184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1503 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  100 
 
 
168 aa  335  1.9999999999999998e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  37.2 
 
 
158 aa  103  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  38.79 
 
 
161 aa  94.4  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.92 
 
 
165 aa  92.4  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.42 
 
 
164 aa  92.4  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  39.76 
 
 
181 aa  87.4  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  39.16 
 
 
161 aa  85.5  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  34.73 
 
 
176 aa  78.2  0.00000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.52 
 
 
160 aa  77.8  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  35.5 
 
 
186 aa  77.4  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1287  phosphodiesterase  31.98 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.58 
 
 
175 aa  75.1  0.0000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2682  phosphodiesterase  32.35 
 
 
162 aa  75.1  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0319017  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.14 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  36.08 
 
 
172 aa  72  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  32.76 
 
 
153 aa  71.2  0.000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  36.97 
 
 
179 aa  70.5  0.00000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  33.93 
 
 
174 aa  70.5  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3620  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.3 
 
 
162 aa  69.7  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.626533  normal  0.471048 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.86 
 
 
167 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0324  phosphodiesterase  32.34 
 
 
152 aa  69.7  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00874535  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  30.72 
 
 
155 aa  69.3  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.53 
 
 
164 aa  68.6  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  29.7 
 
 
163 aa  68.6  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  34.52 
 
 
151 aa  68.2  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  34.39 
 
 
157 aa  68.2  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  31.18 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  31.18 
 
 
157 aa  67.8  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  32.3 
 
 
164 aa  67.8  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.48 
 
 
162 aa  67  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2380  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.33 
 
 
171 aa  65.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3064  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.57 
 
 
196 aa  66.2  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.109166  normal  0.620123 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  28.14 
 
 
163 aa  65.5  0.0000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  35.48 
 
 
160 aa  65.9  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.66 
 
 
168 aa  65.1  0.0000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2610  phosphoesterase, putative  32.74 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0330277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.33 
 
 
178 aa  65.1  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.52 
 
 
167 aa  64.7  0.0000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  33.1 
 
 
182 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1506  hypothetical protein  33.99 
 
 
173 aa  63.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1510  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.76 
 
 
159 aa  63.5  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2849  phosphodiesterase  34.56 
 
 
183 aa  63.5  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000408209  normal  0.4259 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2361  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.99 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0202207  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2449  phosphodiesterase, MJ0936 family  33.99 
 
 
173 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2562  phosphodiesterase  38.05 
 
 
183 aa  63.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000239998  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3000  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.21 
 
 
163 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.898077  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3319  phosphodiesterase  36.84 
 
 
183 aa  63.2  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000113864  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  27.54 
 
 
163 aa  62.4  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  32.74 
 
 
152 aa  62  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  33.78 
 
 
168 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2783  phosphodiesterase  35.59 
 
 
183 aa  62  0.000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000586616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2350  hypothetical protein  32.35 
 
 
152 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.24559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2402  hypothetical protein  32.75 
 
 
155 aa  61.6  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00855962 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1480  phosphodiesterase  35.96 
 
 
183 aa  61.6  0.000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000335097  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1382  phosphodiesterase  37.12 
 
 
183 aa  61.2  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000798983  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  33.57 
 
 
172 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  33.57 
 
 
172 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  33.57 
 
 
172 aa  60.5  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2607  phosphodiesterase  31.07 
 
 
168 aa  60.5  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2238  Ser/Thr protein phosphatase family protein  28.48 
 
 
156 aa  59.7  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000739352  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0771  phosphodiesterase  31.03 
 
 
155 aa  59.3  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1836  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.64 
 
 
170 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0553  phosphodiesterase  26.55 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.279938  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  28.83 
 
 
160 aa  58.9  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0437  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.65 
 
 
167 aa  58.9  0.00000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2257  phosphodiesterase  26.37 
 
 
184 aa  58.9  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3565  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.03 
 
 
169 aa  58.5  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02225  phosphodiesterase  34.11 
 
 
184 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000313481  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1356  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.11 
 
 
183 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141815  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2676  phosphodiesterase  34.11 
 
 
183 aa  58.2  0.00000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000604392  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  28.08 
 
 
157 aa  58.2  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1346  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.84 
 
 
167 aa  58.2  0.00000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02185  hypothetical protein  34.11 
 
 
184 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000598412  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2456  phosphodiesterase  34.11 
 
 
183 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140004  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2450  phosphodiesterase  34.11 
 
 
183 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  4.0596e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2594  phosphodiesterase  34.11 
 
 
183 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000172838  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3440  phosphodiesterase  34.11 
 
 
183 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000310353  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1352  phosphodiesterase  34.11 
 
 
183 aa  58.2  0.00000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000000389117  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  28.74 
 
 
157 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  28.14 
 
 
157 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  30.97 
 
 
162 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  31.94 
 
 
166 aa  57.4  0.00000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  37.06 
 
 
210 aa  57.4  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  34.46 
 
 
178 aa  57.4  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0289  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.75 
 
 
170 aa  57  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1389  phosphodiesterase  27.22 
 
 
178 aa  56.6  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4206  phosphodiesterase  27.71 
 
 
152 aa  57.4  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2256  phosphodiesterase  31.36 
 
 
153 aa  57.4  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1492  phosphodiesterase  28.66 
 
 
160 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.953223  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0170  hypothetical protein  27.81 
 
 
173 aa  56.6  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08250  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.65 
 
 
186 aa  56.6  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  34.03 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2534  Ser/Thr protein phosphatase family protein  27.27 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000590014  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.26 
 
 
162 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  32.68 
 
 
148 aa  55.5  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4059  phosphodiesterase  28.39 
 
 
185 aa  55.5  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00143502  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1354  phosphodiesterase, MJ0936 family  26.45 
 
 
159 aa  55.1  0.0000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000205974  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0641  phosphodiesterase  26.09 
 
 
185 aa  54.7  0.0000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.558734  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1164  putative phosphodiesterase (yfcE)  30.3 
 
 
154 aa  54.7  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1184  phosphodiesterase  27.78 
 
 
196 aa  54.7  0.0000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.547568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>