50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_1519 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009073  Pcal_1519  periplasmic binding protein  100 
 
 
435 aa  868  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  5.88293e-11 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1093  periplasmic binding protein  66.5 
 
 
428 aa  546  1e-154  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  8.16511e-06  hitchhiker  0.00387756 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1954  periplasmic binding protein  61.47 
 
 
428 aa  542  1e-153  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0336724  hitchhiker  2.00366e-18 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2136  periplasmic binding protein  56.04 
 
 
442 aa  494  1e-138  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0277  periplasmic binding protein  36.11 
 
 
371 aa  178  2e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0800726  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0118  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  30.48 
 
 
454 aa  150  4e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0161  periplasmic binding protein  30.52 
 
 
400 aa  123  6e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1003  periplasmic binding protein  29.41 
 
 
405 aa  122  1e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0182612  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1299  periplasmic binding protein  27.18 
 
 
414 aa  112  2e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0748  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  25.41 
 
 
385 aa  107  5e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2248  periplasmic binding protein  28.15 
 
 
434 aa  102  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226593  normal  0.029127 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0344  periplasmic binding protein  31.62 
 
 
437 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3086  periplasmic binding protein  28.09 
 
 
434 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.074128 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24460  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.17 
 
 
405 aa  94.7  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0277  periplasmic binding protein  27.03 
 
 
394 aa  94.4  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.035667  normal  0.0566476 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5372  periplasmic binding protein  27.55 
 
 
390 aa  92.8  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3541  periplasmic binding protein  26.52 
 
 
398 aa  89.7  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3336  periplasmic binding protein  25.52 
 
 
389 aa  87.8  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1024  putative iron complex transport system substrate-binding protein  25.2 
 
 
397 aa  86.7  8e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264421  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0083  periplasmic binding protein  26.12 
 
 
380 aa  85.9  1e-15  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622653  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12513  periplasmic-binding protein of ABC transporter  25.49 
 
 
378 aa  86.3  1e-15  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0670  putative lipoprotein  27.85 
 
 
379 aa  84  5e-15  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.174257 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3498  periplasmic binding protein  28.17 
 
 
401 aa  83.2  8e-15  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5230  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  25.41 
 
 
414 aa  79  1e-13  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0131  periplasmic binding protein  22.93 
 
 
411 aa  77.8  3e-13  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.400899  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1256  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  23.85 
 
 
374 aa  76.6  8e-13  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0111  periplasmic binding protein  22.75 
 
 
421 aa  65.1  2e-09  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2110  periplasmic binding protein  26.17 
 
 
435 aa  61.2  4e-08  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529465  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0648  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  18.75 
 
 
391 aa  60.5  5e-08  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.515203 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  26.4 
 
 
363 aa  60.1  7e-08  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  26.88 
 
 
318 aa  57  7e-07  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.28267e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  26.58 
 
 
335 aa  56.6  8e-07  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1006  putative iron complex transport system substrate-binding protein  22.64 
 
 
396 aa  55.8  2e-06  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.568283  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  26.64 
 
 
354 aa  54.3  4e-06  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0231  periplasmic binding protein  27.01 
 
 
723 aa  53.1  8e-06  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.999715  normal  0.640564 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  25 
 
 
331 aa  53.5  8e-06  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0373  periplasmic binding protein  27.01 
 
 
723 aa  52  2e-05  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.390993 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  26.34 
 
 
354 aa  51.6  2e-05  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  24.58 
 
 
304 aa  50.4  7e-05  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1296  putative iron complex transport system substrate-binding protein  22.06 
 
 
393 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.220074  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  26.99 
 
 
307 aa  48.9  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1203  putative periplasmic iron siderophore binding protein of ABC transporter  24.83 
 
 
347 aa  48.1  0.0003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  27.01 
 
 
384 aa  48.1  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  24.3 
 
 
354 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2652  ABC Fe3+-hydroxamate transporter, periplasmic ligand binding protein  23.57 
 
 
270 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  23.72 
 
 
341 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  23 
 
 
305 aa  44.3  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  22.99 
 
 
688 aa  43.5  0.007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  25.95 
 
 
322 aa  43.1  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  3.6127e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  25.5 
 
 
682 aa  43.1  0.01  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>