More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0006 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009073  Pcal_0006  30S ribosomal protein S7P  100 
 
 		 223 aa  456  9.999999999999999e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0001  30S ribosomal protein S7P  87 
 
 		 223 aa  419  1e-116  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_2007  30S ribosomal protein S7P  88.29 
 
 		 224 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0655  30S ribosomal protein S7P  86.49 
 
 		 224 aa  412  1e-114  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.156738  hitchhiker  0.00506477 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1931  30S ribosomal protein S7P  68.75 
 
 		 234 aa  341  5e-93  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.37816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0268  30S ribosomal protein S7P  67.5 
 
 		 200 aa  281  5.000000000000001e-75  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1197  ribosomal protein S7  67.03 
 
 		 193 aa  260  1e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0040  30S ribosomal protein S7P  61.86 
 
 		 194 aa  245  4e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000291032  normal  0.0943991 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0071  ribosomal protein S7  58.15 
 
 		 187 aa  219  3e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000000211426  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1305  30S ribosomal protein S7P  52.69 
 
 		 188 aa  201  9e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0613  30S ribosomal protein S7P  52.69 
 
 		 188 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0210  30S ribosomal protein S7P  53.23 
 
 		 188 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0355  30S ribosomal protein S7P  50.26 
 
 		 199 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK03230  40s ribosomal protein s5-1, putative  49.5 
 
 		 205 aa  196  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2384  30S ribosomal protein S7P  49.73 
 
 		 202 aa  196  3e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.469279  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_12674  Ribosomal protein S5, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  52.15 
 
 		 194 aa  194  7e-49  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0784  30S ribosomal protein S7P  52.69 
 
 		 188 aa  194  1e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00843  hypothetical protein similar to ribosomal protein S5 (Broad)  48.79 
 
 		 215 aa  192  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0678  30S ribosomal protein S7P  50.54 
 
 		 188 aa  192  3e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.857285  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3687  30S ribosomal protein S7P  46.99 
 
 		 185 aa  191  8e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.270725 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29097  predicted protein  48.94 
 
 		 225 aa  188  5e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78426  predicted protein  51.63 
 
 		 228 aa  187  8e-47  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0242103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2206  30S ribosomal protein S7P  47.83 
 
 		 197 aa  187  1e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.661018  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1172  30S ribosomal protein S7P  45.9 
 
 		 186 aa  187  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000105021  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0359  ribosomal protein S7  46.45 
 
 		 202 aa  184  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0509  30S ribosomal protein S7P  45.7 
 
 		 204 aa  182  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0034  30S ribosomal protein S7P  46.99 
 
 		 185 aa  181  8.000000000000001e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0264  30S ribosomal protein S7P  48.37 
 
 		 204 aa  177  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0280  30S ribosomal protein S7P  46.74 
 
 		 204 aa  176  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0531447  normal  0.094163 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2158  ribosomal protein S7  44.26 
 
 		 202 aa  176  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0100  30S ribosomal protein S7P  41.85 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.252795  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1614  30S ribosomal protein S7P  43.32 
 
 		 194 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.759072 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2829  30S ribosomal protein S7P  46.74 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.337095 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0103  30S ribosomal protein S7  43.07 
 
 		 156 aa  94.7  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0288  30S ribosomal protein S7  42.34 
 
 		 156 aa  91.3  9e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000131249  hitchhiker  3.87483e-16 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0107  30S ribosomal protein S7  40.88 
 
 		 156 aa  89.4  4e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000442376  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  39.71 
 
 		 156 aa  86.7  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2715  ribosomal protein S7  41.61 
 
 		 156 aa  86.3  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0530682  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0100  30S ribosomal protein S7  39.42 
 
 		 156 aa  86.3  3e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000900899  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0106  30S ribosomal protein S7  39.42 
 
 		 156 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000153509  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0106  30S ribosomal protein S7  39.42 
 
 		 156 aa  85.9  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101536  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0102  30S ribosomal protein S7  39.42 
 
 		 156 aa  85.9  4e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.10325e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0118  30S ribosomal protein S7  39.42 
 
 		 156 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.49729e-62 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0100  30S ribosomal protein S7  39.42 
 
 		 156 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000171364  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0137  30S ribosomal protein S7  39.42 
 
 		 156 aa  85.9  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000219716  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0106  30S ribosomal protein S7  39.42 
 
