More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2720 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2720  Fmu (Sun) domain-containing protein  100 
 
 		 535 aa  1030    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  0.796536 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2765  Fmu (Sun) domain-containing protein  62.77 
 
 		 410 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2926  Fmu (Sun) domain-containing protein  61.59 
 
 		 422 aa  411  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.351382  normal  0.0315958 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3033  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  58.57 
 
 		 443 aa  381  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.455858 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0089  Fmu (Sun)  54.52 
 
 		 424 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4040  Fmu (Sun)  54.83 
 
 		 410 aa  361  2e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6147  rRNA methyltransferase RsmB-like  58.49 
 
 		 421 aa  349  9e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0038  sun protein  47.34 
 
 		 471 aa  278  1e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.27971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0156  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  44.64 
 
 		 450 aa  268  2e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4779  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.87 
 
 		 426 aa  263  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.849075  normal  0.940845 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0627  Fmu (Sun) domain protein  50.92 
 
 		 438 aa  263  6.999999999999999e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.114528 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0717  Fmu (Sun)  44.33 
 
 		 450 aa  261  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.722352 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0197  Fmu (Sun)  44.14 
 
 		 450 aa  258  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0130363  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1089  Fmu (Sun) domain-containing protein  41.26 
 
 		 453 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1027  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.5 
 
 		 459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.537768  normal  0.0363239 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2963  Fmu (Sun) domain-containing protein  53.12 
 
 		 447 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.270675  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0086  RNA methyltransferase  43.58 
 
 		 450 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1747  sun protein  39.7 
 
 		 465 aa  253  7e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1814  sun protein  39.7 
 
 		 465 aa  252  1e-65  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.802421  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2654  Fmu (Sun) domain-containing protein  52.94 
 
 		 415 aa  251  3e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.105855  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3660  tRNA and rRNA cytosine-C5-methylase  47.39 
 
 		 438 aa  250  5e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.469225  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2924  Fmu (Sun) domain-containing protein  45.12 
 
 		 433 aa  249  6e-65  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0025  Fmu (Sun)  43.67 
 
 		 450 aa  245  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3418  Fmu (Sun)  41.06 
 
 		 460 aa  244  3.9999999999999997e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0031  Fmu (Sun) domain protein  42.86 
 
 		 450 aa  243  6e-63  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1940  Fmu (Sun) domain-containing protein  44.42 
 
 		 422 aa  243  6e-63  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0551  Fmu (Sun) domain-containing protein  49.45 
 
 		 425 aa  243  9e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.481855  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0486  Fmu (Sun) domain protein  49.18 
 
 		 454 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.75278  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4295  Sun protein  42.57 
 
 		 493 aa  237  4e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.1846  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4242  Fmu (Sun) domain protein  41.09 
 
 		 460 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0325  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  40.85 
 
 		 450 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.235081  normal  0.145888 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3191  Fmu (Sun) domain-containing protein  40.6 
 
 		 470 aa  231  3e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.97576 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1424  sun protein  43.46 
 
 		 448 aa  230  5e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.204434 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2071  sun protein  40.67 
 
 		 463 aa  229  7e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0072  putative ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  36.8 
 
 		 456 aa  228  3e-58  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000155418  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3917  Fmu (Sun) domain protein  39.5 
 
 		 462 aa  226  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0687458  normal  0.615707 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0522  Fmu (Sun) domain protein  49.04 
 
 		 438 aa  224  4e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0621766  normal  0.207218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5220  sun protein  50 
 
 		 448 aa  219  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.02946  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1326  sun protein  40.62 
 
 		 440 aa  218  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000516212 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1047  Fmu (Sun)  42.96 
 
 		 437 aa  213  9e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.334338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2083  sun protein  38.11 
 
 		 437 aa  195  1e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3096  Fmu (Sun)  48.09 
 
 		 419 aa  192  9e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2271  sun protein  37.5 
 
 		 451 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00558383 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0682  sun protein  33.26 
 
 		 443 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0449767  normal  0.911889 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00393  cytosine-C5-methylase  31.71 
 
 		 427 aa  183  5.0000000000000004e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3668  sun protein  35.78 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2321  sun protein  38.24 
 
 		 429 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0104634  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1826  sun protein  33.85 
 
