More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03591 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_03591  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
260 aa  519  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.183875  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0539  ABC transporter, ATPase subunit  59.17 
 
 
251 aa  276  2e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3057  ABC transporter related  58.58 
 
 
258 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.635476 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3372  ABC transporter related  58.09 
 
 
250 aa  230  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3298  ABC transporter-related protein  55.6 
 
 
250 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1154  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  44.67 
 
 
318 aa  219  3.9999999999999997e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3117  ABC transporter related  48.31 
 
 
312 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0287879  normal  0.0491103 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0244  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.31 
 
 
381 aa  212  5.999999999999999e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4756  ABC transporter related protein  43.88 
 
 
328 aa  210  2e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2397  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  45.63 
 
 
315 aa  210  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1688  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  44.26 
 
 
376 aa  209  4e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.315313  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2401  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  45.24 
 
 
315 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.584641  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2308  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  45.24 
 
 
315 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2509  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  45.24 
 
 
315 aa  208  8e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.280806  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2352  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein opuCA  45.24 
 
 
315 aa  208  9e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2137  ABC transporter related  46.38 
 
 
312 aa  207  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.811751 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2493  glycine betaine/L-proline transport ATP-binding subunit  45.17 
 
 
388 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.957361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0316  ABC transporter related protein  47.23 
 
 
244 aa  207  2e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.815133 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0172  ABC transporter related  49.15 
 
 
310 aa  206  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.319596 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1921  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  42.51 
 
 
382 aa  204  8e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3511  ABC transporter related  47.03 
 
 
312 aa  204  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1518  ABC transporter related  45.96 
 
 
308 aa  204  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.961531  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2264  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  45.96 
 
 
308 aa  204  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0844  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, ATP-binding protein  45.96 
 
 
308 aa  204  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0915  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  45.96 
 
 
308 aa  204  1e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.530478 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1528  ABC transporter related protein  45.96 
 
 
308 aa  203  2e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.917455  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5061  ABC transporter related  46.19 
 
 
312 aa  203  2e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02059  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  45.96 
 
 
308 aa  202  3e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02017  hypothetical protein  45.96 
 
 
308 aa  202  3e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2258  ABC transporter related  47.64 
 
 
270 aa  202  3e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.36759 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3254  ABC transporter, quaternary amine uptake (QAT) family, ATP-binding protein  45.96 
 
 
308 aa  203  3e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000625793 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2418  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  45.53 
 
 
308 aa  202  4e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2475  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  42.21 
 
 
408 aa  202  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00846223  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2523  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  42.21 
 
 
408 aa  202  5e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0108992  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1352  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  45.8 
 
 
369 aa  202  5e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.739461  normal  0.456479 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4537  ABC transporter related  46.19 
 
 
312 aa  201  8e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.67365  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2358  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  41.39 
 
 
395 aa  201  9.999999999999999e-51  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5139  ABC transporter related  46.61 
 
 
317 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.192374  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3224  ABC transporter related  46.61 
 
 
317 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5143  ABC transporter related  46.61 
 
 
317 aa  199  3e-50  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310364  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0351  ABC transporter related  46.19 
 
 
324 aa  199  3.9999999999999996e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0304446  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3624  ABC transporter related  44.49 
 
 
314 aa  199  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2031  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  42.21 
 
 
418 aa  198  6e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.015462  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0297  ABC transporter related  43.15 
 
 
312 aa  198  9e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1681  choline transport ATP-binding protein opuBA  42.11 
 
 
382 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.413883  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1602  choline transport ATP-binding protein opuBA  42.11 
 
 
382 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.844336  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7553  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  44.81 
 
 
391 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.588989 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1848  choline transport ATP-binding protein opuBA  42.11 
 
 
382 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.607667  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1593  choline transport ATP-binding protein opuBA  42.11 
 
 
382 aa  196  2.0000000000000003e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.108629 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0497  ABC proline/glycine betaine transporter, ATPase subunit  44.92 
 
 
312 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.975936  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1661  choline transport ATP-binding protein OpuBA  42.11 
 
 
382 aa  196  3e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.853927  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1276  ABC transporter related  43.83 
 
