, AraC family  43.13 
 
 		 314 aa  228  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.612075  normal  0.105088 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4002  transcriptional regulator, AraC family  42.27 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.474244  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3889  transcriptional regulator, AraC family  42.27 
 
 		 311 aa  227  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.363483 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1481  transcriptional regulator, AraC family  41.18 
 
 		 321 aa  226  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2502  transcriptional regulator, AraC family  40.67 
 
 		 327 aa  226  4e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2287  transcriptional regulator, AraC family  42.06 
 
 		 328 aa  226  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322568  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2695  transcriptional regulator, AraC family  40.68 
 
 		 344 aa  225  7e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.448661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1034  transcriptional regulator, AraC family  42.9 
 
 		 316 aa  225  8e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0108866  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1070  transcriptional regulator  40.85 
 
 		 331 aa  223  3e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5246  transcriptional regulator, AraC family  41.1 
 
 		 331 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.893549 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0731  transcriptional regulator  41.32 
 
 		 349 aa  223  4e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.523916 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0493  AraC family transcriptional regulator  42.09 
 
 		 315 aa  222  8e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3021  transcriptional regulator, AraC family  37.16 
 
 		 372 aa  221  9.999999999999999e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>