 		 156 aa  85.9  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000154226  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0808  30S ribosomal protein S7  40.15 
 
 		 157 aa  86.3  4e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000412886  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0127  30S ribosomal protein S7  39.42 
 
 		 156 aa  85.9  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000184124  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  36.76 
 
 		 156 aa  85.1  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0863  30S ribosomal protein S7  41.18 
 
 		 156 aa  85.1  8e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000741191  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1288  30S ribosomal protein S7  39.42 
 
 		 155 aa  84  0.000000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1398  30S ribosomal protein S7  39.42 
 
 		 155 aa  84  0.000000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000110546  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0838  ribosomal protein S7  37.96 
 
 		 155 aa  82.4  0.000000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.214031  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1799  30S ribosomal protein S7  42.98 
 
 		 156 aa  82.4  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0695126  normal  0.152757 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1315  30S ribosomal protein S7  37.96 
 
 		 156 aa  82  0.000000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000003043  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1920  30S ribosomal protein S7  38.24 
 
 		 156 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000398432  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3474  30S ribosomal protein S7  38.24 
 
 		 156 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0150358  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2636  30S ribosomal protein S7  38.24 
 
 		 156 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72727  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3781  30S ribosomal protein S7  38.24 
 
 		 156 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000664759  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3173  30S ribosomal protein S7  38.24 
 
 		 156 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000883465  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3750  30S ribosomal protein S7  38.24 
 
 		 156 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.023964  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3443  30S ribosomal protein S7  38.24 
 
 		 156 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000140353  normal  0.136335 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3808  30S ribosomal protein S7  38.24 
 
 		 156 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0245  30S ribosomal protein S7  38.24 
 
 		 156 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0896846  normal  0.195171 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2464  30S ribosomal protein S7  39.71 
 
 		 156 aa  81.3  0.00000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.025991 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3072  30S ribosomal protein S7  38.24 
 
 		 156 aa  80.9  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0565746  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0126  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 		 155 aa  81.3  0.00000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2763  30S ribosomal protein S7  38.24 
 
 		 156 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00114858  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0272  30S ribosomal protein S7  38.24 
 
 		 156 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.971221  normal  0.670435 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0263  30S ribosomal protein S7  38.24 
 
 		 156 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470053  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0344  30S ribosomal protein S7  38.24 
 
 		 156 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94658  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0323  30S ribosomal protein S7  38.24 
 
 		 156 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282632  normal  0.0186203 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0282  ribosomal protein S7  36.5 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000161589  decreased coverage  0.00000214239 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0401  30S ribosomal protein S7  36.76 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000162716  normal  0.0793455 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3447  30S ribosomal protein S7  33.79 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0304282  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1328  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 		 156 aa  80.1  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.34373  normal  0.104548 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2692  30S ribosomal protein S7  36.14 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.507657  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0101  30S ribosomal protein S7  37.96 
 
 		 156 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000722737  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0187  30S ribosomal protein S7  36.5 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00197814  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0583  30S ribosomal protein S7  36.5 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000892295  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0295  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 		 159 aa  79.7  0.00000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2718  30S ribosomal protein S7  37.96 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.196703  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2404  30S ribosomal protein S7  37.96 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000208558  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3862  30S ribosomal protein S7  33.82 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0569  30S ribosomal protein S7  36.5 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000147883  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  34.51 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1426  30S ribosomal protein S7  35.77 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0991095  normal  0.0239957 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5199  30S ribosomal protein S7  37.96 
 
 		 156 aa  79.7  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107065  unclonable  1.00774e-25 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2844  30S ribosomal protein S7  37.5 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507183  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0310  30S ribosomal protein S7  37.5 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0015989  normal  0.294423 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0051  30S ribosomal protein S7  36.09 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3648  30S ribosomal protein S7  37.5 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000151904  hitchhiker  0.000000000898288 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1528  ribosomal protein S7  38.69 
 
 		 156 aa  79.3  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192136  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2623  30S ribosomal protein S7  37.96 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000189797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  36.75 
 
 		 156 aa  79  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1682  30S ribosomal protein S7  35.86 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf313  30S ribosomal protein S7  37.23 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.0990117  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  37.5 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3326  30S ribosomal protein S7  38.97 
 
 		 156 aa  78.2  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1142  30S ribosomal protein S7  37.96 
 
 		 155 aa  78.2  0.00000000000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000000000563067  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>