73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0771 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0771  phosphodiesterase  100 
 
 
155 aa  315  2e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1741  phosphodiesterase  40.79 
 
 
157 aa  123  1e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1668  phosphodiesterase  40.79 
 
 
157 aa  123  1e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0811  phosphodiesterase  34.46 
 
 
155 aa  93.6  8e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7192  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.03 
 
 
167 aa  85.5  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1638  phosphodiesterase, MJ0936 family  35.46 
 
 
165 aa  84  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0456  phosphodiesterase  31.82 
 
 
181 aa  83.2  0.000000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1850  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.39 
 
 
164 aa  76.6  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.447532 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1514  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.35 
 
 
210 aa  77  0.0000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.163158 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2125  phosphodiesterase  30.38 
 
 
158 aa  73.9  0.0000000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000700609 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2058  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.66 
 
 
168 aa  73.6  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000252538 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03090  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.51 
 
 
160 aa  72.8  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2834  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.67 
 
 
179 aa  72  0.000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000207557  normal  0.0308654 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3196  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.29 
 
 
164 aa  71.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.352937  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5609  phosphodiesterase  28.47 
 
 
168 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749126  normal  0.532509 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2580  phosphodiesterase  26.17 
 
 
161 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1198  phosphodiesterase  27.74 
 
 
182 aa  69.7  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.244677  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02370  phosphoesterase, MJ0936 family  29.58 
 
 
178 aa  69.3  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.569795  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6302  phosphodiesterase  28.17 
 
 
177 aa  68.6  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317374  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4978  hypothetical protein  29.2 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.703942  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5066  phosphodiesterase  29.2 
 
 
172 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5359  phosphodiesterase  29.2 
 
 
172 aa  68.2  0.00000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0345  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.59 
 
 
162 aa  65.5  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.24583 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3191  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.34 
 
 
161 aa  63.9  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1346  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.74 
 
 
167 aa  63.9  0.0000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  hitchhiker  0.00939202  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3036  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.17 
 
 
164 aa  63.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3565  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.08 
 
 
169 aa  59.3  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1503  phosphoesterase  31.03 
 
 
168 aa  59.3  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.802300000000002e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1397  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.2 
 
 
166 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1149  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.08 
 
 
154 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1793  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.41 
 
 
172 aa  57.4  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.696685  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0338  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.68 
 
 
175 aa  55.1  0.0000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3113  phosphodiesterase, MJ0936 family  30.19 
 
 
154 aa  54.3  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1477  phosphodiesterase  25.15 
 
 
148 aa  54.3  0.0000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01341  vacuolar protein sorting 29, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09480)  32.37 
 
 
200 aa  53.9  0.0000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0461116  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0059  hypothetical protein  28.48 
 
 
160 aa  52  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2035  hypothetical protein  33.88 
 
 
186 aa  50.8  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.14713  normal  0.52791 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2286  phosphodiesterase  28 
 
 
156 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0444  hypothetical protein  27.35 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04590  hypothetical protein  27.35 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0186  phosphodiesterase  27.82 
 
 
179 aa  49.7  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0679  phosphodiesterase, MJ0936 family  28.78 
 
 
162 aa  49.7  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.488967 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2626  phosphodiesterase, MJ0936 family  30 
 
 
162 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.655099 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2317  phosphodiesterase  29.93 
 
 
174 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.179128  normal  0.0832015 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1749  hypothetical protein  28.89 
 
 
160 aa  48.5  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.116925 
 
 
-
 
NC_006670  CNA01710  retrograde transport, endosome to Golgi-related protein, putative  28.57 
 
 
203 aa  48.1  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.909765  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0745  phosphodiesterase  28.15 
 
 
163 aa  48.5  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.751272  normal  0.75862 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1508  hypothetical protein  30.3 
 
 
162 aa  47.4  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.192529 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0810  phosphodiesterase  27.94 
 
 
164 aa  47.4  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1529  hypothetical protein  28.36 
 
 
154 aa  46.6  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.145823  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0329  phosphodiesterase, MJ0936 family  25.9 
 
 
172 aa  47  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0779553  normal  0.0229363 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1240  phosphodiesterase  29.44 
 
 
184 aa  46.2  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1360  hypothetical protein  30 
 
 
176 aa  45.4  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03780  phosphoesterase, MJ0936 family  27.82 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00356209  normal  0.195847 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1000  hypothetical protein  29.1 
 
 
153 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0102337 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0455  hypothetical protein  29.2 
 
 
157 aa  44.7  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0076  phosphodiesterase  29.63 
 
 
163 aa  44.3  0.0006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2498  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.21 
 
 
157 aa  43.9  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0714523  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1173  phosphodiesterase  29.63 
 
 
163 aa  43.9  0.0009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.111939  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17936  predicted protein  26.53 
 
 
206 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.572241  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2598  phosphodiesterase, MJ0936 family  27.27 
 
 
169 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0839  phosphodiesterase, MJ0936 family  32.61 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0437301  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2552  phosphodiesterase  28.57 
 
 
156 aa  42.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0760667  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0011  phosphodiesterase, MJ0936 family  31.21 
 
 
154 aa  42  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00169497  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1949  phosphodiesterase, MJ0936 family  29.52 
 
 
178 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0118303  normal  0.874816 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0304  hypothetical protein  34.78 
 
 
173 aa  42  0.003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.251513  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2127  phosphodiesterase  29.63 
 
 
152 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.214713 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03300  phosphoesterase protein  27.41 
 
 
151 aa  41.2  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.620314  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2672  hypothetical protein  27.1 
 
 
166 aa  41.2  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1642  phosphodiesterase  27.96 
 
 
187 aa  41.2  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0370  phosphodiesterase  27.94 
 
 
164 aa  41.2  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0825  phosphodiesterase, MJ0936 family  24.05 
 
 
167 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1598  hypothetical protein  32.88 
 
 
173 aa  40.4  0.01  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>