 
321 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2992  ABC glycine betaine/L-proline transporter, ATPase subunit  44.4 
 
 
400 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1375  ABC transporter related  46.22 
 
 
254 aa  195  6e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2981  ABC transporter related  42.21 
 
 
317 aa  195  6e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4639  ABC transporter related  42.44 
 
 
312 aa  194  8.000000000000001e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.493735  normal  0.263146 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0802  glycine betaine/L-proline transport ATP binding subunit  43.57 
 
 
398 aa  194  8.000000000000001e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.478782 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3696  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit CysA  46.44 
 
 
371 aa  194  9e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3431  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  46.44 
 
 
371 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.405046 
 
 
-
 
NC_004310  BR0223  ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 
312 aa  194  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0214  ABC transporter, ATP-binding protein  43.15 
 
 
312 aa  194  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5180  glycine betaine/L-proline ABC transporter ATPase subunit  42.8 
 
 
392 aa  193  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.860702 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0909  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  44.58 
 
 
335 aa  194  2e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0150426 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1580  amine ABC transporter, ATP-binding protein  45.76 
 
 
312 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1922  glycine betaine transport ATP-binding protein  42.02 
 
 
252 aa  193  3e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1140  ABC transporter, ATP-binding protein  45.76 
 
 
312 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0408912  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2132  ABC transporter, ATP-binding protein  45.76 
 
 
312 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.314823  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0920  amine ABC transporter, ATP-binding protein  45.76 
 
 
312 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0268  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  42.02 
 
 
252 aa  193  3e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2380  ABC transporter, ATP-binding protein  45.76 
 
 
312 aa  193  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.850605  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0118  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  38.33 
 
 
378 aa  193  3e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.435278  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37600  ABC-type proline/glycine betaine transport system, ATPase component  45.02 
 
 
353 aa  192  3e-48  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1993  amine ABC transporter, ATP-binding protein  45.76 
 
 
312 aa  193  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.780492  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0239  amine ABC transporter, ATP-binding protein  45.76 
 
 
312 aa  192  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.46205  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1974  amine ABC transporter, ATP-binding protein  45.76 
 
 
312 aa  192  3e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1201  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  39.58 
 
 
370 aa  193  3e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0537  glycine betaine/L-proline transport, ATP-binding protein  40.66 
 
 
378 aa  192  4e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418471  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1329  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  44.49 
 
 
312 aa  192  5e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.371543  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1126  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  40.87 
 
 
367 aa  192  5e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0488  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  45.58 
 
 
376 aa  192  5e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00399049  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4310  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  42.5 
 
 
385 aa  192  5e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.944105  normal  0.26992 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2863  ABC transporter related  44.49 
 
 
312 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.466149  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2784  quaternary amine ABC transporter ATP-binding protein  44.49 
 
 
312 aa  192  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0868  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  42.5 
 
 
385 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.429182  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0898  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  42.92 
 
 
385 aa  192  6e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.706016  normal  0.516388 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2728  ABC transporter related  42.98 
 
 
316 aa  191  7e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0521  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein  40.66 
 
 
378 aa  191  7e-48  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.691197  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0186  ABC transporter related  37.55 
 
 
256 aa  191  7e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4962  ABC transporter related  43.15 
 
 
328 aa  191  8e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.113653  normal  0.20317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0912  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  42.5 
 
 
385 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.195496 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3265  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  43.51 
 
 
385 aa  191  1e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0149839 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4151  ABC transporter related protein  44.96 
 
 
389 aa  191  1e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4035  sulfate ABC transporter ATPase subunit  44.68 
 
 
338 aa  191  1e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2841  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  45.26 
 
 
346 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0714016  normal  0.325359 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6584  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  43.57 
 
 
392 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00553818  normal  0.0117418 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6102  glycine betaine/L-proline ABC transporter, ATPase subunit  43.57 
 
 
392 aa  191  1e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1620  ABC transporter related  45.87 
 
 
317 aa  190  2e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.290952  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0143  ABC transporter related  41.7 
 
 
314 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0599498 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12425  sulfate-transport ATP-binding protein ABC transporter cysA1  45.22 
 
 
351 aa  189  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00408359  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0745  ABC transporter related  38.49 
 
 
325 aa  189  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>