More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0158 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0158  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 		 314 aa  645    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.625085 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1004  beta-lactamase domain-containing protein  77.49 
 
 		 320 aa  526  1e-148  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.217464 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1879  beta-lactamase domain-containing protein  69.23 
 
 		 322 aa  481  1e-135  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8278  Zn-dependent hydrolase including glyoxylase- like protein  35.91 
 
 		 348 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0643928 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8202  beta-lactamase domain-containing protein  38.41 
 
 		 339 aa  155  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08650  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  37.34 
 
 		 346 aa  155  6e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.637388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3655  beta-lactamase domain protein  35.76 
 
 		 332 aa  153  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.114597  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2556  beta-lactamase domain-containing protein  34.98 
 
 		 323 aa  152  7e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0832  beta-lactamase domain protein  32.71 
 
 		 324 aa  149  9e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000197877 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0322  beta-lactamase domain protein  32.48 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.933059  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0428  beta-lactamase domain-containing protein  32.92 
 
 		 366 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.39788  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  33.94 
 
 		 368 aa  142  8e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2131  beta-lactamase domain protein  33.54 
 
 		 337 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0784  beta-lactamase domain protein  33.53 
 
 		 354 aa  138  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2457  beta-lactamase domain-containing protein  35.62 
 
 		 327 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.130811  normal  0.600713 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3988  beta-lactamase domain protein  32.32 
 
 		 351 aa  135  9.999999999999999e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  33.75 
 
 		 324 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2834  beta-lactamase domain protein  31.37 
 
 		 324 aa  134  3e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1439  beta-lactamase domain protein  30.56 
 
 		 329 aa  127  2.0000000000000002e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000967067  normal  0.166741 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0438  hypothetical protein  31.15 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000571233  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4516  beta-lactamase domain-containing protein  32.93 
 
 		 346 aa  126  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1013  beta-lactamase domain protein  31.85 
 
 		 322 aa  124  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.151542  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0050  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 		 334 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1152  beta-lactamase domain-containing protein  29.52 
 
 		 321 aa  116  3.9999999999999997e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.489043  hitchhiker  0.0056375 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0066  beta-lactamase domain protein  32.71 
 
 		 334 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.391302  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2417  beta-lactamase domain-containing protein  29.07 
 
 		 371 aa  116  5e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3993  beta-lactamase domain-containing protein  29.78 
 
 		 321 aa  115  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000582662 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0054  beta-lactamase domain protein  32.71 
 
 		 334 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  31.29 
 
 		 331 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1031  beta-lactamase domain protein  30.57 
 
 		 323 aa  114  3e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0210455  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2650  beta-lactamase domain-containing protein  27.56 
 
 		 324 aa  112  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0101  beta-lactamase-like protein  28.78 
 
 		 359 aa  112  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1982  beta-lactamase domain-containing protein  30.38 
 
 		 361 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0281  hypothetical protein  29.97 
 
 		 359 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.18209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2629  Beta-lactamase-like  30.7 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  32.91 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1745  beta-lactamase-like protein  29.52 
 
 		 335 aa  109  7.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.931232  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  31.33 
 
 		 324 aa  108  1e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1372  beta-lactamase domain protein  29.56 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.93843  normal  0.529651 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  32.01 
 
 		 862 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0777  beta-lactamase domain-containing protein  29.24 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.493847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4822  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 		 357 aa  106  5e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.405979  normal  0.833796 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2708  beta-lactamase domain protein  28.91 
 
 		 325 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0967231  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01454  metallo-beta-lactamase family protein  29.25 
 
 		 343 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0103  Beta-lactamase-like  28.88 
 
 		 341 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4704  beta-lactamase domain protein  29.21 
 
 		 325 aa  104  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0680  beta-lactamase domain-containing protein  29.32 
 
 		 365 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0132  Beta-lactamase-like  27.89 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2272  beta-lactamase domain protein  28.48 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5569  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0506555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0310  beta-lactamase-like  29.7 
 
 		 348 aa  102  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0347  metallo-beta-lactamase family protein  30.09 
 
 		 326 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.607947  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0729  beta-lactamase domain protein  29.1 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0582  metallo-beta-lactamase family protein  29.7 
 
