85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0950 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0950  hypothetical protein  100 
 
 
491 aa  1014    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1377  hypothetical protein  37.35 
 
 
498 aa  296  8e-79  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.522028  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2208  hypothetical protein  30.6 
 
 
432 aa  204  3e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.511265  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0889  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  30.49 
 
 
451 aa  98.2  3e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0393323  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2938  hypothetical protein  25.74 
 
 
499 aa  95.1  3e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0338123 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003236  hypothetical protein  24.32 
 
 
471 aa  94.4  4e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1365  hypothetical protein  23.73 
 
 
470 aa  91.7  3e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  26.29 
 
 
562 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  26.29 
 
 
562 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1785  hypothetical protein  24.16 
 
 
458 aa  79  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.163327 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1786  hypothetical protein  29.02 
 
 
649 aa  73.6  0.000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  28.04 
 
 
584 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3538  protein of unknown function DUF1524 RloF  26.02 
 
 
699 aa  68.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00806563  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  28.04 
 
 
584 aa  68.9  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  28.7 
 
 
573 aa  66.6  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  26.67 
 
 
559 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  25.93 
 
 
585 aa  66.2  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1488  protein of unknown function DUF262  22.84 
 
 
600 aa  65.5  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00127  hypothetical protein  50 
 
 
722 aa  64.7  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7820  hypothetical protein  29.38 
 
 
842 aa  64.7  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.299548  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2444  protein of unknown function DUF262  26.88 
 
 
606 aa  64.7  0.000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000863016  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3665  hypothetical protein  27.27 
 
 
596 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  25.59 
 
 
555 aa  63.5  0.000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2207  hypothetical protein  25.4 
 
 
593 aa  62.8  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  24.21 
 
 
539 aa  62.4  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  31.42 
 
 
689 aa  61.2  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0008  hypothetical protein  40.86 
 
 
563 aa  60.5  0.00000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000116352  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1606  protein of unknown function DUF1524 RloF  25.74 
 
 
699 aa  60.5  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.121112  normal  0.168906 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1372  protein of unknown function DUF262  26.77 
 
 
600 aa  60.5  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00399856  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  27.48 
 
 
550 aa  60.1  0.00000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3497  protein of unknown function DUF262  27.96 
 
 
552 aa  59.3  0.0000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.986213  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1364  hypothetical protein  40.85 
 
 
663 aa  58.9  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1588  hypothetical protein  28.12 
 
 
465 aa  58.9  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  25.9 
 
 
687 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0691  hypothetical protein  28.12 
 
 
465 aa  58.9  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0813934  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1674  protein of unknown function DUF262  25.32 
 
 
695 aa  58.5  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003237  hypothetical protein  40.85 
 
 
664 aa  58.9  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  42.86 
 
 
529 aa  58.5  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0845  hypothetical protein  23.24 
 
 
552 aa  58.5  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000332427  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1806  protein of unknown function DUF1524 RloF  25.22 
 
 
700 aa  57.8  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  24.53 
 
 
689 aa  57.4  0.0000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4161  protein of unknown function DUF262  33.33 
 
 
580 aa  57.4  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.759874 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  34.41 
 
 
573 aa  57  0.0000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7747  protein of unknown function DUF262  26.52 
 
 
561 aa  57  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  26.09 
 
 
704 aa  57  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0142  protein of unknown function DUF262  25 
 
 
588 aa  56.6  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00379365  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0949  hypothetical protein  26.39 
 
 
723 aa  56.2  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.000044524 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4025  hypothetical protein  27.48 
 
 
619 aa  56.2  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13920  hypothetical protein  26.46 
 
 
692 aa  55.8  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2199  hypothetical protein  33.33 
 
 
172 aa  55.8  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.592741  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0357  protein of unknown function DUF262  24.19 
 
 
785 aa  55.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2212  hypothetical protein  41.33 
 
 
82 aa  55.5  0.000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0888  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  23.6 
 
 
709 aa  55.5  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0257798  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0598  hypothetical protein  36.84 
 
 
593 aa  51.6  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3125  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3436  hypothetical protein  22.22 
 
 
582 aa  51.6  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000371646  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2361  hypothetical protein  23.21 
 
 
619 aa  51.6  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1376  hypothetical protein  22.07 
 
 
680 aa  51.6  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2635  protein of unknown function DUF262  26.03 
 
 
573 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0545  hypothetical protein  33.75 
 
 
568 aa  50.4  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2937  hypothetical protein  38.81 
 
 
646 aa  49.7  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.445599  normal  0.0799017 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  24.06 
 
 
590 aa  49.3  0.0002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0174  protein of unknown function DUF262  25.52 
 
 
526 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3312  protein of unknown function DUF262  23.79 
 
 
621 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0894  hypothetical protein  43.28 
 
 
578 aa  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  27.84 
 
 
591 aa  48.1  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  24.47 
 
 
697 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  24.47 
 
 
697 aa  48.1  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1333  protein of unknown function DUF262  24.89 
 
 
722 aa  47.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0512  hypothetical protein  21.85 
 
 
656 aa  47  0.0007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.507612  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3527  protein of unknown function DUF1524 RloF  26.05 
 
 
555 aa  47  0.0007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2195  hypothetical protein  34.02 
 
 
602 aa  47  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.237664  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0726  hypothetical protein  32.18 
 
 
322 aa  47  0.0009  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.151945  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3481  protein of unknown function DUF262  25.21 
 
 
573 aa  46.2  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0809  hypothetical protein  23.22 
 
 
570 aa  46.2  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2940  protein of unknown function DUF1524 RloF  24.64 
 
 
772 aa  46.6  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0973906 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2071  hypothetical protein  24.07 
 
 
571 aa  46.2  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.291238  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2694  hypothetical protein  32.39 
 
 
601 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49019  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4594  protein of unknown function DUF262  26.76 
 
 
707 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0325  hypothetical protein  38.57 
 
 
569 aa  45.4  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1353  protein of unknown function DUF262  27.33 
 
 
577 aa  45.1  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00339326  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2420  hypothetical protein  37.5 
 
 
165 aa  45.1  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.738523  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  24.83 
 
 
1186 aa  43.9  0.006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22640  hypothetical protein  23.61 
 
 
695 aa  43.9  0.007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1971  protein of unknown function DUF262  24.22 
 
 
596 aa  43.5  0.009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0185458  hitchhiker  0.00310192 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3929  hypothetical protein  24.65 
 
 
574 aa  43.5  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0195005  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>