 		 451 aa  181  4e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0354  16S rRNA methyltransferase B  33.71 
 
 		 431 aa  181  4e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462133  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2845  sun protein  37.93 
 
 		 431 aa  180  4.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.677129  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4513  16S rRNA methyltransferase B  34.22 
 
 		 429 aa  179  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0528453  hitchhiker  0.0000468931 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002055  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  31.48 
 
 		 427 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.881444  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3677  16S rRNA methyltransferase B  33.71 
 
 		 429 aa  178  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0033  sun protein  34 
 
 		 426 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0617271 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3604  16S rRNA methyltransferase B  33.48 
 
 		 429 aa  178  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.946908  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0066  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase:Nop2p  36.93 
 
 		 446 aa  177  4e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3605  16S rRNA methyltransferase B  33.48 
 
 		 429 aa  177  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.44092 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3712  16S rRNA methyltransferase B  33.26 
 
 		 429 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.199091 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3775  16S rRNA methyltransferase B  33.04 
 
 		 429 aa  176  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0019  Sun protein  32.62 
 
 		 445 aa  176  7e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0041  sun protein  33.42 
 
 		 427 aa  176  7e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.15586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00180  putative tRNA and rRNA cytosine-C5-methylases  37.8 
 
 		 434 aa  176  9e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.54038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0080  sun protein  33.5 
 
 		 436 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3970  16S rRNA methyltransferase B  32.44 
 
 		 429 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.121594  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0613  16S rRNA methyltransferase B  34.16 
 
 		 435 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0175887  normal  0.0518778 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0036  sun protein  33.25 
 
 		 425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.569301 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0018  ribosomal RNA small subunit methyltransferase B  37.32 
 
 		 434 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.577785  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0021  sun protein  36.36 
 
 		 437 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3884  16S rRNA methyltransferase B  34.16 
 
 		 429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.002095  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0314  16S rRNA methyltransferase B  34.16 
 
 		 429 aa  174  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0029  sun protein  33.25 
 
 		 426 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0437  16S rRNA methyltransferase B  32.96 
 
 		 431 aa  174  3.9999999999999995e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3791  16S rRNA methyltransferase B  33.11 
 
 		 429 aa  174  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0053  sun protein  40.68 
 
 		 437 aa  174  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0015  sun protein  29.59 
 
 		 462 aa  173  6.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0800124 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0018  sun protein  31.34 
 
 		 440 aa  173  7.999999999999999e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00150  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  48.03 
 
 		 443 aa  173  7.999999999999999e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4428  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  32.07 
 
 		 449 aa  172  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0022  sun protein  33.17 
 
 		 428 aa  172  2e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0022  sun protein  32.68 
 
 		 427 aa  171  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1119  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  35.65 
 
 		 429 aa  171  4e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2646  hypothetical protein  30.52 
 
 		 427 aa  170  6e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3720  16S rRNA methyltransferase B  30 
 
 		 428 aa  170  7e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.773777  hitchhiker  0.0077943 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0015  Fmu, rRNA SAM-dependent methyltransferase  38.53 
 
 		 436 aa  169  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0208773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2475  sun protein  32.21 
 
 		 434 aa  169  1e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4706  sun protein  31.6 
 
 		 446 aa  169  1e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2869  sun protein  50.66 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2516  hypothetical protein  30.52 
 
 		 427 aa  168  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0962  sun protein  33.62 
 
 		 451 aa  167  4e-40  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.316292  normal  0.597237 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0022  sun protein  34.8 
 
 		 431 aa  167  5.9999999999999996e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.242982 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0191  sun protein  32.51 
 
 		 436 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0021  sun protein  34.8 
 
 		 434 aa  166  6.9999999999999995e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3738  sun protein  32.2 
 
 		 427 aa  166  9e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00223417 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3373  Sun protein  34.7 
 
 		 448 aa  166  1.0000000000000001e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00020  16S rRNA m(5)C 967 methyltransferase  33.66 
 
 		 439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3242  sun protein  35.27 
 
 		 452 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0117569  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3583  sun protein  37.04 
 
 		 443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0041  sun protein  32.18 
 
 		 433 aa  164  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0425  sun protein  33.51 
 
 		 429 aa  163  6e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3482  16S rRNA methyltransferase B  33.51 
 
 		 429 aa  163  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0066221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>