 		 331 aa  100  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  29.6 
 
 		 340 aa  100  3e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0420  metallo-beta-lactamase family protein  29.39 
 
 		 359 aa  100  4e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.611131  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2007  metallo-beta-lactamase family protein  29.39 
 
 		 359 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3089  metallo-beta-lactamase family protein  29.39 
 
 		 359 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2281  metallo-beta-lactamase family protein  29.39 
 
 		 359 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.858667  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0093  metallo-beta-lactamase family protein  29.39 
 
 		 383 aa  99.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0368  beta-lactamase-like protein  31 
 
 		 374 aa  99.8  5e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.967784  normal  0.392052 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0400  metallo-beta-lactamase family protein  29.7 
 
 		 359 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4274  Beta-lactamase-like  29.01 
 
 		 357 aa  99.4  7e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3882  Zn-dependent hydrolase  29.38 
 
 		 317 aa  99  8e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0139  beta-lactamase domain protein  29.19 
 
 		 359 aa  99  9e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.486193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0182  beta-lactamase domain-containing protein  29.45 
 
 		 356 aa  99  9e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3328  beta-lactamase domain protein  30.06 
 
 		 330 aa  98.2  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4206  metallo-beta-lactamase domain-containing protein  28.75 
 
 		 317 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0051  beta-lactamase domain-containing protein  30.58 
 
 		 334 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.361885 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4269  hypothetical protein  29.06 
 
 		 317 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0131  beta-lactamase domain protein  29.13 
 
 		 359 aa  97.4  3e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3890  zinc metallohydrolase  29.38 
 
 		 317 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.489775  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3968  beta-lactamase domain-containing protein  28.75 
 
 		 317 aa  97.1  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0386675  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4168  beta-lactamase domain protein  27.68 
 
 		 318 aa  97.1  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3844  beta-lactamase-like  28.35 
 
 		 366 aa  97.1  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4825  beta-lactamase-like  26.93 
 
 		 354 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.601465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4159  hypothetical protein  29.38 
 
 		 317 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  29.23 
 
 		 318 aa  96.3  6e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4245  hypothetical protein  29.38 
 
 		 317 aa  95.9  7e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11930  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  28.88 
 
 		 354 aa  95.9  8e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.985203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6268  Beta-lactamase-like  28.11 
 
 		 359 aa  95.9  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0991  hypothetical protein  29.06 
 
 		 317 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2141  Beta-lactamase-like  28.16 
 
 		 354 aa  95.5  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2311  beta-lactamase-like  28.11 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0380  beta-lactamase domain-containing protein  27.3 
 
 		 359 aa  95.1  1e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.335712 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2925  beta-lactamase domain-containing protein  28.11 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4736  cyclic nucleotide-binding protein  28.75 
 
 		 359 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05440  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  27.88 
 
 		 352 aa  94.7  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.853516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2123  beta-lactamase domain-containing protein  29.85 
 
 		 369 aa  93.6  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.747407  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2059  beta-lactamase domain protein  27.16 
 
 		 350 aa  93.6  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000000271524  normal  0.300872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2974  beta-lactamase domain-containing protein  27.87 
 
 		 384 aa  93.6  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4696  beta-lactamase domain-containing protein  26.79 
 
 		 400 aa  93.2  5e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.750931  normal  0.0866563 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2940  beta-lactamase domain-containing protein  26.95 
 
 		 359 aa  93.2  5e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.571743 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0839  beta-lactamase-like  27.74 
 
 		 354 aa  92.8  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.228122 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3370  hypothetical protein  29.91 
 
 		 362 aa  92.8  7e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.499029 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0864  putative metallo-hydrolase/oxidoreductase superfamily protein  28.71 
 
 		 352 aa  92.4  8e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.342538 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2837  beta-lactamase domain-containing protein  27.41 
 
 		 358 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.9285 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0923  beta-lactamase domain protein  25.55 
 
 		 354 aa  91.3  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.526967  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2635  beta-lactamase domain protein  27.08 
 
 		 349 aa  89  8e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.963581 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1528  beta-lactamase-like protein  27.91 
 
 		 331 aa  89.4  8e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0999562  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>