69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0809 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0809  hypothetical protein  100 
 
 
570 aa  1173    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2195  hypothetical protein  31.93 
 
 
602 aa  276  8e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.237664  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1353  protein of unknown function DUF262  27.41 
 
 
577 aa  206  1e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00339326  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2694  hypothetical protein  26.24 
 
 
601 aa  186  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.49019  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0248  hypothetical protein  22.71 
 
 
615 aa  95.5  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2937  hypothetical protein  27.75 
 
 
646 aa  73.2  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.445599  normal  0.0799017 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0888  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  23.71 
 
 
709 aa  72  0.00000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0257798  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3715  hypothetical protein  25.89 
 
 
550 aa  70.9  0.00000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.321085  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0598  hypothetical protein  25.43 
 
 
593 aa  70.1  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.3125  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2122  hypothetical protein  23 
 
 
584 aa  67  0.0000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2410  hypothetical protein  23 
 
 
584 aa  67  0.0000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103341  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1786  hypothetical protein  34.31 
 
 
649 aa  66.6  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.35073 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2207  hypothetical protein  31.4 
 
 
593 aa  66.2  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011888  Mnod_7747  protein of unknown function DUF262  26.69 
 
 
561 aa  64.7  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2938  hypothetical protein  26.73 
 
 
499 aa  64.7  0.000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0338123 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1817  hypothetical protein  25.1 
 
 
591 aa  60.8  0.00000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000172798  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1376  hypothetical protein  25.36 
 
 
680 aa  60.1  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0267  hypothetical protein  26.36 
 
 
689 aa  58.9  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.56107  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3077  protein of unknown function DUF262  26.03 
 
 
555 aa  57.8  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.392398 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1588  hypothetical protein  23.74 
 
 
465 aa  57  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0691  hypothetical protein  23.74 
 
 
465 aa  57  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0813934  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0889  conserved hypothetical protein (DUF262 domain protein)  22.04 
 
 
451 aa  56.2  0.000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0393323  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0034  hypothetical protein  28.7 
 
 
573 aa  56.6  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0208937  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3945  hypothetical protein  25.95 
 
 
573 aa  55.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0949  hypothetical protein  26.58 
 
 
723 aa  55.1  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.000044524 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7133  hypothetical protein  43.94 
 
 
559 aa  53.5  0.000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.00000000737025  decreased coverage  0.000000353312 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1820  hypothetical protein  24.37 
 
 
562 aa  53.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.238438  normal  0.026885 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0982  protein of unknown function DUF262  24.51 
 
 
529 aa  53.5  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1710  hypothetical protein  24.37 
 
 
562 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.266494  normal  0.0511855 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13920  hypothetical protein  38.55 
 
 
692 aa  52.4  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003236  hypothetical protein  25.93 
 
 
471 aa  52.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1488  protein of unknown function DUF262  23.69 
 
 
600 aa  52.8  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1365  hypothetical protein  23.83 
 
 
470 aa  52.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003237  hypothetical protein  26.19 
 
 
664 aa  52.4  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1364  hypothetical protein  26.98 
 
 
663 aa  52  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2361  hypothetical protein  24.9 
 
 
619 aa  52  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.112416 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0903  hypothetical protein  25.48 
 
 
689 aa  51.6  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000406708 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00127  hypothetical protein  37.7 
 
 
722 aa  50.8  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0894  hypothetical protein  24.7 
 
 
578 aa  50.1  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0810  protein of unknown function DUF262  22.43 
 
 
585 aa  50.1  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00011532 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3665  hypothetical protein  23.38 
 
 
596 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.135844  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0950  hypothetical protein  24.06 
 
 
491 aa  49.3  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  unclonable  0.0000401768 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0545  hypothetical protein  40.62 
 
 
568 aa  49.3  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1785  hypothetical protein  25.23 
 
 
458 aa  49.7  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.163327 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1103  protein of unknown function DUF1524 RloF  24.29 
 
 
726 aa  48.1  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.509956  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl305  hypothetical protein  33.01 
 
 
835 aa  47.8  0.0006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000811373  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0065  hypothetical protein  25.19 
 
 
760 aa  47.4  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0142  protein of unknown function DUF262  39.39 
 
 
588 aa  47.4  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00379365  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4888  hypothetical protein  36.71 
 
 
697 aa  46.6  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.886735  normal  0.908596 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2635  protein of unknown function DUF262  26.29 
 
 
573 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19610  hypothetical protein  25 
 
 
590 aa  46.6  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3251  protein of unknown function DUF262  22.13 
 
 
539 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.261735  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0112  hypothetical protein  44.64 
 
 
127 aa  46.2  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1739  hypothetical protein  24.31 
 
 
659 aa  45.8  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.408592  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2199  hypothetical protein  39.06 
 
 
172 aa  46.2  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.592741  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03030  hypothetical protein  35.82 
 
 
690 aa  45.8  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5531  hypothetical protein  27.42 
 
 
390 aa  46.2  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3481  protein of unknown function DUF262  35.29 
 
 
573 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1150  protein of unknown function DUF262  31.96 
 
 
687 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2208  hypothetical protein  22.55 
 
 
432 aa  45.8  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.511265  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3721  hypothetical protein  36.71 
 
 
697 aa  46.2  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0008  hypothetical protein  23.23 
 
 
563 aa  45.4  0.003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  decreased coverage  0.000000116352  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4161  protein of unknown function DUF262  36.25 
 
 
580 aa  44.7  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.759874 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2238  hypothetical protein  35.62 
 
 
704 aa  44.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1377  hypothetical protein  32.56 
 
 
498 aa  44.7  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.522028  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22640  hypothetical protein  25.09 
 
 
695 aa  44.3  0.006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2494  hypothetical protein  32.31 
 
 
375 aa  43.9  0.007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0036317  normal  0.931696 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0325  hypothetical protein  36.36 
 
 
569 aa  44.3  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2734  Protein of unknown function DUF2081  31.52 
 
 
753 aa  43.9  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.490973 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>